纳升液相色谱-高分辨串联质谱分析尿液多肽组及其翻译后修饰

多肽组是指生物体表达的所有多肽,尿液等体液的多肽组是生物标记物的重要来源.本研究采用氧化石墨烯-磷酸镧纳米磁性复合材料分离富集尿液多肽,进行纳升液相色谱-高分辨串联质谱分析,从单一样本中鉴定了归属于123个蛋白质的790条肽段.研究表明,这些肽段在蛋白质水平上不是平均分布的.此外,本研究检测到了肽段的氧化、磷酸化和脱氨化等翻译后修饰现象,观察到了尿液多肽的阶梯序列性,从蛋白水平上对尿液多肽组进行了生物信息学分析,结果表明,这些多肽所归属的大部分蛋白质之间存在相互作用.本方法可为在尿液中寻找疾病的标志物提供方法学支持.     

血清多肽组及其个体差异的纳升液相色谱-高分辨串联质谱分析

分析和比较疾病组及健康对照组的混合样品是血清多肽组生物标记物研究的常用方法,但对健康个体多肽组的差异和共性关注较少.本研究利用纳升液相色谱-高分辨四级杆飞行时间质谱鉴定健康人混合血清样品(20例)的多肽组,阐明血清多肽组的分子量分布等一般特征,进而选取6例个体样品单独分析并与混合样品的分析结果进行比较,说明正常健康样品之间的个体差异和共同成分.结果表明,可鉴定序列的血清多肽组的分子量范围在7000 Da以下,纤维蛋白原α链等蛋白质所属肽段的检出频率最高,肽段在蛋白质水平上分布具有不均一性,排在前10％的蛋白质占据了约50％的总肽段,而后40％的蛋白质只有1条检出肽段.此外,在所有样品中都检测到了来自于8个蛋白质的12个共同肽段,检测到了N端乙酰化、氨基酸氧化、磷酸化、脱氨化和脱水等翻译后修饰和明显的阶梯序列现象.本研究在肽段序列水平分析了血清多肽组的基本特征和个体差异,可为血清多肽组生物标志物研究提供参考.     

纳升液相色谱-高分辨串联质谱研究冻存条件对唾液多肽组的影响

唾液多肽组学为疾病相关的生物标记物研究提供了新方法,但冻存条件对分析结果的影响并不清楚。本研究采用氧化石墨烯-磷酸镧纳米复合材料分离富集唾液多肽,利用纳升液相色谱-高分辨串联质谱技术,考察唾液样品分别置于-80℃与-20℃冻存6个月后对唾液多肽组的影响。结果表明,在-80℃冻存条件下的唾液样品中,共鉴定出归属于33种蛋白的429条肽段;在-20℃冻存条件下的唾液样品中,鉴定出595条肽段,对应31种蛋白。实验结果表明,相比于-80℃,唾液置于-20℃条件下的新增加肽段主要来源于已有肽段的降解,并且唾液中的蛋白质也发生了一定降解。本研究在肽段序列水平上考察了冻存条件对多肽的影响,结果表明,-20℃冻存条件不适合长期保存用于多肽组分析的唾液样品。本研究结果可为相关医学研究提供借鉴。     

超滤法结合纳升液相色谱-串联质谱技术分析漏出性胸腔积液中多肽组分

漏出性胸腔积液中的多肽和蛋白质等生物分子直接或间接地与机体特定的生理、病理状态相关,反映了肺部或者全身其它部位疾病的信息.本研究利用超滤法将漏出性胸腔积液中的多肽组分进行分离,经脱盐富集后,进行纳升液相色谱-串联质谱分析.结果表明,在漏出性胸腔积液中共鉴定到来源于52种蛋白的314条多肽,超过一半的肽段来源于纤维蛋白原,并且许多肽段具有阶梯序列的特征.此外,在来源于胶原蛋白和纤维蛋白原的多肽中还发现了大量的脯氨酸氧化修饰.基因本体论富集分析显示,漏出性胸腔积液多肽组分所属蛋白均具有胞外分泌的属性.本研究给出了漏出性胸腔积液中多肽组的序列、等电点、分子量、翻译后修饰等理化参数的分布特征,为进一步寻找肺部疾病相关的多肽标志物提供了可借鉴的参考数据和分析方法.     

基于超高效液相色谱-高分辨质谱的多肽组学技术用于人参不同部位多肽的差异分析

采用基于超高效液相色谱-高分辨质谱的多肽组学技术对人参主根、支根、须根和芦头的多肽谱进行全面分析,旨在评价人参不同形态区域多肽表达的异同。本研究共表征62个数据库中已收录的人参多肽。结果表明,人参不同部位均富含多肽类成分。多肽组学研究发现,人参主根和支根、芦头与须根之间多肽含量具有显著差异,从鉴定到的多肽中共发现25个稳定表达的已知潜在多肽标志物。其中多肽种类及含量在主根与其他部位间差异最显著,为主根与非主根药效差异研究提供了新思路。本研究揭示了人参多肽结构多样性及人参不同部位人参多肽表达的异同,对人参化学特征评价具有重要意义,为人参质量控制和合理应用提供了化学依据。     

基于气相色谱-飞行时间质谱技术的佐剂性关节炎大鼠尿液代谢组学的研究

采用弗氏完全佐剂(FCA)诱导佐剂性关节炎(AA)大鼠模型,观察大鼠足趾肿胀度和踝关节组织的病理学形态变化。应用气相色谱-飞行时间质谱(GC-TOF MS)技术检测AA大鼠尿液代谢物谱,并对数据进行主成分分析(PCA)、偏最小二乘法-判别分析(PLS-DA)及正交偏最小二乘法-判别分析(OPLS-DA),探讨可能的发病机制。通过变量重要性投影值(VIP>1)和P值(<0.05),筛选出尿液中的差异代谢物。在模型组大鼠的尿液中共发现异柠檬酸、α-酮戊二酸、柠康酸、肌酸、3-羟基丁酸等20种差异代谢物。推断AA代谢组学的发病机制可能与能量代谢、氨基酸代谢、脂肪酸代谢途径有关。     

尿液多肽组的时间可变性和相对稳定性研究

尿液多肽组可反映机体的病理变化,提供潜在的生物标志物信息.目前,尿液多肽组研究通常采用晨尿,其成份是否随采样时间变化尚不清楚.本研究采集了3个健康志愿者的不同时间点的尿液,经氧化石墨烯-磷酸镧纳米复合材料(LaGM)方法分离后,利用LC-MS/MS进行序列鉴定.发现在不同取样时间下,自同一个人的尿液多肽组成分存在差异,...     

液相色谱的故障排除——重现性问题

对于液相色谱中出现的系统适配性问题、峰面积重现性问题和高压问题等进行了详细分析,并给出了令人满意的解决办法。     

基于超高效液相色谱-高分辨质谱和渗透压校正样本浓度变异性的尿液代谢组学分析

尿液是代谢组学研究中主要关注的体液样本之一。尿液样本中的代谢物浓度受饮食、疾病等因素影响变异较大,这极大阻碍了高质量组学数据的获取和可靠生物标志物的鉴定。研究为克服尿液样本的浓度变异性,在原始数据采集前,根据样本渗透压的大小,针对性地调整进样量或者稀释样本,从而确保代谢组学分析样本的渗透压与进样量的乘积相当,再经超高效液相色谱-高分辨质谱技术(UPLC-HRMS)分析,采用总离子丰度或总有用峰面积(MSTUS)对数据集进行归一化处理。研究利用临床样本及其梯度稀释的溶液,对该方法与现有研究普遍使用的方法进行了比较,随后通过先天性肾积水患者及健康志愿者的尿液样本做了进一步的方法学验证。数据集经校正后,峰面积RSD<30%的提取峰数量增加,主成分分析结果较校正前有更高的组内聚集和组间分群效应,正交偏最小二乘判别分析的统计模型更不易过拟合。与肌酐比较,渗透压值与质谱信号间呈现了更好的线性关系。以上结果表明,数据采集前通过样本渗透压进行校正,能有效消除因样本本身代谢物浓度变化引起的组内差异,提高方法的重复性和统计模型的可靠度。以渗透压为基准的校正策略,比肌酐校正法适用范围更广,结果也更准确。研究可对后续各类来源的尿液代谢组学研究提供数据归一化的指导和参考。     

基于液相色谱-质谱技术的代谢组学分析方法新进展

液相色谱-质谱联用技术是代谢组学研究领域的主要技术平台之一,近年来基于液相色谱-质谱联用技术的代谢组学分析方法获得了巨大发展。本文结合本研究组在代谢组学方面的研究成果,综述了近年来液相色谱-质谱联用技术在代谢组学分析方法方面的新进展,并对其发展前景进行了展望。综述引用文献41篇。     

长链溴代氟碳烃的色-质谱分析

本文给出了50余种C_nF_mH_1Br_x的色谱相对保留时间和质谱数据。还给出了热导检测器上Br(CF_2)_nBr的峰面积的相对响应值和一些化合物的质谱总离子流大小的相对响应值。     

原子吸收及紫外分光光度法再现性与浓度的一个新型关系式

本文提出了紫外及原子吸收分光光度法中再现性与浓度的一个新型关系式。以实验和文献数据对该式进行了验证,结果表明,该式对实验数据的拟合明显优于文献的关系式,并对该式各参数的意义进行了探讨。     

表面活性剂的液相色谱质谱联用分析

表面活性剂(surfactant)是指具有固定的亲水亲油基团,能在溶液表面定向排列,并能使表面张力显著下降的物质,其广泛应用于工业生产的各个领域,因此,表面活性剂的分析尤为重要.     

邻硝基氯苯异构体成分的GC/MS分析

本文采用GC／MS分析邻硝基氯苯异构体成分，对样品前处理、溶剂及色谱条件、质谱条件、组分定量作了探讨，分析结果满意。该法无需标样，具有准确、简便、快速的特点。     

液相色谱-串联质谱法测定尿液中7种有机磷酸酯代谢物

利用液相色谱-三重四极杆质谱(LC-MS/MS)联用技术,建立了人尿液中7种有机磷酸酯代谢产物-有机磷酸二酯的检测方法.针对不同理化性质的有机磷酸二酯,采用固相萃取技术进行富集净化,筛选出高效的固相萃取柱,并对其洗脱条件进行优化;同时,对流动相和质谱参数进行优化,获取用于各代谢产物定性与定量分析的特征离子对.研究结果表明,前处理采用Oasis WAX固相萃取柱富集、2 mL含5%氨水的甲醇和2 mL甲醇洗脱目标物,除磷酸二乙酯(DEP,17.8%~36.2%)外,其余目标化合物回收率均在60.5%~104.0%之间.在优化的液相色谱条件下,7种化合物可达到完全基线分离.7种有机磷酸二酯的检测限和定量限分别在0.005~0.2μg/L和0.02~0.5μg/L之间,日内和日间精密度结果(RSD≤15.4%)表明,本方法具有较好的稳定性和重现性.本方法用于普通人群尿液中有机磷酸二酯的检测,7种化合物在尿液中均有检出,总浓度在0.5~6.7μg/L之间.     

Reproducibility of Florida weathering data

We have investigated the consistency and reproducibility of Florida outdoor weathering data for aromatic engineering thermoplastics. Weather and broadband (295–385 nm) UV dose data for the 14-year period from 1989 to 2002 show that considerable variability is expected for exposures with duration < 1 year, but that standard deviations for UV exposure and temperature are approximately 7% of the mean at 1 year and <5% at 2 years and greater. Only rainfall shows significant long-term variability. Weathering data on pigmented aromatic engineering thermoplastics were consistent with these expectations. Overall trends and rates of color and gloss shifts were generally reproduced for samples exposed at different times. Color shift data were generally reproducible within a ΔE of 2 and 60° gloss loss within 10 units for samples beginning exposure 6 months apart. However, very large differences in absolute values for properties can occur for data taken near periods of rapid change, especially for gloss loss. Surprisingly, considering the data as a function of broadband UV dose rather than exposure time did not seem to reduce scatter. This emphasizes the problem of comparing results between data sets for exposure times < 1 year. We conclude that Florida data do provide a useful benchmark when rates and general trends are compared, but not for absolute values at arbitrary times.     

Identification of Abnormal Urinary Organic Acids in Inherited Metabolic Diseases by Gas Chromatography-Mass Spectrometry

A gas chromatography/mass spectrometry (GC/MS) coupled system has been established for the confirmatory identification of abnormal urinary organic acids in inherited metabolic diseases. Samples of patient urines were extracted with an organic solvent and trimethylsilylated (TMS). A mass spectra of gas chromatographically separated TMS derivatives can be obtained using the GC/MS coupled system with a single analytical run. Those compounds with close methylene units (e.g., 4-hydroxyphenylacetaic acid and phenylpyruvic acid) in the gas chromatograph can be identified by their specific mass spectra. The results indicate that this GC/MS system is a powerful method for identifying abnormal urinary organic acids. These acids can be identified by comparison with authentic mass spectra established in our laboratories or with mass spectra files from other sources or they can be directly identified by analysis of the mass spectrum. By using this system, we were able to make positive identification of several inherited metabolic diseases found in Chinese patients, including phenylketonuria, propionic acidemia, and methylmalonic aciduria. This GC/MS system is a powerful tool for the diagnosis of inherited metabolic diseases.     

胶束电动力学毛细管色谱法测定尿中核苷

用胶束电动力学毛细管色谱法测定尿中核苷.通过苯基硼酸亲和色谱柱对尿中核苷进行纯化,以十二烷基磺酸钠(SDS)-十水合四硼酸钠-磷酸二氢钠为缓冲液(pH=6.96),在未涂层石英毛细管上,于7kV恒压,29℃下进行电泳分离,检测波长为254nm.此方法用于28个正常人尿中14种核苷的测定,确定了正常成年人(汉族)尿中核苷的排放范围.     

Analysis of Pseudouridine by Fluorescence Spectrometry

Abstract

Fluorescence spectral properties of pseudouridine, an important biological indicator, have been measured for the first time in this study. The fluorescence quantum yield is maximal in aqueous solution with pH values above 9 with spectral properties characteristic of 5 alkyl substituted uracil derivatives. Chromatographic analysis shows the fluorescence is associated only with the pseudouridine peak. The concentration dependence of fluorescence is linear from 4 to 45 micromolar at pH 11.5. The excitation maximum is about 295 nm and the emission is broad with a maximum at about 390 nm. Addition of pseudouridine to urine extracts gives a linear increase in fluorescence with increasing pseudouridine concentration.     

气相色谱/质谱分析烟草中的主要生物碱

用毛细管气相色谱法测定烟草中烟碱、降烟碱、麦斯明、二烯烟碱、新烟碱、去氢新烟碱、2,3′-联二吡啶、可替宁8种主要生物碱的方法。烟草样品经二氯甲烷/甲醇(V/V,3∶1)萃取,过一次性滤膜,进样,经DB-5MS毛细管柱分离,由气相色谱-氢火焰离子化检测器(FID)检测定量,质谱定性。该方法操作简单,重现性好,回收率较高。8种生物碱相对标准偏差为2.59%~7.07%;回收率为89.4%~98.7%。