胰蛋白酶溶液的激光拉曼谱

本文报道了用硝基苯萃取处理前后的胰蛋白酶溶液的拉曼光谱。通过分析酰胺Ⅰ和酰胺Ⅲ的拉曼特征频率，初步推断出该胰蛋白酶是含有α－螺旋、β－折叠和无规卷曲结构。同时对其侧链结构也做了初步分析     

肺正常组织与癌变组织的表面增强拉曼光谱

采用共焦显微拉曼光谱进行肺正常组织与癌变组织的表面增强拉曼光谱测试,拉曼位移测试范围为300～1700cm-1 。根据得到的肺正常和癌变组织的表面增强拉曼光谱,对比分析了两者的特点与差异。选取蛋白质主链构象中构象不灵敏的CH₂弯曲振动在1454cm-1的谱线为内标,发现相比肺正常组织,癌变组织蛋白质主链中酰胺Ⅲ和酰胺Ⅰ谱带的有序构象明显减少,对α螺旋和无规则卷曲的损伤比较严重,β回折几乎消失,而骨架C—N,C—C伸缩振动却出现了与前2个谱带截然相反的状况,有序构象显著增加,蛋白质侧链构象变化与主链相比则相对复杂;DNA的骨架磷酸基团、脱氧核糖、磷酸-脱氧核糖和碱基的含量总体呈增加趋势;RNA的情况与DNA类似;磷脂的链内纵向有序性参数明显下降。     

紫外辐射对牛血清白蛋白影响的拉曼光谱分析

检测了牛血清白蛋白粉末和水溶液及其经过40min、3h、5h和8h紫外辐射的拉曼光谱图。实验结果表明紫外辐射改变了牛血清白蛋白中硫硫键的几何构型,40min的紫外辐射使牛血清白蛋白粉末中一半以上的硫硫键由“扭式-扭式-扭式”构型变成了“反式-扭式-扭式”构型,经过3h和5h的紫外辐射,从拉曼谱图上已看不到表征硫硫键几何构型的谱峰。40min和3h的紫外辐射使牛血清白蛋白水溶液中部分硫硫键由“扭式-扭式-扭式”构型变成了“反式-扭式-扭式”构型,但当紫外辐射时间长达5h时,硫硫键又只有“扭式-扭式-扭式”一种构型。经过紫外辐射,牛血清白蛋白粉末中酪氨酸残基有由“暴露”式向“埋藏”式转变的趋势;水溶液中一部分酪氨酸残基经紫外辐射后由“暴露”式变成了“埋藏”式。紫外辐射对粉末状态牛血清白蛋白主链构象影响要比溶液状态大。     

糖尿病人血清的表面增强拉曼光谱

研究了糖尿病人和正常人血清的表面增强拉曼光谱。糖尿病人血清中蛋白质主链酰胺Ⅱ的C—N伸缩振动的谱线位移到1 585 cm-1,相对强度增加了14%,酰胺Ⅵ的谱线593 cm-1相对强度减少了33%。蛋白质侧链色氨酸吲哚环 “埋藏式”的谱线1 368 cm-1位移到“暴露式”的1 365 cm-1,且相对强度减少了59%;侧链C—S键的扭曲构象的谱线635 cm-1相对强度减少了15%,而反式构象的谱线725 cm-1增加了58%, 说明C—S键的扭曲构象部分转变为反式构象,表明糖尿病人血清中蛋白质的有序结构发生变化;类脂物特征峰1 449 cm-1相对强度增加了58%,与糖类有关的特征峰谱线1 331,1 099和740 cm-1相对强度分别增加了35%,100％和62%, 从而表明糖尿病人血清中与脂类和糖蛋白有关的物质含量增加。上述拉曼特征峰为糖尿病的诊断以及生化机理研究提供了有力的实验依据。     

癸胺盐酸盐晶体相变的拉曼光谱研究

在290—340K温度范围内,考察了标题化合物分子链的C—H和C—C伸缩振动等主要拉曼散射谱带频率和强度随温度的变化。结果表明,癸胺盐酸盐晶体在313K和321K发生两次结构相变。在低于313K时,分子链以完全有序的全反式构象存在;在313K以上时,分子链出现了旁式构象。高于321K时,随着旁式链构象的骤增,分子链的侧向填充有序度明显降低,链的“流动性”明显增强。     

[去-组氨酸~(35),去-甘氨酸~(40)]大鼠转化生长因子-α(34—43)的拉曼光谱

报导了粉末状结晶[des His~(35),des Gly~(40)]γ-TGF-α(34—43)的拉曼光谱。酰胺Ⅰ振动谱带在1669cm~(-1),酰胺Ⅲ振动谱带在1337、1262和1242 cm~(-1),硫—硫键的振动谱带在504cm~(-1),酪氨酸残基的特征谱带在847、830和642 cm~(-1)。它们定性地证明了肽链可能由β-回转和β-折叠织成,酪氨酸残基在肽链中呈全“暴露”式,硫—硫键部位的几何构型为扭式-扭式-扭式。据此提出了该肽链的结构模型。     

环丁醇温致相变的原位拉曼光谱研究

采用拉曼光谱和红外光谱解析了常温条件下环丁醇的各个振动模式及其与分子构象间的关联,结果表明液态环丁醇以赤道–反式构象为主,并含有少量的赤道间扭式构象。在此基础上结合差示扫描量热技术和变温拉曼光谱,原位研究了环丁醇的温致相变过程和分子构象随温度的变化。结果表明,冷却至140 K的过程中,环丁醇并未结晶固化,而是保持亚稳定的无序液体状态,即出现过冷现象,继续降温至138 K出现玻璃化转变。升温过程中,在170 K时出现放热峰,同时有新的拉曼峰出现,并且拉曼峰的半高宽和强度发生明显的突变,表明环丁醇由无序结构转变为有序的结晶相。因此,我们获得了环丁醇的温致相变序列： 液态→过冷液体→玻璃态→结晶态→液态。通过对环丁醇不同分子构象的拉曼特征峰的定量分析,证实环丁醇在降温过程中,反式构象和间扭式构象的比例未发生明显改变,即没有发生构象变化。然而升温时,伴随170 K时结晶态的转变,反式构象特征峰的相对强度减小,表明部分分子由赤道–反式构象转变为赤道–间扭式构象。该研究结果对进一步理解和研究其他有机小分子的温致相变和构象变化具有指导意义。     

牛血清白蛋白水溶液的紫外吸收光谱和激光喇曼光谱分析

本文报道了用硝基苯萃取法测定的ＢＳＡ水溶液的激光喇曼谱和萃取前后测定的紫外吸收谱。从谱中对照验证了水溶液中ＢＳＡ多肽链可能由α－螺旋和无规则卷曲组成，酪氨酸残基在蛋白质分子中呈全“暴露“式，硫－硫键部位的几何构型为反式－扭式－扭式。     

皮疹病人血清的表面增强拉曼光谱

研究了皮疹患者和健康人血清的表面增强拉曼光谱。结果表明： 皮疹患者血清中蛋白质主链酰胺Ⅰ的谱线出现在1 648 cm-1处,而在健康人血清中此峰消失。蛋白质侧链C—S键扭曲构象的谱线637 cm-1的相对强度增加了23%,而反式构象的谱线725 cm-1的相对强度减少了60%,说明C—S键的反式构象部分转成扭曲构象,表明皮疹患者血清中蛋白质的有序结构发生变化。类脂物特征峰1 449 cm-1的相对强度增加了近一倍,D-甘露糖的谱线1 099 cm-1消失,表明患者血清中糖蛋白、糖质发生了变化。这些拉曼特征峰为皮疹的诊断以及生化机理研究提供了有力的实验依据。最后用主成分分析(PCA)方法对健康人和皮疹患者血清的表面增强拉曼光谱进行分析,发现皮疹患者血清的主成分分布相对健康人较分散,并且此方法能准确的区分开这２种血清。     

重组人B淋巴细胞刺激因子的激光拉曼光谱

人B淋巴细胞刺激因子(BAFF)是一种由285个氨基酸组成的Ⅱ型跨膜蛋白质,我们测试了重组的人B淋巴细胞刺激因子(r-BAFF)固体粉末和水溶液的拉曼光谱,通过分析酰胺Ⅰ和酰胺Ⅲ的拉曼特征谱带,判断出重组的人B淋巴细胞刺激因子(r-BAFF)固体粉末状态下构象全为β-折叠结构和β-回转结构,而在水溶液中的二级结构主要仍为β-折叠结构和β-回转结构,另外可能有少量的α-螺旋结构。同时对其侧链构象及环境也做了初步分析。     

The effect of nitrobenzene on the Raman spectra of ribonuclease in aqueous solution

The Raman spectra of the native ribonuclease treated with nitrobenzene in aqueous solution have been obtianed. The conformation of the main chain and the side chain in ribonuclease were studied. Among the amide Ⅰ and amide Ⅲ bands, the characters of β-sheet and random coil structures are clear. The disulfide bridges assume the gauche-gauche-gauche conformation. The parts of tyrosine residue are buried. It indicates that nitrobenzene treatment on protein aqueous solution is an efficient means for obtaining better Raman spectra.     

胰蛋白酶溶液的激光拉曼谱

胰蛋白酶溶液的激光拉曼谱柯惟中，余多慰（南京师范大学南京２１００９７）ＲａｍａｎＳｐｅｃｔｒａｏｆＴｒｙｐｓｉｎｉｎＡｑｕｅｏｕｓＳｏｌｕｔｉｏｎ￥ＫｅＷｅｉｚｈｏｎｇａｎｄＹｕＤｕｏｗｅｉ（ＮａｎｊｉｎｇＮｏｒｍａｌＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙＮａｊｉｎｇ...     

牛血清白蛋白水溶液的激光喇曼谱

本文报道了用硝基苯萃取法获得的牛血清白蛋白水溶液的喇曼光谱.定性地证明了该蛋白质多肽链可能由α-螺旋和无规则卷曲组成,酪氨酸残基在肽链中呈全“暴露”式,硫-硫键部位的几何构型为反式-扭式-扭式.     

Infrared studies of chain folding in polymers. X. polycaprolactam

The 1210-, 1233-, and 1288—cm^?1 infrared bands in the α form of nylon 6 are shown to result from a unique conformation in a tightly folded chain with adjacent reentry. The assignment of the 1210- and 1288-cm^?1 bands to motions of a gauche nitrogen-methylene group in the fold and the 1233-cm^?1 band to motions of a gauche carboxyl-methylene group in the fold is supported by the infrared studies of the α form of nylon 6, the γ form of nylon 6, poly-D(-)β-methyl- ? -caproamide (PBCA), and the high- and low-temperature forms of the cyclic dimer of nylon 6. The γ- form of nylon 6 and PBCA do not exhibit a unique conformation in the fold. The 1198-cm^?1 band can be assigned to the trans conformation of the amide group which exists in the normal planar zigzag conformation in the α-form crystal. A mechanism for the α to γ iodine-induced transition in nylon 6 is proposed showing the role of the fold in maintaining a minimum of molecular disordering during the transformation.     

半胱胺单分子膜结构的表面增强拉曼散射研究(英文)

在金属电极表面所形成的有机分子的单分子膜或薄膜对于基础研究和实际应用都有着极其重要的意义。以化学吸附形式在金电极表面所形成的半胱胺单分子膜,常常用于蛋白质等生物大分子在金属表面进行吸附的连接层,以避免这些生物大分子在金属表面直接吸附而造成的变性、失活现象的发生。本文报道了我们采用表面增强拉曼散射光谱方法研究在金电极表面吸附的半胱胺单分子膜的结构特征。研究结果表明,在金电极表面所形成的半胱胺单分子膜中,半胱胺分子主要的构型为扭转构型。在与金表面的相互作用中,由于除巯基的结合作用以外,还存在半胱胺分子中端基氨基和金表面较强的亲和性,使得以扭转构型吸附在金表面的半胱胺单分子膜相当稳定。这是金电极表面的半胱胺单分子膜结构的主要行征。当考察外加电势对此单分子膜结构的影响时,可以发现有关扭转构型的特征谱峰其相对强度随着电位负移而减小。这一结构随电位的变化关系可以通过表面电势的变化对氨基氮原子上孤对电子与金属表面间相互作用的影响来加以阐释。     

Vibrational spectroscopic studies of the structure of di‐amino acid peptides. Part II: cyclo(L‐Asp‐L‐Asp) in the solid state and in aqueous solution

Solid‐state protonated and N,O‐deuterated Fourier transform infrared (IR) and Raman scattering spectra together with the protonated and deuterated Raman spectra in aqueous solution of the cyclic di‐amino acid peptide cyclo(L ‐Asp‐L ‐Asp) are reported. Vibrational band assignments have been made on the basis of comparisons with previously cited literature values for diketopiperazine (DKP) derivatives and normal coordinate analyses for both the protonated and deuterated species based upon DFT calculations at the B3‐LYP/cc‐pVDZ level of the isolated molecule in the gas phase. The calculated minimum energy structure for cyclo(L ‐Asp‐L ‐Asp), assuming C₂ symmetry, predicts a boat conformation for the DKP ring with both the two L ‐aspartyl side chains being folded slightly above the ring. The CO stretching vibrations have been assigned for the side‐chain carboxylic acid group (e.g. at 1693 and 1670 cm⁻¹ in the Raman spectrum) and the cis amide I bands (e.g. at 1660 cm⁻¹ in the Raman spectrum). The presence of two bands for the carboxylic acid CO stretching modes in the solid‐state Raman spectrum can be accounted for by factor group splitting of the two nonequivalent molecules in a crystallographic unit cell. The cis amide II band is observed at 1489 cm⁻¹ in the solid‐state Raman spectrum, which is in agreement with results for cyclic di‐amino acid peptide molecules examined previously in the solid state, where the DKP ring adopts a boat conformation. Additionally, it also appears that as the molecular mass of the substituent on the C^α atom is increased, the amide II band wavenumber decreases to below 1500 cm⁻¹; this may be a consequence of increased strain on the DKP ring. The cis amide II Raman band is characterized by its relatively small deuterium shift (29 cm⁻¹), which indicates that this band has a smaller N H bending contribution than the trans amide II vibrational band observed for linear peptides. Copyright © 2009 John Wiley & Sons, Ltd.     

几种消除蛋白质分子荧光方法的比较

对高荧光产率的蛋白质分子,用几种方法进行荧光猝灭实验以获取拉曼信号。如变换激发激光波长、以小功率激光长时间照射样品、以较大功率激光照射样品、表面增强拉曼散射及硝基苯萃取法,对此做了比较研究,发现消除牛血清白蛋白水溶液样品荧光的最佳方法是硝基苯萃取法,并给出由此得到的激光拉曼谱。