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循环子空间回归为喹喏酮N1位构效关系建模 总被引:2,自引:0,他引:2
拟从线性泛函的角度分析循环子空间回归(CSR).CSR方法将从自变量参数矩阵和因变量向量中提取成分,循环地构造并扩张Krylov子空间,且以此作为源空间,运用最小二乘准则解得映射到因变量实空间的线性泛函.整个求解过程包容了最小二乘回归(LSR)、主成分回归(PCR)、偏最小二乘回归(PLS)以及其它中间的回归方法.然后由预报能力的强弱,从中确定最佳回归模型.本文应用CSR方法为喹喏酮N1位抗菌构效关系建模,效果良好. 相似文献
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5,7,8位取代的喹诺酮类化合物定量构效关系的量子化学研究 总被引:2,自引:0,他引:2
5,7,8位取代的喹诺酮类化合物定量构效关系的量子化学研究俞庆森,朱龙观,林瑞森,蔡国强(浙江大学化学系杭州310027)关键词:氟喹喏酮类,定量构效关系,CNDO/2氟喹诺酮类是一类重要的抗感染化疗药物 ̄[1],近十年对其研究进展神速 ̄[2],结构... 相似文献
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优化的径向基-循环子空间网络为药物定量构效关系建模 总被引:3,自引:0,他引:3
径向基.循环子空间回归(RBF-CSR)网络,保留了径向基-偏最小二乘(RBF—PLS)网络的优点,且可在更广的范围内选择最优模型,但仍存在着参数难以确定,计算量大等问题。对此,本研究兼顾网络模型的拟合与预测性能,采用具有高效全局搜优能力的优进遗传算法(EGA)优化网络参数,构建为EGA-RBF-CSR方法,并将其成功应用于苯乙酰胺类除草剂的构效关系(QSAR)建模,效果良好,显示出很强的学习能力,所建模型具有良好的预报性能和稳定性,并优于其他方法。 相似文献
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喹诺酮类N1位定量构效关系研究 总被引:4,自引:1,他引:4
氟隆诺酮类化合物是抗菌药中的重要一类,由于它的许多突出特点,已引起越来越多的研究者的关注山.这类化合物骨架见图1.我们对该类化合物进行过一些研究[’‘l自发现诺氟沙星*以后,几位取代基在寻找高效、广谱峻诺酮类化合物方面起重要作用,但在发现环丙基(1983年)、特丁基(1989年)以后,一直未发现新的有意义的取代基·在NI位定性与定星构效关系的研究中有二种观点:(1)古贺弘等k’]提出的由立体效应决定的观点;(z)Domagala[71、Chu问等主张的立体与电子效应共同起作用的观点·3D-QSAR研究中的比较分子力场分析(Co… 相似文献
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选择岭回归参数k值的改进方法及其在农药定量构效关系中的应用 总被引:5,自引:2,他引:3
提出改进的预报相对误差法选择岭回归参数k,以平均预报相对误差替代预报残差平方和,并抑制过拟合。该方法应用于苯乙酰胺类除草农药定量构效关系的二次建模,效果良好,预报精度优于残差平方和方法。 相似文献
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利用氨基酸结构描述符SVHEHS分别对血管紧张素转化酶(Angiotensin I-converting Enzyme,ACE)竞争性抑制二肽、三肽、四肽序列表征后,建立结构与活性的多元线性回归(MLR)模型。ACE抑制二肽模型的相关系数、交叉验证相关系数、均方根误差、外部验证相关系数分别为0.851、0.781、0.327、0.792;三肽模型分别为0.805、0.717、0.339、0.817;四肽模型分别为0.792、0.553、0.393、0.630。研究表明,运用该描述符建立的ACE抑制肽MLR模型拟合、预测能力均较好,能较好解释ACE抑制肽的活性与结构间的关系。 相似文献
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用比较力场分析研究了N-亚硝基化合物的结构与致癌活性的关系,考察了网络结构和探针原子对结果的影响.结果表明,立体效应和静电作用场是描述其致癌活性和进行结构性能关系研究的最重要的结构参数。 相似文献
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1-取代-7-3-[(乙氨基)甲基]-1-吡咯基喹诺酮N1位定量构效关系 总被引:1,自引:0,他引:1
喹诺酮类抗菌药物因其具有广谱、低毒以及口服吸收良好等特点而受到越来越多的关注.对N1位的构效关系曾有研究报道,但其建立的定量构效关系式相关性较差.为了对N1位的构效关系有更深入的认识,本文以取代基的表面积和分子体积为参数. 相似文献
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基于遗传算法的神经网络为苯乙酰胺类农药构效关系建模的研究 总被引:8,自引:0,他引:8
探讨用遗传算法训练神经网络,为苯乙酰胺类化合物的QSAR建模,效果良好,神经网络可以反映复杂的构效关系,而引入遗传算法又有助于多层前传网在训练过程中跳出局部最小点,使收敛速度大大提高,并在预报精度上有显著改善. 相似文献
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设计合成了一系列未见文献报道的4-乙氧羰基-1,7-二氢-1-取代苯基-5-(未)取代吡唑啉[5,1-d][1,2,3,5]四嗪-7-酮衍生物, 其结构均经过1H NMR、IR和元素分析表征. 生测结果显示, 与已报道的化合物相比, 它们表现出较好的除草活性. 定量的结构与活性关系研究表明, 它们的除草活性与取代基的立体效应参数和疏水性参数呈现很好的相关性, 相关系数r大于0.8. 当作用对象为油菜时, 化合物的活性可能主要与取代基R1的摩尔分子折射和取代基R2的疏水性参数有关. 当取代基R1的摩尔分子折射参数为1.452时, 相应化合物可能具有对油菜最高的除草活性; 当作用对象为稗草时, 化合物的活性主要与取代基R2疏水性参数和Taft (Es)参数有关. 相似文献
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利用遗传算法,并结合线性回归和交叉验证方法,对一系列43个苯并呋喃/噻吩联二苯类PTP1B抑制剂作了二维定量构效关系的研究.计算得到了一组效果较好的定量构效关系模型.模型不仅具有好的回归能力,而且还具有很好的预测能力.同时,通过分析在遗传优化过程中参数在精华种群中所占的比例,还得到了可能对活性影响较大的成分.计算结果表明,分子的4个参数:lgP(分配系数)、Area(表面积)、MW(分子量)以及Dip(偶极距)是影响化合物活性的最重要的参数,这对抑制剂的设计和改造提供了指导. 相似文献
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1,2-萘醌类化合物抑制PTP1B的三维定量构效关系研究 总被引:1,自引:1,他引:0
蛋白酪氨酸磷酸酶1B (protein tyrosine phosphatase 1B, PTP-1B)是近年来发现的治疗II型糖尿病的新靶点, 1,2-萘醌类化合物对PTP-1B有较好的抑制活性, 具有良好的药用前景. 为了设计出本类化合物抑制效果更好的分子构型, 用比较分子力场分析(CoMFA)和比较分子相似性指数分析(CoMSIA)对该类化合物进行了三维定量构效关系(3D-QSAR)的研究, 并建立了相关的预测模型. 其中, CoMFA模型的交叉验证相关系数(q2)为0.555, 非交叉验证相关系数(r2)为0.991, 标准偏差(SEE)为0.049, F值为564.910. CoMSIA模型的q2为0.558, r2为0.991, SEE为0.050, F值为542.773. 计算结果表明, 获得的CoMFA和CoMSIA模型具有良好的预测能力, 可以应用于指导该类化合物的设计. 相似文献
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C-5修饰的3-碘-4-芳氧基/芳硫基吡啶酮(IOPY/ISPY)类化合物是一类潜在的HIV-1非核苷类逆转录酶抑制剂, 特别是这类化合物因具有同时抑制野生型和突变型病毒株的特性, 而受到更加广泛的关注. 首先利用两套2D通用描述符同时构建了该类化合物的线性和非线性定量构效关系模型. 结果表明这些模型都具有较好的预测能力, 并且非线性模型较线性模型预测能力更好些. 为了更好、更形象地描述逆转录酶抑制剂的特征, 进一步结合三维定量构效关系(3D-QSAR)模型, 以及SAReport分析对该类化合物同时抑制野生型和突变型病毒株的结构特征进行了分析, 发现在对这类化合物进行结构修饰时, 需要服从如下三条理论指导原则: (1) R基团中的正负电场分布情况对化合物的活性起着关键作用|(2) R基团最好具有芳香环或芳香杂环和(3) R基团的环结构上连接的取代基不宜太多. 相似文献