肾透明细胞癌组织S-棕榈酰化修饰蛋白质组的分析

肾透明细胞癌中介导蛋白质棕榈酰化修饰的蛋白酰基转移酶表达异常,提示肾透明细胞癌可能存在蛋白质棕榈酰化修饰异常改变,并与肿瘤代谢紊乱或致癌信号通路的激活密切相关.本研究采用优化的酰基-生物素置换法(Acyl-biotinyl exchange,ABE),结合蛋白质组学技术,对肾透明细胞癌组织中S-棕榈酰化修饰蛋白进行全面...     

大肠癌组织棕榈酰化修饰蛋白的组学分析

蛋白质棕榈酰化修饰在大肠癌的发生、发展和转移等过程中发挥了重要作用。本研究采用改进的酰基-生物素交换方法(Acyl-biotinyl exchange, ABE),对大肠癌组织中的棕榈酰化修饰蛋白进行富集,并利用蛋白质组学技术对富集的蛋白进行分析鉴定。结果共鉴定出213种高可信度(+HA/-HA>3)的棕榈酰化修饰蛋白,包括烯醇化酶1、过氧化物氧化还原酶、波形蛋白、线粒体苹果酸脱氢酶、核异质性核糖核蛋白K、分子伴侣复合体蛋白1等,并以烯醇化酶1棕榈酰化修饰为例,采用蛋白质印迹技术对其进行了验证。本研究对经典的ABE方法进行了改进,降低了非特异性背景信号,大肠癌癌组织中的棕榈酰化修饰蛋白的鉴定分析结果可为进一步研究特定肿瘤相关蛋白分子的棕榈酰化修饰调控的分子机制、精准发现大肠癌肿瘤标志物或分子靶点提供新思路。     

蛋白质棕榈酰化修饰的分析方法进展

棕榈酰化修饰是蛋白质翻译后脂质修饰的重要形式之一,在细胞信号传导、代谢、凋亡、疾病的发生、发展等过程中都起着重要的作用。因此,定性和定量分析蛋白质棕榈酰化修饰对理解其生物学功能具有重要意义。本文综述了近年出现的蛋白质棕榈酰化修饰分析技术和方法及其优缺点,并对其未来的发展趋势进行了展望。     

液相色谱-质谱联用分析流感病毒感染引起宿主蛋白类泛素化修饰

干扰素刺激基因15编码蛋白质(Interferon stimulated gene 15 kDa protein, ISG15)是最早被鉴定的类泛素分子蛋白质,在病毒感染和免疫调节等方面具有重要作用。本研究利用免疫沉淀技术将被类泛素 ISG15修饰的蛋白富集纯化,采用液相色谱-质谱联用技术对流感病毒感染 A549宿主细胞过程中产生的类泛素 ISG15修饰蛋白进行了分析。实验结果表明,在流感病毒感染的实验组 A549细胞中,鉴定到了22种来源于宿主细胞的ISG15修饰的蛋白,包括类泛素蛋白 ISG15、细胞周期蛋白-T1、热休克蛋白71、钙调素结合蛋白、真核翻译起始因子等,以及1种来源于流感病毒的非结构蛋白 NS1。在鉴定的22种宿主蛋白中,有6种蛋白在未感染病毒的对照组 A549细胞中也得到鉴定,包括膜联蛋白 A1、果糖二磷酸醛缩酶 A、线粒体三磷酸腺苷合成酶亚基 g、烯醇化酶、肌动蛋白、微管蛋白。生物信息学分析表明,流感病毒感染引起的 ISG15修饰的宿主蛋白分别归属于9个不同的蛋白分类,包括细胞骨架蛋白、分子伴侣蛋白、酶调节剂、核酸结合蛋白、激酶类、转移酶类、转录因子、氧化还原酶类以及结构蛋白。本研究为大规模分析鉴定 ISG15修饰蛋白提供了一种特异、有效的研究方法。     

5-氟尿苷5’-棕榈酸酯的酶法合成

考察了10 ml丙酮-四氢呋喃(85/15,体积比)混合溶剂体系中,各关键因素对脂肪酶Lipozyme TL IM催化5-氟尿苷5’-棕榈酸酯合成反应的影响.结果表明,添加分子筛能有效除去溶剂中的水分,从而极人地提高了目标产物收率.在最优反应条件下,该体系被成功放大至200 ml (5-氟尿苷克级用量),产物收率高达9...     

α-乙酰基二硫缩烯酮α碳原子的酰化反应

进行了α-乙酰基二硫缩烯酮与酰氯的酰化反应. 以干燥的二氯甲烷为溶剂, 在四氯化钛催化下, α-乙酰基环二硫缩烯酮(1)可与脂肪及芳酰氯(2)反应, 在化合物1的α-碳原子上发生酰化反应, 以较高的产率生成各种α-乙酰基-α-酰基二硫缩烯酮(3).     

奇异变形杆菌中赖氨酸-2-羟基异丁酰化蛋白的分析

蛋白质的赖氨酸修饰广泛参与基因调控、转录、代谢等重要的生物过程。在真核细胞组蛋白上发现了一种新的赖氨酸修饰--2-羟基异丁酰化,这种修饰对于生殖细胞分化具有调控功能。该研究旨在探索这种修饰在原核生物非组蛋白中的特征。通过亲和富集、高效液相色谱-串联质谱鉴定和生物信息学分析,在奇异变形杆菌中鉴定到大量未见报道的2-羟基异丁酰化蛋白及其位点,进而考察了原核生物中2-羟基异丁酰化修饰蛋白的分布特征、分子网络和通路特点。研究表明,赖氨酸-2-羟基异丁酰化在原核生物中具有广泛的分布,其生物学意义值得进一步研究。     

3-羟基异噁唑的O-和N-酰化及其区域选择性研究 Ⅱ.3-羟基-5-甲基异噁唑O-和N-酰化产物的选择性合成

本文研究了不同反应条件下3-羟基-5-甲基异噁唑(1)与3-甲基-2-对氯苯基丁酰氯(2a)的反应,提出了区域选择性合成O-和N-酰化产物的方法。在三乙胺存在下,乙腈为溶剂,1和2a～2e反应得到含量为88～96％的O-酰化产物3a～3e;而若将1转化为相应的异噁唑硅醚4,再与2a～2i反应,则得到含量为86～97％的N-酰化产物5a～5i。试验表明,在DMAP催化下,3a和5a可发生O-/N-酰基转移反应。     

大豆分离蛋白风味物质的气相色谱-质谱分析

采用顶空固相微萃取技术通过气相色谱一质谱联用分析了两种大豆分离蛋白的风味成分。在未经乙醇处理的样品中共检测到己醛等14种风味物质，而经乙醇处理的样品仅检测到5种风味物质；豆粕经乙醇处理后制备的大豆分离蛋白，主要异味成分之一——1-辛烯-3-醇未被检测到；且己醛、乙酸乙酯、1-己醇、辛酸乙酯及苯甲醛等5种风味成分的含量明显减少，不及对照样品的10％。证明经乙醇处理后的大豆分离蛋白，其风味已得到了明显的改善。     

禽流感病毒H5N1病毒颗粒中鸡胚宿主蛋白的质谱分析

在A型流感病毒等许多包膜病毒的病毒颗粒中,除包含病毒基因组编码的结构蛋白外,还包含来源于宿主细胞的多种蛋白。然而,在鸡胚内增殖的病毒颗粒所包含的宿主蛋白的种类尚不清楚。本研究采用20%～60%(w/w)蔗糖密度梯度离心法分离纯化了繁殖于鸡胚的流感病毒,并用十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(Sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis,SDS-PAGE)结合质谱法对纯化的流感病毒颗粒进行了全面的蛋白质组学分析。结果表明,在病毒颗粒中,除包含9种病毒编码蛋白外,还发现了12种来源于鸡胚的蛋白,如膜联蛋白A2、肽酰脯氨酰顺反异构酶B、过氧化物酶1、磷酸甘油酸激酶、丙酮酸激酶肌组织异构酶等,以及2种细胞骨架蛋白(微管蛋白b-3和肌动蛋白)。     

多肽的快原子轰击和质量分离离子动能谱法分析

本文报道了用快原子轰击与质量分离离子动能谱(FAB-MIKES)技术测定三个多肽(七肽、八肽和九肽)中氨基酸的顺序。通过解释谱图上的肽段质子化的离子峰和碎片峰,证明用本项技术测得的氨基酸顺序与已知的完全一致。     

由质谱分析数据建立乙肝病人与健康人的分类模型

建立运用表面加强激光解吸电离-飞行时间质谱获取乙肝病人和健康人血清蛋白指纹图谱数据,并用偏最小二乘(PLS)变量筛选法建立乙型肝炎(HBV)病人和健康人的分类模型,最终得到分类模型的交叉检验相关系数达0.97以上,判别准确率显著提高.对模型进行分析,找出对乙型肝炎病人和健康人的差异有重要影响的因素或变量.这些变量为某些质荷比区间内特定蛋白的峰强度值,反映这些质荷比区间内蛋白量的增加或减少,与乙肝病的形成有密切关系,可作为重要的生物标志物,进一步加以研究.本研究采用所得模型的拟合值等一些信息来做分类图,能较好地表达回归模型的分类效果.     

有机硼化合物的质谱分析

对有机硼化合物进行质谱分析,考察不同种类仪器对样品分析的影响,确定使用电喷雾质谱仪效果最好。进一步考察了流动相、正负离子检测模式、离子化试剂及其浓度等因素的影响。实验发现:样品浓度为1×10-4mol/L,使用V(甲醇):V(H2O)=1:1的混合溶剂为流动相,正离子检测,0.1mol/LNa 为离子化试剂条件下可得到满意的谱图。     

质谱动力学方法在手性分析中的应用

质谱动力学方法采用电喷雾离子化的方法获得含有手性化合物、并由过渡金属离子连接的复合物,然后进行碰撞诱导解离,两种解离途径的解离速率与混合物的对映体组成相关,进而可进行手性化合物光学纯度的测定。与其它常见手性测定方法相比,质谱动力学方法无需湿法化学处理和色谱分离步骤,操作简单、快速、灵敏,因而被广泛应用。本文对质谱动力学方法用于手性化合物对映体过量值测定的原理、改进方法、应用领域进行了评述。     

Mass Spectrometric Analysis of Site Specific Deuterated Zervamicins

Abstract

Zervamicin is a 16-residue antibiotic peptide produced by Em. salmosynnemata. It belongs to a broad class of α-helical peptides which interact directly with the lipid bilayer. In our strategy to investigate the structure and dynamics of membrane-associated peptides we follow an approach based on site-specific isotope labelling and measurement by means of stable isotope sensitive techniques. We have accurately determined the exact postion of deuterium atoms at Gln-11 of the antibiotic zervamicin-IIB from the FAB collision-induced dissociation FAB-mass spectra of the sodium cationized molecules.     

浅谈几种同分异构体的质谱解析

质谱解析是波谱分析课程教学的重点和难点,有机化合物裂解规则是质谱解析的关键,掌握有机化合物质谱的碎裂规律对于化合物结构解析很有帮助。本文从本科教学的实际出发,对三类常见同分异构体羧酸-酯、醇-醚及直链-支链化合物的质谱碎裂规律进行梳理,并通过具体质谱解析实例帮助学生学习、掌握有机化合物的基本裂解规律,提高质谱解析能力。     

Mass Spectrometric Analysis Revealing Phosphorylation Modifications of Periostin

Human periostin was over-expressed in HEK293T cells, which was enriched by nickel ion affinity resin, and further purified by gel electrophoresis. Phosphopeptides contained in the tryptic digestion of the purified periostin were enriched by TiO₂ affinity chromatography, and then analyzed by liquid chromatography-tandem mass spectrometry(LC-MS/MS). LC-MS/MS analysis reveals three phosphorylation modification sites of periostin at IKVIEGpSLQPIIK(682―694), pSLHEKLKQDK(498―507) and p[TT]VLYEC^*C^*PGYM^*R(73―85). The established method could be a great help to profiling the phosphorylation status of periostin under different physiological environments, such as inflammatory and tumor micro-environments.