基于Chlamydocin骨架设计合成环肽类HDACi及其抗肿瘤活性

组蛋白去乙酰化酶(HDACs)通过催化各种底物蛋白包括组蛋白、转录因子、α-微管蛋白和核输入蛋白等的ε-赖氨酸残基乙酰化侧链的去乙酰化来影响细胞功能,抑制HDAC活性可以治疗表观遗传异常引起的癌症和其他慢性疾病.以HDAC抑制剂(HDACi) Chlamydocin为骨架设计合成一类新型抑制剂,将HDACi的结合区设计为二硫键结构、在环肽中苯丙氨酸的苯环不同位点引入甲基,合成4种不同序列的环肽类HDACi.考察HDACi体外抗肿瘤细胞(MCF-7,Hela和7721)活性,结果表明HDACi对三种肿瘤细胞系均显示良好的生长抑制作用,细胞形态都发生明显变化,其中对Hela细胞的毒性最高,IC50达到0.1 μmol/L.     

螺环吲哚类MDM2抑制剂的分子对接、定量构效关系和分子动力学模拟

采用分子对接、三维定量构效关系(3D-QSAR)和分子动力学方法研究了21个螺环吲哚类化合物与MDM2蛋白的相互作用, 并建立了相关预测模型. 比较分子场分析法(CoMFA)和比较分子相似性指数分析法(CoMSIA)模型的交互验证相关系数q²分别为0.573 和0.651, 非交互验证相关系数r²分别为0.948和0.980. 分子对接得到的结合模式与分子动力学模拟得到的结果一致, 结合模式表明该类螺环吲哚化合物主要通过疏水相互作用和氢键与MDM2结合. 基于上述相互作用模型设计并合成了6个新结构螺环吲哚化合物, 并在MDM2高表达的前列腺癌LNCaP细胞株上测定其活性, 结果表明化合物5, 6的半数抑制浓度均低于1μg·mL^-1, 可作为新的抗肿瘤药物先导化合物进一步深入研究. 本研究对以MDM2为靶点的新结构螺环吲哚类抑制剂的开发提供了理论和实验依据.     

基于糖皮质激素受体调节剂波尼松龙的定量构效关系研究

为了探讨糖皮质激素受体调节剂波尼松龙系列的结构和活性之间的关系,首次使用比较分子力场(CoMFA)和比较分子相似性指数分析(CoMSIA)方法对77个靶标分子建立三维定量构效关系(3D-QSAR)模型.在基于配体叠合的基础上,得到了最好的CoMSIA模型(Q2=0.504,R2ncv=0.849,SEE=0.283,F=56.365和R2pred=0.792).模型的三维等势线图分析说明了疏水性基团在R1取代基位置有利于提高活性,亲水性基团在R2取代基位置有利于提高活性.此外,分子对接分析结果显示了与波尼松龙形成一些氢键的氨基酸Asn564,Gln642,Thr739在糖皮质激素受体调节剂中有重要作用.本文得到的结果能够更好地帮助理解糖皮质激素受体调节剂作用机理,并为今后的药物设计与合成提供了新思路.     

HIV-1逆转录酶抑制剂的3D-QSAR研究及分子设计

采用Topomer Co MFA方法对24个二芳基苯胺衍生物进行三维定量构效关系研究,建立了3DQSAR模型,所得优化模型的非交叉相关系数、交互验证系数以及外部验证的复相关系数分别为0.928,0.654和0.940,结果表明该模型具有良好的稳定性和预测能力。采用分子对接技术对药物与受体的作用机制进行了研究,结果显示,药物与HIV-1逆转录酶的LYS172,GLU138,LYS101等位点作用明显。运用这些信息进行分子设计,在理论上获得了一些具有较高活性的新的二芳基苯胺类抗艾滋病药物,该QSAR的研究结果可为新药合成提供理论参考。     

α-环糊精/聚乙二醇自组装超分子纳米药物载体

研究了一种新型超分子纳米药物载体的制备方法及其药物释放性能. 将α-环糊精(α-CD)穿入肉桂酸改性的PEG分子链形成包含复合物(inclusion complex, IC), 通过超分子自组装成为纳米粒子. 将抗肿瘤药物阿霉素负载到纳米粒子中, 研究药物释放行为及其对肿瘤细胞的抑制效果. 以核磁共振(1H NMR)、X射线衍射(XRD)、紫外吸收光谱(UV)、动态光散射(DLS)、扫描电镜(SEM)、透射电镜(TEM)和原子力显微镜(AFM)表征了纳米粒子的结构和形貌, 用激光共聚焦显微镜(Confocal)研究了载药纳米粒子在细胞内的分布及其对肿瘤细胞的抑制效果. 结果显示超分子纳米粒子具有很好的生物相容性和药物缓释作用, 载药纳米粒子对肿瘤细胞具有很好的杀伤效果.     

柔性比较分子场分析方法在糖原磷酸化酶抑制剂三维定量构效关系研究中的应用

通过取消比较分子场分析法(CoMFA)中作为探针安置的网格格点, 并辅以群体智能算法来优化不同类型探针在药物分子周围最佳分布情况, 以此把柔性机制引入到CoMFA当中, 从而形成了一种新的3D-QSAR研究方法: 柔性比较分子场分析法(FCoMFA). 初步尝试使用FCoMFA对47个糖原磷酸化酶抑制剂研究结果表明: FCoMFA能够有效找寻配基与受体的活性位点作用方式并给出具有较强稳定性和预测能力的QSAR模型, 同时可直观通过探针分布模式图观察不同取代基对药物活性的影响情况.     

Combretastatins类微管蛋白抑制剂的定量构效关系与结合模式

以Combretastatins的B环改造化合物为研究对象, 采用遗传函数分析方法进行了二维定量构效关系研究. 研究结果表明, Apol, PMI-mag, Dipole-mag, Hbond donor和RadOfGyration等描述符对该系列抑制剂活性的贡献最大. 采用比较分子场分析方法(CoMFA)和比较分子相似因子分析方法(CoMSIA)进行了三维定量构效关系研究, 建立的CoMFA和CoMSIA模型的交叉验证相关系数q2分别为0.630和0.634, 具有较强的预测能力. 利用CoMFA和CoMSIA模型的三维等势图解析了Combretastatins类化合物的构效关系, 阐明了B环上各取代基对抑制微管蛋白聚合活性的影响, 同时应用分子对接方法分析并验证了定量构效关系模型.     

几种改进的CoMFA方法比较研究血小板活化因子拮抗剂

由于传统的比较分子场分析(CoMFA)方法本身存在一些缺陷，使得分子的叠合 规则以及叠合分子的空间取向和空间位置等因素对q~2的影响很大，因此相继提出 了几种改进的CoMFA方法。为了优化CoMFA结果，应用传统的CoMFA方法和交叉验证 的R~2引导的区域选择法(q~2-GRS)、全取向搜索法（AOS）、全空间搜索法（APS） 以及比较分子相似性指数(CoMSIA)等四种改进的CoMFA方法，对18个pinusolide类 衍生物这类新发现的血小板活化因子（PAF）拮抗剂进行了比较研究。结果表明四 种改进的CoMFA方法得到的q~2值均比传统CoMFA的高。q~2-GRS方法得到的q~2值有 所提高，但综合结果并不理想，AOS与APS得到的q~2较为理想，而在CoMSIA中， q~2几乎不受空间取向或空间位置的影响。同时我们引人基于样本的偏最小二乘法 （SAMPLS）取代原AOS／APS程序中的传统PLS进行统计分析，明显提高了其运行速 度。最后，根据q~2最高的CoMFA模型和CoMSIA模型设计了几个预测活性更高的 pinusolide类似物。     

间尼索地平分子模板聚合物的识别特性1

分子印迹技术是近年来基于分子识别的研究基础上发展起来的一种新的功能性聚合物合成技术.由于具有卓越的分子识别性能,同时具有良好的物理化学稳定性,分子印迹聚合物(MIP)在手性化合物分离、环境分析、生物模拟传感器、模拟酶催化、临床药物分析和膜分离技术等领域展现了良好的应用前景[1-2].间尼索地平药物为河北医科大学药学院首创、且具有自主知识产权的国家一类新药.此药物为手性对映体结构,其(R)-和(S)-间尼索地平的药效、药理、毒理作用不甚明确.为了减少给药量和对人体产生的毒副作用,必须对其进行手性拆分.本论文对间尼索地平分子模板聚合物的制备和性能识别进行了研究,旨在进一步探索分离间尼索地平的新方法.1 实验部分1.1 主要仪器与试剂     

两类促肾上腺皮质释放激素(CRH)拮抗剂的分子场分析

采用比较分子相似性指数分析方法(CoMSIA)及比较分子场分析方法(CoMSIA)研究了两组CRH拮抗剂结构与活性的关系。在两种方法中,都考虑了静电场、立体场以及氢键场对构效关系的影响,结果表明采用CoMSIA得到构效关系模型要明显优于采用CoMFA得到的构效关系模型,在CoMSIA计算中,当引入疏水场时,三维构效关系模型能得到明显的改善,通过这个三维构效关系模型,可以较为精确地预测化合物的活性。通过分析分子场等值面图在空间的分布,可以观察到叠合分子周围的立体、静电以及疏水特征对化合物活性的影响。     

Copper(II) tetrafluoroborate as a novel and highly efficient catalyst for acetal formation

Commercially available copper(II) tetrafluoroborate hydrate has been found to be a highly efficient catalyst for dimethyl/diethyl acetal formation in high yields from aldehydes and ketones by reaction with trimethyl/triethyl orthoformate at room temperature and in short period. Acetalisation was carried out under solvent-free conditions with electrophilic aldehydes/ketones. For weakly electrophilic aldehydes/ketones (e.g., benzaldehyde, cinnamaldehyde and acetophenone) and for aldehydes having a substituent that can coordinate with the catalyst, the corresponding alcohol was used as solvent.     

New synthetic routes towards various α-fluorinated aryl ketones and their enantioselective reductions using baker's yeast

Highly electrophilic dichlorofluoromethyl aryl ketones were obtained by oxidation of dichlorofluoromethyl aryl alcohols. Subsequent dechlorination of these ketones using sodium formaldehyde sulfoxylate (Rongalite) and reductive dehalogenating system SnCl₂/Al led to various fluoromethyl aryl ketones and chlorofluoromethyl aryl ketones, respectively. Asymmetric reductions of these fluorinated ketones using the inexpensive baker's yeast produced the corresponding fluoromethyl aryl alcohols with different enantioselectivities.     

Highly Efficient Synthesis of Bis（indolyl）methanes Catalyzed by Sodium Tetrafluoroborate

Sodium tetrafluoroborate （NaBF4） was found to catalyze the electrophilic substitution reactions of indoles with aldehydes and ketones under solvent-free conditions to afford the corresponding bis（indolyl）methanes in high yields.     

[Ru(DMSO)4]Cl2 catalyzes the α-alkylation of ketones by alcohols

The electrophilic α-alkylation of ketones with alcohols was accomplished by a [Ru(DMSO)₄]Cl₂ catalyzed process, water being the only wasted material. The reaction can be successfully governed to produce either the expected ketones or their related alcohols only by changing the reaction conditions. When 2-aminobenzyl alcohol was used, a cyclization process took place to yield 2,3-disubstituted quinolines.     

One-Pot Cascade Leading to Direct α-Imidation of Ketones by a Combination of N-Bromosuccinimide and 1,8-Diazabicyclo[5.4.1]undec-7-ene

A one-pot cascade transformation of ketones into α-imidoketones has been developed, in which N-bromosuccinimide (NBS) provides both electrophilic bromine and nucleophilic nitrogen sources, and diazabicyclo[5.4.1]undec-7-ene (DBU) functions as a base and a nucleophilic promoter for the activation of NBS. α-Bromination is supposed as the key step in the process, which takes place between more electrophilic bromide active species and enolates.     

Regioselectivity of enamine reactions,preferential 2,2-disubstitution of 2-methylcyclohexanone imines

Secondary enamines derived from imines of unsymmetrical α-substituted ketones react with electrophilic alkenes at the more substituted position to give α,α-disubstituted ketones on hydrolysis.     

Eu(NTf2)3催化吲哚与醛(酮)反应合成二吲哚基甲烷

二(三氟甲基磺酰)亚胺铕(Ⅲ)[Eu(NTf2)3,Tf=SO2CF3]作催化剂,吲哚与醛(酮)在室温下发生亲电取代反应合成了一系列二吲哚基甲烷,产率85%～98%.该法反应条件温和、时间短、催化剂用量少且可以回收重复使用.     

An efficient synthesis of highly substituted furans via the electrophilic cyclization of 1-(1-alkynyl)-cyclopropyl ketones

The electrophilic cyclization of 1-(1-alkynyl)-cyclopropyl ketones offers an efficient and straightforward route to highly substituted furans under extremely mild reaction conditions. Iodine, NIS, and PhSeBr have proven successful as electrophiles in this process.     

Synthesis of Pharmacologically Active Bis(indolyl) and Tris(indolyl) Derivatives Using Chlorotrimethylsilane

Chlorotrimethylsilane is found to be a comparatively fast and efficient catalyst for carrying out electrophilic substitution reactions of indoles with various aldehydes/ketones/triethylorthoformate, yielding excellent amount of bis(indolyl)methanes/tris(indolyl)methanes. The merits of this protocol are avoidance of any external energy source, minimal reaction time, simple and easy procedure and high yield under solvent free room temperature condition. The versatility of this method has been tested with various aldehydes/ketones and received satisfactory results.     

Induced halogenation of alkyl cyclohexenyl ketones involving metal halides,hydrohalogenic acids,and hydrogen peroxide

The induced halogenation and hydroxyhalogenation of alkyl cyclohexenyl ketones in a system [MHlg + HHlg or HHlg]-H₂O₂ or in NaOCl was performed and optimum reaction conditions were established. Under mild conditions the electrophilic addition of the halogen or the acid occurred at the multiple bond of the ring with the formation of the corresponding dihalo or hydroxyhalo derivatives of cycloaliphatic ketones. From the compounds obtained epoxy- and dioxyketones of aliphatic series were prepared. Chloro(bromo)hydrins of ketones from the alkylcyclohexane series and oxiranes based thereon are reactive compounds and can be employed as synthons in the organic synthesis.