Tenua化学动力学模拟软件在大学化学教学中的应用

介绍了化学动力学模拟软件Tenua的基本功能与使用步骤,并结合大学化学课程教学内容,将其应用于常见的0、1、2级反应动力学曲线,单底物酶促反应动力学,气相可逆反应动力学等内容的教学中.Tenua的应用不仅增强了学生对动力学中反应速率及其方程表达的理解,还丰富了课堂教学形式,提升了感性认识,激发了学生对反应动力学的学习兴趣.     

计算机分子模拟在分子印迹技术中的应用

传统的分子印迹技术对模板分子、功能单体、交联剂、致孔剂等的筛选往往依靠经验,常通过反复实验对合成条件进行优化,存在实验周期长、耗材量大等问题。计算机分子模拟技术的应用在实验过程中起到可预见性指导作用,可以实现精准识别位点的裁制、识别驱动力的设计,通过结合能等物化特征参数计算优化识别体系的稳定性,从而合理选择模板分子、功能单体、交联剂、致孔剂,优化聚合条件,以提高聚合物识别特异性和亲和力,缩短实验周期,更符合绿色化学的理念。本文简单介绍了计算机分子模拟技术,重点对其在分子印迹技术中的指导作用进行了综述,并对其在分子印迹技术中的应用进行了展望。     

Material Studio 7.0分子模拟软件在结构化学晶体结构教学中的应用

以3-氧杂双环（3.2.0）-1,4-庚二烯（OHD）晶体结构的构建为例,介绍了分子模拟软件Material Studio（MS）7.0在结构化学晶体结构章节中的教学应用,在三维晶体结构构建和优化的基础上,结合相关实验数据进行精修及定性定量物相分析,实现在微观结构层次对分子在三维空间的排列组合进行可视化展示,使学生能够直观、形象地理解有关晶体结构的抽象概念及理论。     

计算机与化学 Gaussian软件在环境化学教学中的应用

结合环境化学的学科特点和学生的实际情况,探讨Gaussian软件（包括Gaussian03和GaussView）在环境化学教学中的应用。实践表明,引入计算化学软件使抽象的化学理论变得形象、简单,能够大大增强理论知识的生动性和实际应用能力,有利于培养学生的形象思维能力和提高教学效果。     

反应动力学通用模拟软件及其在教学中的应用

介绍了反应系统的动力学微分方程.通过使用4阶Runge-Kunta数值积分法和Visual Basic 6进行编程,得到了通用的反应动力学模拟软件,可直接计算恒温时各组分浓度随时间的变化.用于物理化学等课程的教学实践表明,软件可直观显示反应系统各组分浓度与时间和温度等影响因素的关系,有助于学生掌握反应动力学规律和课程的知识点.     

通用轨道绘制软件Orbital Viewer及其在教学中的应用

以实例介绍了用轨道绘制软件OrbitalViewer制作原子、分子轨道 3D图形和VRML动画的方法 ,以及这些素材在网络课件和PowerPoint演示中的显示与播放方法     

常用化学软件在中级无机化学教学中的应用

介绍在大学高年级中级无机化学课程中,应用常用化学软件辅助教学的一些体会和具体做法,提出了在教学中充分利用计算机化学的新成果和新方法丰富教学内容的思路。     

新一代分子可视化软件Jmol及其教学应用简介

Jmol是一个用Java语言编写的免费的、开源的、跨平台的新一代分子可视化软件,我国化学教育工作者对其认识还较生疏。介绍Jmol的使用以及基于它开发的网络资源,并提供了在化学教学中的应用案例,以期对我国化学教育开展分子可视化教学提供参考。     

计算化学在分子轨道教学中的应用

分子轨道理论是理解分子电子结构与微观性质的重要理论之一,也是本科生与研究生结构化学教学中的重点与难点。学生对原子轨道组合形成分子轨道、分子轨道能级交叉混合等知识的理解缺乏形象直观、定量的认识。本文通过基于量子化学或密度泛函理论的Gaussian 03计算软件,计算、绘制并分析了F_2、O_2、N_2、HF、CO等的分子轨道能级图,将学生较难理解的内容定量、直观地呈现出来,形象地解释了分子轨道成键原则与电子填充原则等分子轨道理论中的重难点,加深了学生对分子轨道理论的理解,特别是sp轨道混杂导致的σ_(2p_z)与π_(2p)轨道能级交叉这一难点,激发了学生学习的主动性和积极性,提高了教学质量。在此基础上,利用分子轨道理论分析了CO_2的电子结构,使学生学会应用分子轨道理论解决实际问题,巩固了相关课堂理论知识。     

MOLMO：建立在个人计算机上的交互分子图形软件

一、引言计算机分子图形学已成为化学研究的一种十分新颖且有效的研究手段。它使化学家可以建立和操作分子三维模型,并模拟分子的物理、化学性质,推断已知或未知的化学物质的物性,     

Mercury软件在配位化学教学中的应用*

以配合物Zn(2,4′-bpt)2(H2O)晶体结构为例,探讨了Mercury软件在配位化学教学中的应用。首先在构建零维晶体结构基础上,通过氢键连接形成一维链,明确了该配合物的结构特点;其次,测量了键长、键角和二面角等,定量地解释了化学键参数信息;最后,结合配合物粉末衍射实验数据与模拟数据对比,分析了样品的纯度。Mercury软件可在微观结构层次实现配合物在多维空间排列组合的可视化展示,使学生直观地理解配合物结构的抽象概念。     

Gaussian软件在高分子化学教学中的应用

基于计算思维,运用工具化、具象化解决问题的方法,将Gaussian软件用于高分子化学教学.将乙烯自由基聚合中的"回头咬"、乙烯以及氯乙烯自由基聚合中的链增长过程以及自由基聚合中的活性中心自由基的结构等,直观、动态而又准确地呈现了出来,实现了部分自由基聚合过程的可视化、精确化呈现,可帮助学生更容易、更直观、更准确地理解相...     

Gaussian软件在高校化学教学中的应用

介绍Gaussian软件在高校化学教学中的几种用途。提倡教师在教学过程中多使用能提高教学效果的软件。     

POV-Ray软件在分子对称性中的应用

以交错式乙烷为例,详细地介绍了如何使用POV-Ray软件制作展示分子对称元素的精美视频动画,可以帮助学生直观形象地分析分子结构,很好地掌握分子对称性的相关教学内容,切实提高课程的教学效果。     

象形分子在有机化学及有机合成化学教学中的应用

激发学生学习兴趣,是提高课堂教学效果的关键。从化学科普网站收集象形分子,并用于有机化学及有机合成化学的课堂教学。通过象形分子形象逼真、妙趣横生、幽默及具艺术魅力的特点,调动学生学习的积极性和主动性,激发学习兴趣和热情,进而提高课堂趣味性,使教学内容形象生动。提高了教与学的效率和水平。     

分子模拟在有机聚合物电致发光材料设计中的应用

对聚合物分子模拟理论和一种较为精确的聚合物模拟方法－地简要的介绍，分析模拟计算的结果如能量结构、前线轨道能级、能带结构、跃迁能等与电致发光相关的测定指标如导电性、氧化还原电位、光电子能谱、吸收与发光谱、光氧化性、热稳定性相关联。并讨论了分子模拟辅助电致发光新材料设计上的应用。     

苏丹红Ⅱ与肌红蛋白相互作用的分子模拟与实验

用荧光光谱法研究了苏丹红Ⅱ与肌红蛋白(Mb)之间的相互作用, 实验结果表明,二者结合位点数近似为1, 结合常数K=3.84×107L/mol, 有很强的相互作用. 用分子柔性对接技术模拟确定了它们之间的作用位点、作用力类型及相互作用能. 理论计算的结果表明,苏丹红Ⅱ和Mb相互作用的势能为-9419.9 kJ/mol, 静电能为-7468.8 kJ/mol, 范德华能为-1951.0 kJ/mol. 苏丹红Ⅱ与Mb中His64残基形成氢键, 苏丹红Ⅱ也能与疏水氨基酸残基, 如能产生内源荧光的Phe33、Phe43、Phe106 和 Phe138等发生作用, 这与苏丹红Ⅱ能使Mb荧光猝灭的实验结果是一致的.     

Materials Studio软件在“金属”教学中的应用*

以中学化学所涉及的“金属”物质教学内容为例,运用MS分子模拟软件内嵌的Visualizer,Build 及Symmetry property 等3个功能模块,在不同尺度(从埃、纳米、微米到厘米)范围内,实现对“金属原子结构”“金属晶体”及“金属性质(密度)”的连续性可视化展示,帮助学生从原子的视角深入理解化学物质微观结构与宏观性质之间的本质相关性。