Synthesis of Distamycin Analogs and Their Interactions with Calf Thymus DNA

Two distamycin analogs (PyPyPy‐γ‐Dp and PyPyPyPy‐γ‐Dp) were synthesized by a haloform reaction and the DCC/HOBT coupling reaction in a ample and fast way without amino protection. By using calf thymus DNA, the interaction between the analogs and DNA duplex was studied by CD, and ITC.     

A Convenient Method for the Synthesis of Distamycin Analogue

A novel distamycin analogue was synthesized by chloroform reaction and DCC/HOBT coupling reaction without using amino protection and deprotection.     

鲱鱼精DNA的电化学氧化及与组蛋白的相互作用

应用循环伏安法、微分脉冲伏安法和荧光光谱法研究了鲱鱼精DNA的电化学氧化及其与组蛋白的相互作用.结果发现,在0.20~1.25 V电位区间内,DNA在酸性溶液中呈现一个明显的不可逆氧化峰,在中性及碱性溶液中呈现两个不可逆氧化峰.氧化峰电位随溶液pH值增大而负移,变化幅度为-57 mV.pH-1.氧化峰电流与DNA浓度(0.45~8.20 mmol.L-1)成线性关系.DNA能与组蛋白结合,导致氧化电位正移,氧化电流减小,并减弱钌配合物指示剂和DNA相互作用的荧光强度以及减少DNA的氧化损伤.     

三聚氰胺与鯡鱼精DNA相互作用研究

采用UV、荧光光谱、电化学和粘度法等方法研究了三聚氰胺(MM)与鲱鱼精DNA的作用机制, 并采用凝胶电泳考察了MM对pBR322质粒DNA迁移作用的影响. 当pH为7.0时, 动力学参数的计算结果表明: 加入DNA前后MM电荷转移系数α分别为0.27和0.26, 速率常数k_s分别为5.58 s^-1和5.65 s^－1; 热力学研究表明MM与DNA的结合常数K约为10⁵ mol^－1•L, MM与DNA可能是以沟槽式相结合.     

亚甲基蓝与鲱鱼精DNA相互作用的光谱法研究

以吖啶橙(AO)作为光谱探针, 采用UV和荧光光谱等方法研究了亚甲基蓝(MB)与鲱鱼精DNA的作用机制. 确定了在低浓度MB时, MB与DNA以嵌插方式作用; 而在高浓度MB时, MB与DNA之间为混合作用方式. 结合比n(MB)∶n(DNA)＝10∶1, 结合常数 ＝2.46×10⁵ L•mol^－1, MB-DNA复合物的表观摩尔吸光系数ε＝5.70×10⁶ L•mol^－1•cm^－1. 同时研究了酸度和温度等对MB与DNA相互作用的影响, 热力学研究推导了MB结合DNA为焓驱动反应.     

荧光光谱法研究核黄素与鲱鱼精DNA的相互作用

在B-R缓冲溶液中, 以吖啶橙(AO)作荧光探针研究了核黄素(RF)与DNA的相互作用. 在pH值为7.25时, 荧光光谱研究表明, RF与DNA发生作用生成了复合物, 其结合比为n_RF∶n_DNA＝5∶1, 28 ℃时RF与DNA的结合常数K＝2.53×10⁶ L/mol; 并运用双倒数法求得RF与DNA相互作用的 为－6.06×10⁴ J/mol, 为－78.70 J/(mol•K), 28 ℃时的 为－3.69×10⁴ J/mol. 同时通过粘度法、盐效应和Scatchard法等研究了RF与DNA的作用方式, 确定了在该实验条件下RF与鲱鱼精DNA之间主要为沟面和静电作用方式.     

水杨酸键联卟啉的合成及与牛血清白蛋白的相互作用

以溴代烷氧基苯基卟啉(1)为原料与水杨酸作用,分别得到了化合物2和3,再与醋酸钴反应,得到了钴卟啉配合物4和5.新化合物分别由¹HNMR,IR,UV-Vis,MS和元素分析确证.同时,利用荧光光谱考察了金属卟啉与牛血清白蛋白的相互作用.     

N-甲基吡咯类聚酰胺的合成及其与DNA的相互作用

本研究主要是设计并合成了3个含有4个N-甲基吡咯的聚酰胺化合物(PyPyPyPyβDp,PyPyPyPyγDp, NO₂PyPyPyPyβDp),并使用ESI-MS法研究了其与DNA的相互作用.     

Study on the Interaction between Gatifloxacin Mesylate and Salmon Sperm DNA by Fluorescence Method

The interaction between gatifloxacin mesylate (GM) and salmon sperm DNA was studied by fluorescence spectrometry and ultra‐violet (UV) spectrometry. Additions of salmon sperm DNA to GM solution resulted in its strong fluorescence quenching and UV absorbance decrease due to the strong interaction between GM and salmon sperm DNA. Both the maximum fluorescence emission wavelength and the maximum UV absorbance wavelength of GM did not change with the increasing concentration of salmon sperm DNA, indicating no intercalative binding existed between them. The Stern‐Volmer plot indicated that the fluorescence‐quenching constant at different temperatures or different salmon sperm DNA concentration ranges was different. Effects of ionic strength and I^? on the fluorescence quenching of GM by salmon sperm DNA indicated that electrostatic interaction and groove binding coexisted between them.     

甲基百里酚蓝-钐(III)配合物与鲱鱼精DNA的相互作用

在pH＝7.25的Tris-HCl缓冲溶液中, 以中性红(NR)作为光谱探针, 采用UV光谱、FS光谱、粘度等方法研究了甲基百里酚蓝(MTB)与稀土金属离子钐[Sm(III)]形成的配合物Sm(III)(MTB)₂与鲱鱼精DNA的作用机制. 确定了Sm(III)(MTB)₂与鲱鱼精DNA之间有嵌插作用方式存在, 说明Sm(III)(MTB)₂金属配合物能使鲱鱼精DNA的功能产生一定影响.     

Electrochemical Studies on the Interactions of Dipyridophenazine Complex of Ruthenium and Herring Sperm DNA

Cyclic voltammetry (CV) and single-step chronocoulometry were used to study the interaction of [Ru(phen)2dppz]2 (phen=l,10-phenanthroline; dppz=dipyrido[3,2-a:2‘,3‘-c]phen-azine) with herring sperm DNA. The addition of DNA caused a diminution in the peak current and a positive shift in the peak potential of the complex of [Ru(phen)2dppz]2 . The 12 mV positive shift in the peak potential of [Ru(phen)2dppz]^2 indicates that [Ru(phen)2dppz]^2 binds 2.6 times more strongly to DNA than its reductive form. In addition, by using fluorimetric and UV-spectrophotometric methods and studies of denatured DNA and the effect of NaC1 solution, it was also found that the binding mode was intercalation. The decrease of peak current is proportional to the concentration of DNA, which can be applied to estimate DNA concentration.     

DNA与苯胺红T的相互作用与荧光定量检测

荧光染料作为分子探针用于核酸的定量测定和构象分析一直备受关注 [1] .已有数十种荧光染料被应用[2 ,3 ] ,如溴化乙锭早期常用作 DNA探针[4 ,5] ,因其有很强的致癌性 ,目前已很少采用 ,而那些无毒性或含有可被衍生的活性基团的探针分子越来越受到青睐 [6～ 8] .苯胺红 T(ST)是一种阳离子型荧光染料 ,它既可很容易地与 DNA双螺旋结构发生插入作用 ,又可由带正电的吩嗪环与 DNA上带负电的磷酸基发生强烈的静电吸附作用 ,还可利用其氨基与 DNA或其它生物分子进行交联 .He等 [9] 曾研究了它与小牛胸腺 DNA之间的作用 ,得到的结合位点数…     

Synthesis and DNA binding properties of pyrrole amino acid-containing peptides

Dimers of the pyrrole amino acid (Paa), 5-(aminomethyl)pyrrole-2-carboxylic acid, and its derivatives having Lys anchored on N- and C-termini bind in the minor groove of DNA with considerable apparent binding affinities. When the Lys unit is attached to the C-terminus, the resulting ligand binds to ds-DNA with twice the affinity, of the order of 10⁵, than the one carrying two positive charges at the same end.     

左旋多巴酪氨酰酪氨酸二肽的合成及与DNA的相互作用

采用Fmoc固相法合成了左旋多巴酪氨酰酪氨酸二肽(L-dopa-L-Tyr-L-Tyr), 并经RP-HPLC分离和纯化, 通过ESI-MS,¹H NMR和¹³C NMR表征了其结构. 采用紫外光谱、荧光光谱和琼脂糖凝胶电泳研究了左旋多巴(L-dopa)及L-dopa-L-Tyr-L-Tyr与DNA的相互作用. 结果表明, 随着L-dopa和L-dopa-L-Tyr-L-Tyr浓度的增加, 体系的紫外光谱呈减色效应; 根据Stern-Volmer方程可知荧光猝灭方式为静态猝灭; 琼脂糖凝胶电泳中, pUC18DNA的迁移速率变慢. 推测L-dopa和L-dopa-L-Tyr-L-Tyr与ctDNA作用模式为嵌入作用. 与L-dopa相比, L-dopa-L-Tyr-L-Tyr与DNA的相互作用更强.     

荧光猝灭法研究氟比洛芬与DNA相互作用

采用荧光光谱法和紫外光谱法, 在生理条件下(pH=7.40)对氟比洛芬(FP)与脱氧核糖核酸(DNA)的作用方式进行了研究.证实了氟比洛芬通过沟槽结合方式与DNA发生相互作用.实验表明, DNA与氟比洛芬的相互作用为静态猝灭过程,测得结合常数为5.53×10~5 L·mol~(-1),结合位点数为1.12.     

含芘荧光化学敏感器化合物同小牛胸腺DNA分子间的相互作用

研究了含芘荧光化学敏感器分子被ctDNA猝灭的荧光光谱.ctDNA分子对该化学敏感器中芘的激发单体,激基缔合物都有猝灭作用.对激发单体的猝灭速度顺序为;化合物(2)>化合物(1)>芘丁酸>化合物(3);对激基缔合物的猝灭速度顺序为;化合物(2)化合物(3).由得到的荧光猝灭数据,可按公式(2)求得荧光化学敏感器分子与ctDNA分子相互作用的稳定常数.发现化合物(2)与ctDNA分子间有着最强的相互作用能力.按ctDNA和含芘荧光化学敏感器的分子结构、构型以及分子内原子-原子的间距等提出了ctDNA分子与该荧光化学敏感器的作用模型,并对上述结果进行了初步解释.     

两种三齿多吡啶铜(Ⅱ)配合物的合成、表征及其与DNA的作用

本文合成了2个三齿多吡啶铜(Ⅱ)配合物[Cu(phpi)Cl₂]·H₂O和[Cu(tpy)Cl₂]·2H₂O(phpi=2-(苯并咪唑基-2)-1，10-邻菲咯啉，tpy=2，2:6′，2″-三联吡啶)，并通过元素分析、摩尔电导率、红外光谱、紫外光谱对其进行了表征。应用电子吸收光谱、荧光光谱和粘度法研究了配合物与DNA的相互作用。在抗坏血酸存在下，利用琼脂糖凝胶电泳方法研究了配合物对pBR322 DNA的切割作用并对其作用机理作了初步探讨。     

纳米金修饰碳糊电极上甲氨蝶呤的电化学测定及其与鲱鱼精DNA相互作用的研究

制备了纳米金修饰碳糊电极,使用循环伏安法(CV)研究了甲氨蝶呤(MTX)在该修饰电极上的电化学特性,并建立了纳米金修饰碳糊电极电化学测定MTX的新方法.利用线性扫描伏安法(LSV)和方波伏安法(SWV)研究了MTX与鲱鱼精DNA的相互作用.实验发现,在pH 3.6 HAc-NaAc缓冲溶液中,MTX在0.86 V处有一灵敏的氧化峰,氧化峰电流Ipa与MTX的浓度在0.5 ～10.0 μmol·L-1范围内呈良好的线性关系,方法检出限(S/N=3)为0.2μmol·L-1.对3.0 μmol·L-1的MTX进行11次平行测定,其RSD为4.7％.该修饰电极可用于MTX样品的测定,结果满意.当不同浓度鲱鱼精DNA加入MTX溶液后,氧化峰电位正移,氧化峰电流降低,表明MTX与鲱鱼精DNA之间发生了相互作用,形成了非电活性化合物.电化学研究表明,MTX与鲱鱼精DNA之间的结合比为2∶1,结合常数为4.6×105 L·mol-1.     

胞嘧啶核苷键联卟啉的合成及其与牛血清白蛋白的相互作用

基于卟啉化合物的光敏性和对肿瘤细胞有特殊的亲和力以及核苷类化合物的抗肿瘤及抗癌活性, 设计合成了胞嘧啶核苷卟啉化合物6和8, 其结构由¹H NMR, IR, UV-Vis, MS 和元素分析表征. 同时, 利用荧光光谱考察了上述核苷卟啉与牛血清白蛋白(BSA)的相互作用, 结果表明它们对BSA荧光有较强的静态猝灭作用.     

吖啶橙为荧光探针研究芹菜素与DNA的相互作用

在pH值为7.40的Tris-HC1缓冲溶液中,采用吸收光谱法、荧光光谱法以及粘度法研究了芹菜素(Ap)与鲱鱼精DNA(fsDNA)的相互作用.研究表明,Ap与fsDNA相互作用生成了结合比nAp:nDNA=2:1的复合物,温度300 K和310 K的结合常数Kb分别为1.068×104 L·m01-1和1.137×1...