距离比较法构建M1受体激动剂药效团模型

在M1受体三维结构未知的情况下,利用距离比较法（DISCO）对24个具有M1受体激动活性的化合物进行了研究,构建了M1受体激动剂可能的药效团模型,为设计新M1受体激动剂提供了参考,并以此为提问结构在ACD数据库和中草药数据系统（TCMDB）中进行搜索,得到一系列结构新颖并可能具有M1激动活性的化合物.     

DISCO法构建ALS抑制剂与受体作用的药效团模型

在受体ＡＬＳ三维结构未知的情况下,利用距离比较法（ＤＩＳＣＯ）对四个结构特征判别较大的ＡＬＳ抑制型除草剂进行了研究,构建了该类除草剂与受体作用的可能的药效团模型,为进一步设计开发新型的ＡＬＳ抑制剂及模拟靶蛋白的活性空腔提供有意义的参考。     

距离比较法构建M1受体激动剂药效团模型

在M1受体三维结构未知的情况下,利用距离比较法(DISCO)对24个具有Mi受体激动活性的化合物进行了研究,构建了Mi受体激动剂可能的药效团模型,为设计新M1受体激动剂提供了参考,并以此为提问结构在ACD数据库和中草药数据系统(TCMDB)中进行搜索,得到一系列结构新颖并可能具有Mi激动活性的化合物.     

距离比较法(DISCO)构建ALS抑制剂药效团模型

在乙酰乳酸合成酶（ALS）三维结构未知的情况下,利用距离比较法（DISCO） ,将10 个结构特征具有代表性的ALS抑制剂的分子构象进行叠合,建立了可能的 药效团模型,并初步验证了模型的可靠性。     

光系统Ⅱ(PSⅡ)抑制剂的比较分子场研究

以光系统Ⅱ抑制剂DISCO(DIStanceCOmparisons)模型的活性构象分子作为模板,利用比较分子场分析方法对三类结构不同的化合物进行了三维构效关系的研究。研究结果有助于对DISCO重叠模型的评估的新型PSⅡ抑制剂的设计与合成。     

基于药效团模型设计合成新型ALS抑制剂

以ALS抑制剂药效团模型为基础建立了提问结构,将药效团模型中的生物结构信息输入到多种小分子三维结构数据库(NCI-3D和ACD-3D数据库)中,分别搜寻出100多个符合特征结构信息的全新结构候选化合物.以这些命中结构的分子特征信息为基础设计合成了一系列新型的ALS抑制剂,初步生物活性测试结果表明,预期有生物活性的化合物显示出一定的ALS酶抑制剂活性.     

基于药效团的BRD4靶向小分子抑制剂虚拟筛选

BRD4靶点和多种肿瘤密切相关,是具有良好成药性的热门靶点.本文选取活性较好且结构差异较大的BRD4小分子抑制剂作为训练集分子,基于配体小分子共同特征(HipHop)方法使用Discovery Studio 3.0分子模拟软件构建了药效团.药效团通过测试集验证、ROC曲线验证(SE(sensitivity)=0.937...     

光系统Ⅱ抑制剂—反式氰基丙烯酸酯比较分子场和电子结构研究

对反式氰基丙烯酸酯系列活性分子采用限制性系统搜索方法确定的药效团模型 ,与 9类不同骨架结构的光系统 抑制剂 DISCO模型中的反式氰基丙烯酸酯分子(M- 2 2 )的活性构象为模板所确定的药效团模型是非常相近的。对两种方法所获得的活性构象分子进行了 Co MFA研究 ,其结果是一致的。采用 PM3方法进行了量子化学计算 ,计算结果表明两种模型的构象分子具有相近的电子结构 ,根据分子静电场、立体场和电子结构探讨了该类抑制剂的构效关系。     

基于药效团模型的DHODH抑制剂构效关系研究

利用药效团模型研究二氢乳清酸脱氢酶(Dihydroorotate dehydrogenase,DHODH)抑制剂的构效关系,为DHODH抑制剂的虚拟筛选提供新的方法.以31个具有DHODH抑制活性的化合物为训练集化合物,半数抑制浓度(IC50)范围为7~63000 nmol/L,利用Catalyst/HypoGen算法构建DHODH抑制剂药效团模型,通过对训练集化合物多个构象进行叠合,提取药效团特征及三维空间限制构建药效团模型.利用基于CatScramble的交叉验证方法及评价模型对已知活性化合物的活性预测能力,确定较优药效团模型.模型包含1个氢键受体、3个疏水中心,表征了受体配体相互作用时可能发生的氢键相互作用、疏水相互作用和π-π相互作用,4个药效特征在三维空间的排列概括了DHODH抑制剂产生活性的结构特点.所得较优模型对训练集化合物及测试集化合物的计算活性值与实验活性值的相关系数分别为0.8405和0.8788.利用药效团模型对来源于微生物的系列化合物进行虚拟筛选,筛选出59个预测活性较好的化合物,可作为进一步药物研发的候选化合物.     

p53-MDM2结合抑制剂药效团模型的构建

采用Catalyst软件, 选择5类共24个p53-MDM2结合抑制剂作为训练集, 经计算机建模、构象优化, 由Catalyst系统构建出药效团模型, 并对药效团进行有效性分析, 结合已知的p53-MDM2结合抑制剂的结构信息, 筛选得到含有一个芳环中心、三个疏水中心和一个氢键受体的具有较好预测能力(Correl=0.941, Config=17.530, 吟cost=150.830)的药效团模型.     

Synthesis of Au, Au/Ag, Au/Pt and Au/Pd nanoparticles using the microwave-polyol method

Gold, Au/Ag, Au/Pt and Au/Pd bimetallic nanoparticles with varying mol fractions were synthesized in ethylene glycol and glycerol, using the microwave technique in the presence of a stabilizer poly(N-vinylpyrrolidone) (PVP). It was found that bimetallic colloids of Au/Ag, Au/Pd and Au/Pt form an alloy either on co-reduction of respective metal ions or on mixing individual sols.     

自卤仿产生二卤卡宾的单电子转移过程

研究了从卤仿和氢氧化钠生成二卤卡宾的反应,根据化学和物理研究证明,是一单电子转移(SET)的反应机理.在类卡宾、三卤碳阴离子和二卤卡宾间设有平衡存在,卤素交换是单电子转移过程中形成的三卤甲基和二卤甲基游离基所引起的,它优先于卡宾对C=C的加成而发生,反应的初始电子给予体是CX3主要电子接受体是过量存在的卤仿.     

One-electron redox reactions of troxerutin in aqueous solutions

The oxidation of flavonoids is of great interest because of their action as antioxidants with the ability to scavenge radicals by means of electron-transfer processes. The redox reactions of the flavonoid derivative troxerutin, (2-[3,4-bis-(2-hydroxyethoxy) phenyl]-3[[6-deoxy-α-L-manno-pyranosyl)-β-(D-glucopyranosyl]-oxy]-5-hydroxy-7-(2-hydroxyethoxy)-4H-1-benzo-pyran-4-one), were investigated over a wide range of conditions, using pulse radiolysis and cyclic voltammetry. The oxidation mechanism proceeds in sequential steps. One-electron redox potentials for troxerutin were found to be +1.196, +0.846 and −0.634 V vs. NHE.     

NAD(P)H辅酶模型还原碳正离子反应的研究: 动力学、热力学及反应机理

本文对NAD(P)H模型物BNAH同xanthylium正离子反应的动力学进行了较为详尽的测定。同位素效应,自由基抑制剂对反应的影响以及对不同机理模式中各基元步骤的热力学趋动力的研究均表明,反应由决速的电子转移引发,随后通过快速的氢原子转移而形成产物。动力学活化参数的分析指出,电子转移前反应底物间首先形成一个预配合平衡。本文还对BNAH还原9-苯基xanthylium正离子和三苯甲烷正离子的机理进行了较合理的估测。     

生物合理方法设计合成新型除草剂

采用生物合理的方法设计合成了光合作用抑制剂及ALS酶抑制剂,根据绿色红假单胞菌(Rps.viridis)光合反应中心X-衍射的晶体结构同源模建了高等植物豌豆(Pisumsativum)D1蛋白的结构模型,及其与抑制剂氰基丙烯酸(酰胺)与氢化脲嘧啶的复合物模型。研究了D1蛋白与抑制剂可能的作用位点。为了提高筛选的力度,还应用Wang树脂引入了组合合成的方法。对三类ALS抑制剂进行了2D-QSAR,3-DQSAR,作用模型及新抑制剂的设计研究。     

Electron transfer reaction of 4,4′-bipyridine with triethylamine in acetonitrile: effect of water addition on the reaction dynamics

The photo-induced electron-transfer reaction of 4,4-bipyridine (BPY) with triethylamine (TEA) in acetonitrile is studied by laser flash photolysis. The reaction mechanism and kinetics are found very sensitive to the presence of a small amount of water. At low water concentrations (i.e. <0.003 M), an extremely fast-rising metastable product is detected for the first time. A triplet charge transfer complex (³ECT) is found to be the primary intermediate preceding the electron transfer process. Up to about 0.1 M, water facilitates the electron transfer rate, whereas higher water concentrations retard the rate of electron transfer. The Stern-Volmer plot of the triplet decay rate versus the TEA concentration is consistent with the presence of ³ECT in equilibrium with the free excited triplet state of BPY.     

乙烯基溴化镁与苯基取代氯甲烷的单电子转移反应

本文研究了CH2=CHMgBr(1)与Ph3CCl(2)的反应,反应产物为Ph3CH3(3)(81%),CH≡CH(4)(74%),三苯甲基过氧化物(6)(4%),微量的三苯基丙烯(7)和对二苯甲基-四苯甲烷(8),结果表明1具有还原性,检测反应混合物得到三苯甲基自由基的ESR谱和1-二苯甲叉-4-三苯甲基-2,5-环己二烯(9)4-位氢增强吸收的CIDNP效应,用苯乙烯进行捕获实验只减少3的量而对4无影响。根据实验结果对1的还原性进行了讨论,提出1向2发生单电子转移的反应机理,Ph3C.和.MgBr之间发生S-T0混合,极化的Ph3C.与另一Ph3C.的偶联造成9的极化,由2和Ph2CHCl(10)的接受电子的强弱讨论了1与2及1与10的反应所表现的不同行为。根据Kaptein的符号规则解释了9和四苯乙烷(11)的CIDNP效应。     

新型酪氨酸激酶小分子抑制的三维药效团研究

通过CATALYST软件包得到了两类HER2抑制的三维药效团模型。尽管亚苄基丙二腈化合物和3-取代吲哚啉-2-酮系列化合物具有完全不同的骨架结构,但得到的药效团却具有共同的特性,这表明当这两类抑制剂和受体发生相互作用时,采用了相似的结合模式。共同的药效团模型包括一个氢键受体,一个氢键给体,一个脂肪类疏水团以及一个芳香类疏水团。根据药效团模型,我们还进行了三维构效关系的研究,结果表明得到的药效团模型具有很好的预测能力(线性回归系数R≈0.96)。药效团模型对于研究酪氨酸激酶小分子抑制剂的结构与活性关系,以及评估和预测此类未知化合物活性具人重要的意义。     

A novel 1,8-naphthalimide probe: synthesis and interactions with nucleic acid and its precursor

Three novel, water-soluble N-substituted 1,8-naphthalimides as the spectroscopic probes of nucleic acid, N-(2-hydroxyethyl)-1,8-naphthalimide (NI1), 1,8-naphthalimide-N-acetic acid (NI2) and 1,8-naphthalimide-N-caproic acid (NI3), were synthesized and photophysically characterized. The steady-state fluorescence quenching of the NI probes with nucleic acids (NA) and their precursors (nucleobases and nucleosides) were studied by Stern–Volmer correlation. The rate constants for bimolecular quenching were obtained in Tris buffer solution. The transient absorption spectroscopy by nanosecond laser flash photolysis were explored to identify the transient species and to determine the kinetics. The dynamic interaction mechanism was attributed to electron transfer (ET) and energy transfer via ³NI.     

竹红菌甲素光敏氧化反应机制

本文报道了在竹红菌甲素的光敏氧化反应中, 原初反应产生了^1O2、O2和H2O2,在一些还原性底物(5-羟基色氨酸、色氨酸、组氨酸、蛋氨酸和赖氨酸等)的存在下, 体系中形成的O2量大大增加。证明了体系中的^1O2是通过三重态的竹红菌甲素和基态氧进行能量传递形成的, O2是体系中的竹红菌甲素负离子自由基和基态氧进行单电子转移的结果, H2O2是体系中存在的竹红菌甲素二价负离子还原基态氧的产物。在一些底物存在下, 次级反应产生了.OH。我们也发现竹红菌甲素具有弱的抽氢能力而生成一些有机自由基, 这些有机自由基的形成促进了各种活泼态氧的相互转化, 因此我们认为竹红甲素的光敏氧化是各种活泼态氧和一些有机自由基综合反应的结果。