投影边缘在硝基苯类化合物构效关系研究中的应用

在三维投影的基础上,对投影的边缘进行了描述,并以其进行了定量结构活性相关研究.实验结果表明,与Am指数、指示变量和量化参数相结合,可使其数学模型得到明显提高.通过人工神经网络对硝基苯类化合物的毒性进行预测,结果令人满意.     

人工神经网络用于对位取代苯酚定量构效关系的研究

本文利用误差反向传播(BP)的人工神经网络(ANN)模型研究了对位取代苯酚衍生物的生物活性与其结构及物理化学性质参数之间的定量构效关系。优化了ANN模型的参数设计,提出了动态调节网络学习速率的经验规则以改善网络的性能。采用f(x)=1/(1+e~(-x))作为网络节点的输入输出转换函数的三层神经网络具有较佳性能,当取隐含节点数为10时,该网络预测26个对位取代苯酚衍生物生物活性的均方误差(mse)为0.036,优于常规构效关系预测结果。     

分子电性距离矢量用于三嗪类化合物的构效关系研究

采用分子电性距离矢量(Molecular Electronegativity Distance Vector,MEDV)表征了三嗪类化合物的分子结构,并运用多元线性回归(Multiple Linear Regression,MLR)建立了该类化合物结构与其发光菌和大型蚤毒性的定量结构-毒性相关(Quanti-tative Structure-Toxicity Relationship,QSTR)模型,同时采用留一法交互检验对所建模型进行了分析和验证,建模计算值的相关系数R分别为0.970和0.952,留一法交互检验预测值的相关系数RLOO分别为0.917和0.921,并进一步阐述了结构与毒性之间的关系。结果表明,三嗪环上π电子离域程度减小有利于毒性增加,侧链N上取代基数目增加,化合物毒性减小。为进一步预测该类化合物的毒性,进行药物筛选提供了有效的理论依据。     

本征型聚酰亚胺介电常数的定量构效关系模型构建与研究

综合运用量子化学方法及基团贡献法,采集了78种不同化学结构聚酰亚胺的结构参数.采用通径分析法从16种参数中筛选出了对介电常数具有显著影响的8种结构参数,在此基础上,构建了2种针对聚酰亚胺介电常数的定量构效关系模型,平均相对误差均在10％以内.研究认为影响聚酰亚胺薄膜介电常数的最重要因素为分子体积,从宏观角度来看即体系的...     

楝酰胺(Rocaglamide)类化合物的三维定量构效关系

采用比较分子力场分析(CoMFA)和比较分子相似因子分析(CoMSIA)方法,对训练集中的26个楝酰胺(Rocaglamide)类化合物进行了三维定量构效关系(3D-QSAR)研究,最终建立的CoMFA模型和CoMSlA模型的q<'2>分别为0.593和0.656.并对测试集中的5个化合物的生物活性进行了预测,结果表明...     

苯甲酸类化合物小鼠经口LD50定量构效关系的研究

采用化合物定量结构-毒性效应关系(QSTR)方法研究了39个苯甲酸类化合物的各种量化参数对小鼠经口急性毒性(LD50)的影响,并建立了毒性预测模型.为了得到更准确的毒性预测模型,各个参数的交叉项同时考虑在内,利用线性回归方法得到了苯甲酸类化合物小鼠经口急性毒性预测模型(相关系数为0.958 2).该模型具有很好的预测能力.     

手性羟酸和氨基酸类化合物的构效关系研究

构造了用于手性参数衍生的距离矩阵和扩展的距离矩阵, 并且观察了与羟酸类和氨基酸类化合物手性薄层色谱保留指数的相关性, 得到了具有启示性的结果. 引进了扩展的eAm指数和连乘指数, 以及综合运用了三种算法. 所得参数进行了多元回归分析, 得到了单一变量和变量组合的分析结果. 与多元回归分析相比较, 运用人工神经网络法, 使结果得到了较大的改善. 所引进的方法对于化合物构效关系研究具有普遍可用性.     

苯胺类化合物结构-毒性定量构效关系研究

为定量预测环境中有害有机苯胺类化合物的毒性, 计算了量子参数和拓扑指数等, 进行了回归分析和人工神经网计算, 得到了较好的结果. 用CoMFA实施了三维构效关系研究,发现在常规CoMFA立体和静电参数的基础上, 引进分子生成热, 可使结果得到很大程度的改善, 不仅可得到较好的定量数学模型, 同时为探讨该类化合物毒性作用机理提供了依据.     

α—取代乙酰胺类化合物结构与除草活性的构效关系研究

分别研究了Ｎ，Ｎ－二取代－α－氯代乙酰胺类化合物及Ｎ，Ｎ－二取代－α－二硫代磷酰基之酰胺类化合物结构与除草活性的定量关系，结果表明，氮原子上取代基的大小对两类化合物的除草活性具有相同的影响，只是最适宜的疏水性不同，两类化合物可能具有相同的作用机制。     

广义二面角在定量结构/活性相关分析中的应用

化合物的结构与其活性具有相关性 .建立相关性需要由结构提取特征 ,并运用这些特征作为自变量去构造数学模型 ,以便预测未知的化合物及其活性 .目前 ,在诸多 3D- QSAR方法中 ,应用最为广泛的是 Co MFA( Comparasive Molecular Field Analysis)方法 [1～ 3] ,但新近的研究发现 ,Co MFA方法对于某类化合物 (如苯胺类化合物 )适应性较差 ,但分子在三维空间投影面积及量化参数的引入可大大改善所得结果[4 ] .本文从另一角度 (即广义二面角 )研究了分子在三维空间的形状 ,得到了满意的结果 .1　实验部分本文选用 34个 1 - [( 2 - Hydroxy…     

Three-dimensional structural features and the toxicity of aminobenzenes and phenols

There are many organic pollutants in the environment, such as polychlorinated biphenyl, polycyclic aromatic hydrocarbons, dichlorodiphenyl-trichloroethane (DDT), and polychlorinated naphthalene. These organic pollutants are persistent,liposoluble and easily cumulated in organism; consequently, the potential toxicity will be high. Risk assessment of industrial chemicals is currently carried out using scanty experimental data, because many of these chemicals have very little or no test data. S…     

原子对空间距离法及其应用

采用原子对空间距离法表征化合物的三维结构信息. 提出了计算端点的频数的方法, 与段的频数相比, 该方法能更好地描述原子对频数. 以不同段的距离, 分别采用上述两种频数计算得到化合物的相似度矩阵, 然后把相似度衍生为新的变量. 运用多元回归分析和人工神经网络分别构造了预测数学模型, 并对所得到的预测结果进行了比较. 这两种频数均较好地预测了HEPT类化合物的活性.     

自组织神经树用于3－甲基芬太尼衍生物构效关系的研究

用自组织神经树方法研究３－甲基芬太尼衍生物的镇痛活性与其结构特征参数间的非线性关系，结果表明：该网络性能良好、识别成功率高，可望成为药物构效关系研究的有效辅助手段。     

一种新三维描述子用于Nevirapine类抗艾滋病药物定量构效关系的研究

运用三维全息原子场作用矢量(3D-HoVAIF)对33个Nevirapine类抗艾滋病药物进行了定量构效关系(QSAR)研究。采用偏最小二乘回归(PLSR)建立定量构效关系模型,同时采用内部及外部双重验证的方法对所得模型稳定性能进行深入分析和检验,所建模型的复相关系数(Rcum2)、留一法(LOO)交互校验(CV)复相关系数(Qcum2)和外部样本校验复相关系数(Qext2)分别为0·835、0·530和0·518。结果表明,3D-HoVAIF能较好表征Nevirapine类抗艾滋病药物分子结构信息,且所建模型具有较好稳定性能和预测能力。     

原子三角法在定量结构/活性相关分析中的应用

分子相似度;回归分析;人工神经网络;原子三角法在定量结构/活性相关分析中的应用