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基于稳定同位素标记与质谱分析的蛋白质定量算法研究进展 总被引:1,自引:1,他引:0
蛋白质定量研究已成为蛋白质组学的热点,它是疾病相关生物标志物发现的重要途径.基于稳定同位素标记的质谱分析技术是蛋白质定量最常用的方法之一.随着实验方法的发展和改进,定量数据处理方法也在不断更新与完善.一般来说,定量数据处理包括四步:搜库鉴定、图谱定量信息提取与计算、肽段丰度比计算和蛋白质丰度比计算及差异显著性分析,其中后三步是数据处理的核心.目前,后三步中每步都有多种可选算法,这些算法一般都是针对特定实验技术而提出的,缺乏深入的工作对它们进行系统比较和优化.为此,在总结目前主要实验技术方法的基础上,论述了定量算法的现状和存在问题,并针对一些问题提出了可行的解决办法. 相似文献
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高分子材料拥有众多优良的特性,使其广泛应用于现代社会的生产、生活及高新科技等领域。对于高分子特性的研究离不开微观物理、化学结构的定量表征。在众多表征高分子结构定量信息的实验技术中,固体核磁共振(SSNMR)发挥着重要的作用。它可以定量表征高分子的化学结构、材料体系的相成分及共混组分等,从而实现了难溶高分子产物的结构鉴定,以及高分子微观物理、化学结构关联材料性能的研究。然而,传统的SSNMR定量方法(直接激发法,DD)往往需要耗费十几个小时甚至数天的实验时间。交叉极化方法(CP)虽然大大缩短了实验时间,却往往无法提供定量的信息。基于此,研究者们提出了多个定量CP的实验方法,同时满足了方法定量性和实验耗时短的需求。本文综述了传统SSNMR定量方法及几种定量的CP方法,简单介绍了每个方法的基本原理,并平行阐述了实验方法的应用范围及特点,通过部分实例展示了SSNMR定量方法在高分子材料领域的应用价值,为研究者研发新型的高分子材料提供可靠并有效的结构表征手段。 相似文献
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通过对《化学教育》2015年第9期文章《一个定性到定量实验的创新案例——"压强对化学平衡的影响"实验改进》的探讨和12次定量实验验证,创新了NO_2气体制备、充装方法,并对该改进实验中不可忽视的4个细节问题提出解决方案,从实验数据不具备可重复性的角度,说明该实验"从定性到定量"的设想在实际中是不可能达成的。 相似文献
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化学定量实验是以定性实验为基础的研究活动,有利于培养学生严谨务实、认真规范的科学精神,有利于培养学生分析问题、解决问题的能力。通过定量实验的探究可以引导学生构建方案设计、简约表征、误差分析、实验创新等方面的策略性知识。 相似文献
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本文提出了电子亲合力与诱导效应之间的定量关系。通过计算说明了电子亲合力与诱导效应的定量相关比电负性与诱导效应的定量相关好得多;并应用其定量关系式预测尚未实测到的取代基的电子亲合力值;根据计算结果, 可从不同实验方法测得的电子亲合力值中选择正确的实验值。该定量关系式能更加准确和定量地表征出诱导效应的作用。 相似文献
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在搭建初中定量实验分析的思维模型的基础上,以“测定混有碳酸钠的氯化钠样品中碳酸钠含量”教学为例,在 “总问题”与“子问题”驱动下,引导初中生逐步建立解决定量实验问题的一般方法,提升对定量实验的设计、评价与改进能力,形成具有迁移价值的关键性能力。 相似文献
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《化学分析计量》2009,(1)
Eppendorf最新推出专为定量PCR实验设计的twi n.tec荧光定量PCR板、8联管及MasterclearTM8联管盖。其独特的白孔和嵌入式管盖设计,可以帮您显著提高实验的灵敏度和重复性,并有利于开展微量体系的定量PCR。进行微量体系定量PCR最大的限度往往取决于管内的荧光强度。Eppendorf twi n.tec荧光定量PCR板及8联管的白孔设计,相比普通板或8联管的磨砂孔和透明孔设计,反射荧光的能力更强,可以将荧光信号强度提高10倍,从而提高实验的灵敏度。此外,白孔可以显著减少背景信号的干扰,提高实验结果的重复性和均一性。在定量PCR实验中,使用twi n.tec荧光定量PCR板和8联管,还可以降低探针的使用量,节省实验成本。而采用微量的反应体系,也是节约成本的一个好方法,不仅节省试剂,还可以节省珍贵的样本。Eppendorf MasterclearTM8联管盖为您的定量PCR带来进一步的优势,巧妙的嵌入式管盖设计,防止光学表面被刮伤或污染,并降低反应管的容量,减少蒸发。极薄的管盖设计,使透光率高达90%以上,方便在标准管中开展小反应体系的实验。(中国化工仪器网)定量独享——Eppendorf... 相似文献
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论述了思维能力及定量实验在培养学生思维能力方面的意义和方法,尝试运用交互仿真智能性定量实验课件,通过创设问题情境,实施探究性学习,来培养学生的思维能力,并以“实验测定酸碱滴定曲线”为例阐述该方法的应用。 相似文献
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蛋白质定量是探索疾病发生发展状况和寻找新药靶标的重要手段。在shotgun蛋白组学中,目前常用定量方法包括综合同位素标记后的质谱峰强度方法和无标记定量方法。根据数据类型无标记定量方法可以分为两类:基于鉴定蛋白的质谱数的方法和基于质谱峰强度的方法。本研究主要用EM算法改进基于鉴定蛋白质谱数的定量方法,并用免疫印迹实验获得的酵母全蛋白的丰度来验证EM算法改进后定量的有效性结果表明,改进后的质谱数和蛋白丰度的相关性比改进前有一定的提高。同时,利用这些数据对主要的几种基于鉴定蛋白的质谱数的模型进行了比较,发现PAI模型最好,SpS模型次之,emPAI模型最不适合于蛋白质定量。 相似文献
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前三章的化学实验,均属于定性实验,本章要通过多种化学定量实验的观察与思考,得出质量守恒定律。 相似文献
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极化效应指数与脂肪酯类化合物沸点的定量构效关系研究 总被引:1,自引:0,他引:1
基于烷基极化效应指数(PEI)构建了有效碳原子数(NCeff)用于定量表示烷基碳链相对长度. 用最佳子集回归方法建立了脂肪酯沸点与PEI, NCeff参数的定量构效关系模型, 该模型对训练集计算值与实验值的相关系数R2为0.9958, 标准偏差s为3.98 K, 对测试集预测值与实验值的相关系数R2分别为: 0.9958, 标准偏差s为3.92 K, 计算结果表明基于参数PEI和NCeff所建立的脂肪酯类化合物的沸点定量构效关系模型具有良好的预测能力. 相似文献