苯基噻唑衍生物对细胞增殖抑制活性的QSAR模型

基于拓扑化学理论,原子类型电拓扑态指数(E_n)和电性距离矢量(M_k)被用于表征19种苯基噻唑衍生物的化学微环境。采用最佳变量子集回归方法,分别建立上述化合物对HT29(人结肠癌细胞系)、Hela(人宫颈癌细胞系)和Karpas299(人淋巴瘤细胞系)的体外细胞增殖抑制活性(L_i:L_t,L_e,L_a)与E_n和M_k的定量构效关系(QSAR)模型。它们的最佳三元QSAR模型的判定系数(R~2)依次为0. 865、0. 924、0. 937,逐一剔除法交叉验证相关系数(R_(cv)~2)依次为0. 679、0. 898、0. 878。经R_(cv)~2、V_(IF)、F_(IT)、A_(IC)等统计指标检验,该模型具有良好的稳健性及预测能力。结果显示—CH_3、—CH_2—、—NH—、—N=(芳环中)和—OH等分子结构单元直接影响这些化合物的抑制活性。据此提出苯基噻唑衍生物分子与生物受体之间的主要作用是疏水作用、氢键。此与文献[1]的分子对接结果基本一致。     

基于人工神经网络研究芳胺喹唑啉衍生物的抗胃癌活性

基于分子电性距离矢量(M1)表征21个芳胺喹唑啉衍生物的分子结构,并与其对人胃癌细胞的抗癌活性(pI)关联.通过最佳变量子集回归方法建立上述化合物抗胃癌活性的三参数(M15、M18、M82)定量构效关系模型.其交叉验证系数(R2cv)、非交叉验证系数(R2)依次为0.386和0.737.通过R、R2cv.、VIF等检验...     

基于ANN研究芳烷基哌嗪衍生物的镇痛活性

基于13种原子类型的分子电性距离矢量(Mt)表征16个芳烷基哌嗪衍生物的分子结构,并与其对小鼠在热板模型中的镇痛活性(lnAN)关联.通过最佳变量子集回归方法建立上述化合物镇痛活性的三参数(M7、M14、M21)的QSAR模型.其相关系数(R)和F统计值依次为0.856和11.101.通过R、F、VIF等检验,上述模型...     

苯甲酰胺衍生物对Hh信号通路抑制的理论研究

基于拓扑方法计算了16种嘧啶吗啉苯甲酰胺衍生物的电性距离矢量(Mt)。通过最佳变量子集回归建立其对Hedgehog信号通路抑制活性(IC50)与Mt的最佳三元数学模型(QSAR),其判定系数(R2)及逐一剔除法的交叉验证相关系数(Rcv2)分别为0.832、0.600。经Rcv2、VIF、FIT、AIC等检验,该模型具有良好的稳健性及预测能力。根据进入此模型的M66,M18,M2可知,影响嘧啶吗啉苯甲酰胺衍生物对Hedgehog信号通路抑制活性的主要因素是分子的二维结构特征CH3-、-CHf-、-NHg-、N-和HO-等结构碎片。     

硫色烯并噻唑胺类衍生物对乙酰胆碱酶抑制活性的QSAR模型*

基于化学拓扑理论,计算20 种硫色烯并噻唑胺类衍生物分子的电性距离矢量指数(m_t)。经最佳变量子集回归方法建立上述分子对电鳗乙酰胆碱酶体外抑制活性(pM)与m_t的最佳三元QSAR模型,其判定系数(R₂)和逐一剔除法交叉验证系数R_cv2依次为0.936和0.850。通过R₂、R_adj2、F、R_cv2、V_IF、A_IC、F_IT等检验,该模型具有令人满意的稳健性和预测能力。依据模型建议硫色烯并噻唑胺类衍生物对电鳗乙酰胆碱酶体外抑制的可能机理：分子疏水性起到主要及正向作用,氢键则起次要且为负向作用。     

7,10-位取代喜树碱衍生物的QSAR研究

利用密度泛函理论(DFT)在杂化泛函B3LYP和基组6-311G(d,p)水平下对7,10-位双取代喜树碱衍生物(CPTs)进行了构型优化,计算出分子的电子结构描述符,利用Chemoffice 8.0软件计算出几个相关的物化描述符;采用逐步多元回归法对该组化合物的抗癌活性与分子描述符之间建立了定量结构-活性关系(QSAR)模型。所建最佳三参数QSAR模型的复相关系数R=0.951;用留一法(leave-one-out,LOO)进行交互检验,得到交互检验系数RCV2=0.778。结果表明,所得QSAR模型具有良好的预测能力,而且影响药物活性的主要因素有化合物分子的结构、最高占据和最低空分子轨道能量差及13-位碳原子的净电荷。     

氟喹诺酮C-3均三唑衍生物抗增殖活性的QSAR研究

基于拓扑化学理论,用原子类型的电性拓扑状态指数(E_A)描述了48个氟喹诺酮C-3均三唑衍生物分子的化学微环境。基于E_A和最佳变量子集回归,建立上述化合物对人白血病细胞(HL60)的抗增殖活性(pH)的定量构效关系(QSAR)模型。其最优四元(E₈、E₁₃、E₁₉、E₄₂)模型的判定系数(R²)和逐一剔除法交叉验证系数(R_cv²)分别为0.853和0.813。经R²、R_cv²、F_IT、A_IC、F、V_IF等统计指标检验,所建模型具有良好的稳定性、相关性和预测能力。结果显示影响氟喹诺酮C-3均三唑衍生物对人白血病细胞(HL60)的抗增殖活性的主要因素是与靶标形成氢键,以及配位和疏水作用。     

红景天苷衍生物的合成及其抗氧化活性

以酪醇为原料，通过K-K法合成了3个红景天苷衍生物：苄基酪醇-β-D葡萄糖苷、苄基酪醇-β-D半乳糖苷及苄基酪醇-β-D七乙酰麦芽糖苷，其结构经¹H NMR和¹³C NMR表征。采用还原力法及DPPH自由基清除法，考查了化合物的体外抗氧化活性。结果表明：不同浓度的红景天苷及其衍生物均具有还原能力及清除DPPH自由基的活性，且活性强弱与浓度成正比。     

青霉烯二茂铁衍生物的合成与抗菌活性研究

为了探寻更具活性的青霉烯类抗生素,设计并合成了8个新的青霉烯二茂铁衍生物,并进行了结构表征与确认.采用琼脂平皿二倍稀释法测定了它们和法罗培南对金黄色葡萄球菌等菌种的最小抑菌浓度(MIC),并对此类化合物的构效关系进行了探讨.结果显示,C-2位被二茂铁基团取代的青霉烯类化合物的抗菌活性优于法罗培南或与其相当,尤其是含有杂环取代基的化合物8h抗菌活性显著.     

2-嘧啶氧基-N-芳基苄胺类化合物的ALS抑制活性的QSAR研究

乙酰乳酸合成酶(ALS)或乙酰羟酸合成酶(AHAS)存在于植物的生长过程中, 很多此类酶的抑制剂实际上作为除草剂被广泛用于农业生产中. 生物活性测试结果表明, 2-嘧啶氧基-N-芳基苄胺类化合物对ALS具有一定的抑制活性. 在此基础上, 我们用两种三维定量构效关系(3D-QSAR)研究方法: 比较分子立场分析(CoMFA)和比较分子相似性指数分析(CoMSIA), 对该类化合物进行了3D-QSAR研究, 并建立了相关的预测模型. 其中, CoMFA模型的交叉验证相关系数(r_cv²)为0.801, 非交叉验证相关系数(r²)为0.947, 标准偏差(s)为0.136, F值为133.371. CoMSIA模型的r_cv²为0.744, r²为0.883, s为0.202, F值为56.472. 计算结果表明, 2-嘧啶氧基-N-芳基苄胺类化合物与ALS抑制活性有一定的相关性. 获得的CoMFA和CoMSIA模型, 将应用于指导该类化合物的设计.     

QSAR Study on Some N-[5-（2-Furanyl）-2-methyl- 4-oxo-4H-thieno[2,3-d]pyrimidin-3-yl]-carboxamide and 3-Substituted-5-（2-furanyl）-2-methyl-3H-thieno- [2,3-d]pyrimidin-4-ones Using Three-dimensional Holographic Vector of Atomic Interaction Field

Study on the quantitative structure-activity relationship （QSAR） of 26 compounds, N-[5-（2-furanyl）-2-methyl-4-oxo-4H-thieno[2,3-d]pyrimidin-3-yl]-carboxamide and 3-substituted- 5-（2-furanyl）-2-methyl-3H-thieno[2,3-d]pyrimidin-4-ones, with three-dimensional holographic vector of atomic interaction field （3D-HoVAIF） was carried out. SMR-PLS QSAR models have been created and good correlation coefficients and cross-validated correlation coefficients were obtained. The result shows that the models have good prediction capability and favorable stability and the 3D-HoVAIF is applicable to the molecular structural characterization and biological activity prediction.     

5-芳甲氧基-3(2H)-哒嗪酮衍生物的设计、合成与生物活性

为寻找新型昆虫生长调节活性化合物, 设计合成了15个未见文献报道的5-芳甲氧基取代的3(2H)-哒嗪酮衍生物, 所有化合物结构均通过¹H NMR, IR和元素分析确证. 初步生物活性研究表明, 化合物8o对2龄家蝇幼虫有明显的抑制作用; 化合物8a, 8c, 8g和8j对3龄蝗蝻显示出较好的生物活性. 对目标化合物的构效关系亦进行了初步探讨.     

具有除草活性的3-(嘧啶基-2)-1,3,4-噁二唑-2(3H)-酮衍生物的设计、 合成与定量构效关系的研究

设计合成了一系列未见文献报道的5-叔丁基-3-[4-取代-5-(氢)甲基嘧啶-2-基]-1,3,4-噁二唑-2(3H)-酮的衍生物, 其结构均经过1H NMR, IR和元素分析表征. 生测结果显示, 部分化合物表现出较好的除草活性. 定量的结构与活性关系研究表明, 它们的除草活性与取代基的立体效应参数和电性参数呈现很好的相关性, 相关系数r大于0.8. 当作用对象为油菜时, 化合物的活性可能主要与取代基R2的邻位立体效应参数Es和电性参数相关; 当作用对象为稗草时, 化合物的活性主要与取代基R2邻位立体效应参数Es和间位取代基电性参数相关.