Tau蛋白丝氨酸磷酸化修饰位点的特征分析与识别

基于信息熵,融合氨基酸的物理化学性质、蛋白质的二级结构和残基的无序信息构建了Tau蛋白丝氨酸磷酸化修饰位点预测的新模型。分别探讨了每种特征对Tau蛋白丝氨酸磷酸化修饰位点的影响,特征分析结果表明,氨基酸的序列模体、卷曲结构和无序区域均有助于识别丝氨酸磷酸化修饰位点。通过10倍交叉验证,丝氨酸磷酸化修饰位点预测的准确率和马氏相关系数分别达到83.7%和65.1%,表明本文构建的模型可用于对Tau蛋白丝氨酸磷酸化修饰位点的有效预测。     

欧前胡素对酪氨酸酶的抑制作用及机制

采用紫外、荧光和圆二色光谱法并结合分子模拟技术研究了欧前胡素对酪氨酸酶的抑制作用及其机制。结果表明,欧前胡素是一种可逆的混合型抑制剂,半数抑制浓度(IC50)为7.90×10-5 mol·L-1。欧前胡素通过静态型方式猝灭酪氨酸酶的内源性荧光,两者有一个结合位点。25℃时结合常数为2.90×103 L·mol-1,疏水作用力是驱动两者结合的主要作用力。同步荧光和圆二色谱分析表明,欧前胡素对酪氨酸酶中酪氨酸和色氨酸残基周围的微环境几乎不产生影响,但导致酪氨酸酶二级结构变得松散。分子模拟显示,欧前胡素占据酪氨酸酶的活性中心位点,并与His244,Val283,Val286,His263等氨基酸残基相互作用,阻碍了底物结合到酶的活性中心,从而降低酪氨酸酶的催化活性。     

四羧基锰(Ⅲ)酞菁与ONOO-的相互作用

研究了四羧基锰（Ⅲ）酞菁（Mn（Ⅲ）TcPc）与ONOO^-的相互作用及其对ONOO^-硝基化酪氨酸（Tyr）和损伤DNA的影响．结果表明Mn（Ⅲ）TcPc能与ONOO^-作用，并可促进ONOO^-对Tyr的硝基化，该硝基化作用能被谷胱甘肽（GSH）或抗坏血酸（Vit C）等生物还原剂抑制；该硝基化作用与pH值有关，以pH7为最合适，Mn（Ⅲ）TcPc能抑制ONOO^-对DNA的损伤作用，GSH对Mn（Ⅲ）TcPc有还原作用，并对上述的促进或抑制Tyr硝基化反应的机理进行了理论解释。     

利用可及表面积研究朊病毒结构的变化

利用Monte-Carlo模型并根据PDB提供的关于朊病毒氨基酸残基的原子坐标，对朊病毒蛋白质121－230位氨基酸的可及表面积（ASA）进行了计算和分析，讨论了相似的三维结构具有相近的可及性，并从PrP^c溶剂表面可及性特点分析了一些从PrP^c转变到PrP^Sc的可能信息。     

根皮素对酪氨酸酶活性与构象的影响

利用紫外、荧光光谱和圆二色光谱并结合分子模拟技术研究了根皮素对酪氨酸酶的抑制作用及分子构象的影响。研究结果表明,根皮素是一种可逆性混合型抑制剂,半数抑制浓度IC50=（5.84±0.35）×10-1mol·L-1,根皮素的加入可以猝灭酪氨酸酶的内源性荧光,两者有一个结合位点,298 K时的结合常数为2.62×104 L·mol-1,氢键和疏水作用力是驱动根皮素与酪氨酸酶结合的主要作用力。根皮素对酪氨酸酶中酪氨酸和色氨酸的微环境几乎不产生影响,但会引起酪氨酸酶二级结构发生改变。分子模拟结果显示,根皮素分子插入到酪氨酸酶的活性中心与周围的氨基酸残基形成4个氢键,占据活性中心位点,阻止底物结合到活性中心,从而导致酪氨酸酶催化活性下降。     

GlutPred:一种新型蛋白质戊二酰化位点的在线预测工具

蛋白质戊二酰化是一种新型的蛋白质翻译后修饰(PTM),它可以协调各种生物过程。计算预测方法可以提供快速、准确和有效的方法识别各种类型的PTM位点。然而,目前尚未见赖氨酸戊二酰化的在线预测工具报道。一个氨基酸可以由多个mRNA密码子编码,因此mRNA序列比蛋白质序列更为复杂,这种信息与戊二酰化的PTM的关系是什么?为了构建在线预测工具并回答此问题,本文收集了来自小鼠的蛋白组织的实验验证的蛋白质戊二酰化位点,在NCBI数据库中搜索这些位点的蛋白名对应的mRNA序列。通过蛋白质或mRNA序列信息,利用一个简单的矩阵构建了蛋白质戊二酰化位点的预测算法,并开发了蛋白质戊二酰化位点的在线预测工具GlutPred。     

硝基芳烃对斜生栅列藻毒性的定量构效关系研究

用DFT-B3LYP方法分别在ST()-3G,6-31G*,6-311G**基组水平上对25种硝基芳烃化合物进行全优化计算获得了相应量子化学参数,利用线性逐步回归法(LSR)建立硝基芳烃对斜生栅列藻毒性的定量构效关系(QSAR)模型,采用内部及外部双重验证的办法深入分析和检验模型的稳健性,选出最佳模型.与此同时,利用人工神经网络误差反传算法(BP网络)建立了非线性QSAR模型.LSR和BP建模的复相关系数(R2),去一法(LOO)交互检验复相关系数(R2cv),外部预测样本复相关系数(R2ext)分别为0.926,0.866,0.843和0.938,0.763,0.843,表明所建立的QSAR模型的稳定性和预测能力良好.结果表明:硝基芳烃对斜生栅列藻的毒性与次最低空轨道能、最正的硝基净电荷和前沿轨道能级差的相关性较好.     

北美海蓬子甜菜碱醛脱氢酶基因的克隆及表达载体构建

以北美海蓬子种子为材料, 采用RACE技术获得北美海蓬子BADH基因的cDNA全长序列. 结果表明: BADH基因cDNA全长为1836bp, 其中开放阅读框(ORF)为1503bp, 编码500个氨基酸, 预测蛋白的分子量为54.5kDa, 理论等电点为5.31. 推测出BADH氨基酸中含有甜菜碱醛脱氢酶家族高度保守的十肽序列(VTLELGGKSP)及与酶功能相关的半胱氨酸残基(Cys). 序列比对和系统进化树显示, 北美海蓬子与盐节木和盐穗木的亲缘关系最近, 同源性达94%. 并构建了植物表达载体pCAMBIA3301-BADH, 将其成功导入到农杆菌EHA105中, 为进一步研究该基因的功能奠定了基础.     

褪黑素和芦丁抑制蛋白质硝基化的比较研究

以牛血清白蛋白为硝化底物、过氧亚硝酸为硝化试剂,研究了褪黑素和芦丁对蛋白质硝基化的抑制作用.通过对硝基化反应各种影响因素的探讨,发现在37℃,pH 7.2,反应时间90 min以及过氧亚硝酸浓度为6.0×10~(-4)mol/L时,硝基化反应进行最完全.实验分别在硝基化反应进行前、进行中以及反应后,在硝基化反应体系中引入不同浓度的抑制剂褪黑素和芦丁.结果显示,在硝基化反应发生前加入抑制剂,抑制硝基化反应的效果最为明显;当褪黑素和芦丁的终浓度为5.0×10~(-5) mol/L时,抑制率分别达到80.7%和52.4%;若继续增加褪黑素,抑制率几乎不再变化,继续增加芦丁,抑制率小幅上升后开始呈下降趋势.总的来说,褪黑素抑制蛋白质硝基化的效果明显好于同浓度的芦丁.     

信息熵在教学水平调查问卷中的研究与应用

将信息熵引入教学水平评估中,利用信息熵度量不稳定信息的特性,降低了小部分错误和分歧对评价结论的影响,定义了评估因素覆盖较为全面完整的调查模型,权重采用信息熵法进行制定,根据信息稳定度来自动提高观点统一的评估项比重,使教学评估更为科学合理,符合客观实际情况。本研究成果可与现存研究方法相结合,弥补现存方法中的主观性过强的缺陷,对改进教师的教学水平、促进教学质量的提高具有一定的参考意义。     

多元代数方程组解的重数的计算

本文利用多项式理想对偶基的理论给出了当代数方程组只有孤立解(即零维理想的零点)时解的重数的一个算法,同时得到了零维理想有重零点的几个判定准则.     

三棱镜折射率测量结果的不确定度评定

根据不确定度的有关概念及具体实验教学模型 ,提出了测量不确定度的简化模式. 结合分光计 测三棱镜折射率的例子 ,进行了具体分析 ,给出了其测量不确定度的最终评定.     

2-氨基嘧啶标准摩尔生成焓的测定

采用量热法,用RBC Ⅱ型精密转动弹完全燃烧2 氨基嘧啶(AP),测定其恒容燃烧热,并根据热化学方程式和盖斯定律计算其标准摩尔燃烧焓ΔcH○———m(AP,s)为(-2334.51±1.62)kJ·mol-1,标准摩尔生成焓ΔfH○———m(AP,s)为(-45.90±1.70)kJ·mol-1,为进一步研究嘧啶类化合物的性质提供了理论基础.     

再论Γ-环由元素性质确定的根

本文在 Γ-环中继续研究由元素性质确定的根性质 .首先证明了文献 [1]中主要定理的逆定理 , 从而使满足某些条件的元素所具有的性质 P与根性质 R可互相确定 .进而讨论确定的唯一性问题.利用 这些结果可得出 Γ-环的 Baer根是由元素的 m-幂零性所确定的根.     

图书质量评估定量分析探讨

本文应用数量化理论———成对比较、九级分制和相关分析法,探讨了图书质量评估的问题, 为今后的 图书质量评估实践提供了一些理论依据     

声屏障衍射声场的近似计算

本文利用Huygens-Fresnel原理和Kirchoff近似理论,研究了声波通过屏障后的衍射声场,导出计算衍射声场的声压和声屏障插入损失的近似公式。计算表明,理论值和实验值基本一致。本文所提供的公式可以作为在噪声控制技术中预测声屏障衍射声场的一种方法。     

Banach空间的凸性模与光滑模

定义了TC凸性模，TC光滑模，刻划了一致凸性与一致光滑性，并研究了取值于Banach空间的特殊鞅不等式与一致凸性，一致光滑性的关系。     

一类0.1矩阵变换图的边连通性

Let U (R, S) denote the class of all m×n matrices of 0's and 1's havingrow sum vector R and column sum vector S. The interchange graph G (R,S)is the graph where the vertices are the matrices in U (R, S) and where twomatrices are joined by an edge provided they differ by an interchange. Brualdishowed that the connectivity of G(R, S) is at least two. In the present paperwe prove that the edge connectivity of G(R, S) is equal to the minimum degreeof vertices of G(R, S)     

一类中立型拟线性抛物方程组解的振动性

针对垂直相加法无法讨论泛函偏微分方程组的强迫振动性的不足，直接利用振动的定义、Green公式以及齐次Neumann边界条件把中立型抛物微分方程组的振动问题转化为泛函微分不等式不存存最终正解的问题，然后利用最终正解的定义及上下极限得到了在齐次Neumann边界条件下判别其所有解振动或全振动的充分条件。     

几类循环矩阵的对数矩阵及其计算

循环矩阵的对数矩阵的结构,之后对这些对数矩阵进行了分类,并设计了计算这几种循环矩阵对数矩阵的算法,这些算法与基于Schur分解的反scaling and squaring算法相比,在计算效率上有较大提高.