对"计算多环有机物中环数的捷径"一文的商榷

贵刊在 2 0 0 1年第 2期 41页刊载了“计算多环有机物中环数的捷径”一文。笔者认为原文中介绍的计算公式有误 ,就算修正之后没有误也不是什么捷径。在此想与原文作者商榷 ,请同行们指教。原文中计算公式为 :r=1 +1 / 2t+q………… (1 )式中r为环数 ,t为三级碳原子 (CH)数 ,q为四级碳原子 (C)数。按公式 (1 )需要知道三级碳原子、四级碳原子的数目才能计算出环数的结果。条件是只适用于不含任何取代基或功能团的饱和烃。笔者认为这个公式应修正为 :r=2 +1 / 2t+q………… (2 )也就是将原公式中 1改为 2 ,其计算结果才应多一个环才对。修正…     

桥环化合物环数的计算与命名

近年来,有关桥环化合物及具有笼形结构的脂环化合物的报道很多,合成了多种新型结构的化合物,给化学教学增添了新内容,引起了学生的很大兴趣.为便于教学,许多专家和学者对桥环化合物的环数计算进行了归纳总结[1-4].在修改本文时又高兴地看到2篇最新报道[5,6],这正说明大家在教学中遇到了同样的问题,从不同的角度去理解它.本文是根据对学生辅导时的体会写成的,因而,也许更通俗些.     

桥环化合物环数的计算方法

总结了 7种计算桥环化合物环数的方法。重点介绍了由A .Srikrishna提出的一种简便方法 ,并将此法应用于有机杂环化合物环数的确定 ,得到了满意结果     

一种计算桥环化合物环数的简便方法

陈亚元同志在“桥环化合物环数的计算方法”一文中,提出了几种如何计算比较复杂的桥环化合物环数的具体方法,同时还介绍了P.A.Reddy对桥环化合物中环数的计算公式c=b-a+1(c为环数,b为环上的键总数,a为环上的原子总数),从而为计算桥环化合物的环数提供了比较简便的方法。由于桥环化合物与桥头原子并存,而化合物中桥头原子的总数目(包括主桥头原子和次桥头原子)又与环数的多少密切相关,所以,可以用桥环化合物中桥头原子的总数来正确计算桥环化合物的环数。设一种桥环化合物中的桥头原子总数为N,环数为M,根据两个桥头原子可以构成一个双环的原则,推导出计算环数的一般公式:     

有机化合物分子不饱和度的计算

在推导有机未知物结构的时候,由分子式计算出不饱和度可以提供有用的信息。贵刊曾载文讨论不饱和度的计算[1]。     

多环芳烃水中溶解度的理论计算

建立了计算多环芳烃水中溶解度的数学表达式，用量子化学方法计算了7个多环芳烃的水中溶解度，计算结果与实验测定结果相符合．多环芳烃处于水体内体系状态能量愈高，其溶解度愈小，多环芳烃中的碳氢基团越多，溶解度越小．此时体系中的溶质呈单分子态，而不是聚集态．     

有机化合物脂水分配系数logP 的计算

logP作为有机化合物流水性的量反，在定量的效关系研究中扮演了重要的角色，广泛应用于生物化学、药学以及环境科学等各领域．运用计算的方法获得10gP值由于能够弥补实验方法的不足，在药物分子设计等应用中具有重要意义．随着计算机辅助药物分子设计的发展，高精度、简便易行的IOgPi十算方法日益受到重视．logP的计算方法见诸报导的已有多种［‘－7］．这些方法各具特色，但也都分别存在一些明显的缺点．目前流行的片段加合法［‘一句的出发点是将分手划分为基本片段，每个基本片段对10gP具有特定的贡献，但实际上相同片段对10gP的影响…     

多维多量子谱的图论表达与理论计算

基于对三周期多维核磁共振波谱量子相干转移过程的理论分析,给出对任意周期(即任意维数)核磁共振波谱的通用的图论表达。研究结果表明:用多叉树表达多维、多量子谱的实验量子相干转移过程时,树的分叉数对应于量子阶,而树深度对应于时间周期数。在此基础上,运用第一作者所建立的 HBA 算法,实现了多维多量子谱的理论推算。这对于蛋白质 NMR 谱解析研究中的峰与具体自旋子的指认过程具有极重要的意义。作者的算法在 Sun4/280工作站上以 C~(++)语言实现。     

有机化合物的氧化数

有机化合物的氧化数吴阿富（浙江医科大学药学系，杭州３１０００６）无机化合物、有机化合物的氧化还原反应在化学反应中占有重要地位￣［１］。但它们之间的反应机理略有不同：无机化合物的氧化还原反应有明确的电子转移，氧化剂获得的电子数等于还原剂失去的电子数；而...     

量子化学计算在有机化合物核磁共振教学中的应用

用量子化学方法计算化合物的核磁共振数据并与实验数据进行比较已经广泛应用于复杂天然产物构型的确定。以核磁共振教学为例,介绍量子化学计算在有机化合物波谱解析教学中的具体应用。通过计算核磁共振氢谱和碳谱的化学位移值,辅助解析分子结构,帮助学生对电子的分布、原子核的化学环境等有更直观的认识,有利于学生理解核磁共振的本质,有效提高学生的学习兴趣和积极性。同时,让学生了解量子化学计算在核磁共振中的应用,了解化学研究的前沿手段,开阔学生视野,培养学生解决实际问题的能力。     

含四元环的多环芳香化合物的研究进展

含四元环的多环芳香化合物通常能够表现出独特的光物理和化学性质,在很多领域具有潜在应用价值.分别针对线型、角型、螺旋型和环型含四元环多环芳香化合物的合成方法、分子堆积方式、光电性质及载流子迁移率等方面进行归纳总结.研究表明,表面合成法更利于制得规则形貌的多环芳香化合物;线型类分子表现出了较高的载流子迁移率;角型分子通常显...     

多环笼状骨架有机物的简易命名法*

将多环笼状骨架有机物在绘图软件ChemDraw中用“橡皮擦”分步擦去短桥转化为二环体系明确其主环和主桥头,其后在此化合物的结构式中用记号标明其主环和主桥头,按多环化合物的编号原则进行编号命名,即可得到此复杂结构有机物的命名。     

计算有机化合物脂水分配系数的新方法

A new method is presented for the calculation of octanol/water partition coefficients. On the basis of summation of atomic contributions, our algorithm, namely; XLOGP, also incorporate correction factors into the calculation. Multivariate regression analysis was performed on a training database of 1831 organic compounds with diverse structures to give the final model. The correlation coefficients for the whole set fitting is 0.968 and the standard deviation is 0.37. The result shows that our model is accurate enough for logP estimation in QSAR studies. Compared to other similar approaches, our method gives better results and is more convenient to use.     

Constructing Homodesmic Reactions for Calculating the Enthalpies of Formation of Organic Compounds

The mathematics and software of the homodesmic approach to calculating enthalpies of formation Δ_fH° of organic compounds are described. The program generates a set of independent homodesmic reactions for a studied compound, increasing the reliability of theoretical determinations of the standard enthalpy of formation. The basic steps of program construction, using the algorithm to determine the basis of homodesmic reactions for organic compounds, and calculations for the enthalpies of formation for a random test set comprising 53 CHNO-containing organic compounds of different classes are described. It is shown that the homodesmic approach provides highly reliable theoretical values of Δ_fH° virtually regardless of the quantumchemical approach that is used. The average absolute error of MAD calculations for Δ_fH° of a test set is 2.2 kJ/mol for the simple B3LYP/6-31G(d) approach and 2.1 kJ/mol for the moderately complicated M06-2X/cc-pVTZ approach, while using the complicated method of G3 calculations reduces the MAD value to 1.7 kJ/mol.     

Shi Epoxidation:A Great Shortcut to Complex Compounds

Shi epoxidation provides an extremely powerful tool to access optically active epoxides,which undoubtedly belongs to one of the earliest and most successful org...     

Comparison of the Topological and Dynamic Characteristics of Molecules for Calculating Retention Indices of Organic Compounds

This paper reports on a comparative analysis of the linear correlation equations relating the gas-chromatographic retention indices (RI) of several groups of isomeric organic compounds to the topological (Wiener and Hosoya indices) and dynamic (intramolecular energies estimated by molecular dynamic methods and the vibrational components of this energy estimated with simple models) parameters of molecules. It is shown that the choice of one of these parameters does not ensure the best approximation to RI, since the results depend on the chemical nature of substances. Correlations between all of the above quantities have been established. The correlations serve as a basis for physicochemical interpretation of the topological parameters of molecules as quantities proportional to the intramolecular vibrational and rotation energies.     

基于DNA-甲苯胺蓝生物聚合离子膜的多环有机物电化学传感器的研究

利用DNA与小分子之间的相互作用,以DNA/壳聚糖生物聚合离子膜固定电活性小分子,制备了DNA-甲苯胺蓝/壳聚糖聚合离子复合膜修饰电极,并利用多环有机物与染料分子对DNA特异结合的竞争关系,构筑了多环有机物非试剂添加型DNA电化学生物传感器。以盐酸四环素为模式分子,利用循环伏安法和方波伏安法研究了该修饰电极的电化学特性以及该电极对盐酸四环素的电化学响应,结果表明,DNA和甲苯胺蓝成功地固定在电极表面,电极表面的甲苯胺蓝保持了很好的电化学活性。利用紫外-可见分光光度法研究了电极对盐酸四环素响应的作用机理。该传感器的线性范围为2.5~100μmol·L-1。