光系统Ⅱ抑制剂-顺式氰基丙烯酸酯化合物的三维构效关系和电子结构研究

以距离比较法所获得的顺式氰基丙烯酸酯化合物的活性构象为模板,对39个该类化合物采用比较分子场方法进行了三维构效关系的研究.结果表明,所获得的药效团模型具有很好的预测能力.同时采用量子化学的方法对活性构象模板分子电子结构作了讨论.     

光系统Ⅱ抑制剂—反式氰基丙烯酸酯比较分子场和电子结构研究

对反式氰基丙烯酸酯系列活性分子采用限制性系统搜索方法确定的药效团模型 ,与 9类不同骨架结构的光系统 抑制剂 DISCO模型中的反式氰基丙烯酸酯分子(M- 2 2 )的活性构象为模板所确定的药效团模型是非常相近的。对两种方法所获得的活性构象分子进行了 Co MFA研究 ,其结果是一致的。采用 PM3方法进行了量子化学计算 ,计算结果表明两种模型的构象分子具有相近的电子结构 ,根据分子静电场、立体场和电子结构探讨了该类抑制剂的构效关系。     

咪唑啉酮类除草剂的三维构效关系研究

从三维角度出发,采取不同的构象搜索方法得到了咪唑酮类化合物分子的活性构象。利用比较分子场分析方法进一步证实了模板分子构象的正确性。并从静电场、立体场及活性关系等方面进行了三维定量构效关系研究,得到了具有较强预测能力的QSAR模型。     

光系统Ⅱ(PSⅡ)抑制剂的比较分子场研究

以光系统Ⅱ抑制剂DISCO(DIStanceCOmparisons)模型的活性构象分子作为模板,利用比较分子场分析方法对三类结构不同的化合物进行了三维构效关系的研究。研究结果有助于对DISCO重叠模型的评估的新型PSⅡ抑制剂的设计与合成。     

光系统II(PSII)抑制剂的比较分子场研究

以光系统II抑制剂DISCO(DIStance COmparisons)模型的活性构象分子作为模板,利用比较分子场分析方法对三类结构不同的化合物进行了三维构效关系的研究.研究结果有助于对DISCO重叠模型的评估和新型PSII抑制剂的设计与合成.     

基于分子对接的6-萘甲基取代HEPT类HIV-1逆转录酶抑制剂构效关系研究

采用分子对接方法得到了一系列6-萘甲基取代HEPT类逆转录酶抑制剂分子与HIV-1逆转录酶复合物模型,从中抽取出抑制剂分子的活性构象,进一步应用CoMFA和CoMSIA方法建立了具有较好预测能力的3D-QSAR模型,深入探讨了这些化合物的定量构效关系,为进一步的药物设计奠定了良好的基础.另外,以化合物13及其相应的β异构体24为代表,结合量子化学从头算分子轨道理论方法考察了它们的前线轨道,为阐明α和β系列化合物的活性差异提供了理论依据.     

烟碱型乙酰胆碱受体吡啶基胺类配体的构效关系研究

采用分子动力学模拟退火技术寻找了一类新型烟碱型乙酰胆碱受体吡啶基胺类配体分子的优势构象，用分子力学方法进行了结构优化，再用半经验量子化学方法中的AM1方法进一步优化，并做了电子结构计算.用计算所得物化参数对配体亲和性进行多元线性回归分析，回归结果表明：化合物pKi值与分子最低空轨道能量(ELUMO)、吡啶基所带总电荷(Qp)及分子构象相关.根据计算结果对该类化合物与受体的作用机制和作用位点进行了讨论.     

原卟啉原IX的构象分析

在合理药物设计方法中 ,当靶标酶的三维结构未知时 ,对其底物进行构象分析 ,特别是确定其活性构象 ,对阐明靶标酶活性中心的空间形状和作用位点具有十分重要的意义。我们曾利用距离比较法确定了原卟啉原氧化酶的底物—原卟啉原IX的活性构象 ,本文从构象分析的角度对 4种不同构象的原卟啉原IX分子与二苯醚类分子的晶体学构象进行了几何参数的比较和分析 ,结果进一步证实了距离比较法所确定的活性构象更为可靠     

原卟啉原Ⅸ的构象分析

在合理药物设计方法中,当靶标酶的三维结构未知时,对其底物进行构象分析,特别是确定其活性构象,对阐明靶标酶活性中心的空间形状和作用位点具有十分重要的意义.我们曾利用距离比较法确定了原卟啉原氧化酶的底物-原卟啉原Ⅸ的活性构象,本文从构象分析的角度对4种不同构象的原卟啉原Ⅸ分子与二苯醚类分子的晶体学构象进行了几何参数的比较和分析,结果进一步证实了距离比较法所确定的活性构象更为可靠.     

基于他克林的乙酰胆碱酯酶抑制剂的3D-QSAR研究及虚拟筛选

本文通过对58个他克林派生物乙酰胆碱酯酶抑制剂分子进行建模分析,研究其结构与活性的关系,并通过虚拟筛选方法获得一系列潜在AChE抑制剂双位点分子。首先将一系列他克林二联体化合物与AChE晶体结构对接,获得化合物的活性构象,以此进行建模分析,建立结构与活性之间的三维定量构效关系。所得模型CoMFA、CoMSIA、TopomerCoMFA的交叉验证系数分别为0.510、0.702、0.571,非交叉验证系数为0.998、0.988、0.794,测试集r_(pred)~2为0.750、0.742、0.766,所得模型具有良好的预测性,由此可以为设计高活性的新分子提供理论基础。然后,使用Topomer search对ZINC数据库中的125909分子进行虚拟筛选,得到891个具有潜在AChE抑制活性的分子。最后,对这891个分子进行分子对接,观察分子与晶体结构的结合情况,筛选得到66个具有高选择性的双位点AChE抑制剂分子。     

A Convenient Preparation of 2-(2-Arylidene)- and 2-(2-Polyhydroxyalkylidene)hydrazono-4-imidazolidinones with Various Heterocyclic Side Chain Substituents at Position 5 as Potential Antiviral and Antitumor Agents

A variety of novel 5-[( Z )-arylidene]-2-[(2-( E )-arylidene)hydrazono]-4-imidazolidinones 1a-c to 4a , b and 5-[( Z )-arylidene]-2-[(2-( E )-polyhydroxyalkylidene)hydrazono]-4-imidazolidinones 5a-c to 7a-c were prepared from the reaction of 5-[( Z )-arylidene]-2-methylmercaptohydantoins 8a-c with 2-( E )-arylidene hydrazones 13a-d and/or 2-( E )-monosaccharides hydrazones 16a-c . The linear structure, and not that of the angular isomer, has been selected for the products. This structure has been confirmed from a model study of the condensation of 5-[( Z )-2-thienylidene]-2-hydrazono-4-imidazolidinone 9a with benzaldehyde and D -galactose, respectively. The acetylation and benzoylation reactions of compounds 1-7 have been studied. All the new compounds were tested for their potential antiviral and antitumor activities.     

Binding Model and 3D-QSAR of 3-（2-Chloropyrid-5- ylmethylamino）-2-cyanoacrylates as PSⅡ Electron Transport Inhibitor

The binding model of 3-（2-chloropyrid-5-ylmethylamino）-2-cyanoacrylate photosystem Ⅱ （PSⅡ） electron transport inhibitors with the D 1 protein of PSII was built. The high herbicidal activity of this kind of inhibitors was explained by docking studies： in addition to usual factors, the N atom on the pyridine ring could form an H-bond with the backbone amide of Phe265 on the D1 protein. 3D-QSAR analysis on sixteen 3-（2-chloropyrid-5-yl- methylamino）-2-cyanoacrylate compounds was performed using CoMFA method to explain the nature of interactions between the compounds and D1 protein. These studies may provide useful insights for designing new PSII electron transport inhibitors.     

[Z]-2-(芳基锡基)-1-(9-芴醇)乙烯的合成、结构与性质

用三苯基氢化锡,三对甲苯基氢化锡作为锡氢化试剂与9-乙炔基-9-芴醇进行反应,合成了2个有机锡化合物:[Z]-2-(三苯基锡基)-1-(9-芴醇)乙烯(1)和[Z]-2-(三对甲苯基锡基)-1-(9-芴醇)乙烯(2)。化合物1和2分别与ICl,Br~2,I~2反应,得到6个有机锡一卤化物,6个有机锡二卤化物和2个有机锡混合卤化物(3-16)。有机锡一碘化物7,13和有机锡二碘化物8,14与KOH乙醇溶液反应,分别得到相应的有机锡氢氧化物17,18和有机锡氧化物19,20。有机锡二碘化物8,14分别与含氮双齿配体1,10-邻菲罗啉(Phen),2,2'-联吡啶(Bipy),8-羟基喹啉(Oxin)反应,得到6个相应的配合物21-26。26个新化合物通过元素分析,锡含量测定,IR,^1HNMR测定对其结构进行了表征。同时测定了化合物2的晶体结构,晶体属单斜晶系,空间群P2~1/c。化合物2是以Sn原子为中心扭曲的四面体构型。     

DIASTEREOSELECTIVE SYNTHESIS AND STEREOCHEMISTRY OF (Z)-1-[3-ARYL-2-(PHENYLSULFANYL)-2-OXIRANYL]-1-ETHANONES

Diastereoselective synthesis of a series of (Z)-1-[3-aryl-2-(phenylsulfanyl)-2-oxiranyl]-1-ethanones was effected from the reaction of (Z)-4-aryl-3-(phenylsulfanyl)-3-buten-2-ones with alkaline hydrogen peroxide in tetrahydrofuran. The stereochemistry of the oxiranes has been deduced from two-dimensional NOESY spectrum.     

Synthesis and oral activity of pivaloyloxymethyl 7-[(Z)-2-(2-aminothiazol-4-yl)-2-methoxyiminoacetamido]-3(Z)- (4-methylthiazol-5-yl)vinyl-3-cephem-4-carboxylate (ME1207) and its related compound.

7-[2-(2-Aminothiazol-4-yl)-2(Z)-methoxyiminoacetamido]-3(Z)- (4-methylthiazol-5-yl)vinyl-3-cephem-4-carboxylic acid (11, ME1206) and its 3-trans isomer (13) were prepared to test antibacterial activity. These compounds exhibited excellent antibacterial activity against both gram-positive and gram-negative bacteria, including beta-lactamase producing strains. The pivaloyloxymethyl esters (12 and 14) of the compounds (11 and 13) were prepared by esterification with pivaloyloxymethyl iodide. Among them, pivaloyloxymethyl 7-[(Z)-2-(2-aminothiazol-4-yl)-2-methoxyiminoacetamido]- 3(Z)-(4-methylthiazol-5-yl)vinyl-3-cephem-4-carboxylate (12, ME1207) showed good urinary recovery after oral administration in mice.     

[Z]-1-[2-(三芳基锡基)乙烯基]环辛醇的合成和性质

本文用三苯基氢化锡、三对甲苯基氢化锡作为锡氢化试剂与1-乙炔基环辛醇进行反应, 合成了两个有机锡化合物: [Z]-1-[2-(三苯基锡基)乙烯基]环辛醇(1)和[Z]-1-[2-(三对甲苯基锡基)乙烯基]环辛醇(2), 并测定了1的晶体结构。1和2分别与ICl, Br2, I~2反应, 得到六个有机锡一卤化物和三个有机锡二卤化物(3-11)。有机锡二卤化物6和一卤化物5与KOH乙醇溶液反应, 分别得到相应的锡氧化物和锡氢氧化物(12, 13)。有机锡二卤化物8分别与含氮双齿配体[2,2'-联吡啶(Bipy),5-硝基-1,10-邻菲罗啉(Nphen),8-羟基喹啉(Oxin)]反应, 得到三个相应的配合物(14-16)。十六个新化合物通过元素分析、锡含量测定、IR、^1H NMR测定对其结构进行了表征, 同时提出了1和2的生成反应历程。     

5-(2-芳氧甲基苯并咪唑-1-亚甲基)-1,3,4-噁二唑-2-硫酮的合成、 晶体结构及生物活性研究

以2-芳氧甲基苯并咪唑-1-乙酰肼类化合物为原料在微波辐射条件下合成了10种尚未见文献报道的5-(2-芳氧甲基苯并咪唑-1-亚甲基)-1,3,4-噁二唑-2-硫酮衍生物, 化合物结构经 IR, 1H NMR, 13C NMR 和元素分析进行了表征. 6a 晶体结构表明, 该化合物通过分子间氢键自组装成了沿b轴无限延伸的一维链状超分子结构, 属于单斜晶系, P21/c空间群, a＝11.5484(13) Å, b＝16.5319(19) Å, c＝11.3595(14) Å, β＝108.755(2)°, Z＝2, V＝2053.6(4) Å3, Dx＝1.328 g/cm3, F(000)＝860, µ＝0.19 mm－1, R＝0.060, wR＝0.196. 初步生物活性试验结果表明该系列部分化合物对油菜幼苗的生长具有明显的生长调节作用, 并对枯草杆菌具有一定的抑制作用.     

Facile Synthesis of (Z,E)-9,11-Hexadecadienal,the Major Sex Pheromone Component of the Sugarcane Borer Diatraea saccharalis: An Efficient Strategy for Synthesis of (Z,E)-Dienic Pheromones

Practical and improved procedures for the synthesis of 7-bromo-(Z,E)-4,6-heptadienal by Pd(II)-catalyzed coupling reaction were developed. Based on the improved method, an efficient and stereoselective synthesis of (Z,E)-9,11-hexadecadienal, the main pheromone component of the sugarcane borer, Diatraea saccharalis, was achieved in 38% overall yield, which more desirable then previously reported methods. The stereochemistry relied on cross-coupling between Grignard reagent and protected 7-bromo-(Z,E)-4,6-heptadienal. The concise and facile synthetic strategy described herein provided a generally synthetic approach to other (Z,E)-dienic compounds.     

Studies on Synthesis and Photochromism of a Novel Class of Fulgimide： （Z）-4-Oxazolylfulgimide

A novel class of fulgimide, (Z)-4-oxazolylfulgimide ((Z)-1-benzyl-4-isopropylidene-3-[1-(2-aryl-5-methyloxazolyl)ethylidene]tetrahydropyrrole-2,5-dione), was synthesized by the reaction of (Z)-4-oxazolyl fulgide (4-isopropylidene-3-[1-(2-aryl-5-methyloxazolyl) ethylidene]tetrahydrofuran-2,5-dione) with benzyl amine. Photochromic property of (Z)-4-oxazolylfulgimide was studied. Compared with (Z)-4-oxazolylfulgide, the absorption maximum of the colored form of (Z)-4-oxazolylfulgimide is bathochromic-shifted. Substituents on the aryl ring affect the absorption maximum of the open form and the colored form of (Z)-4-oxazolylfulgimide.     

5-(4-羟基苄基)-2,4-咪唑啉二酮酯类化合物合成及生物活性

为了发现高效、低毒、低残留的农药先导化合物,模拟AdSS酶天然抑制剂的活性结构,以L-酪氨酸为起始原料,经过关环和酯化等反应合成了24个新的5-(4-羟基苄基)-2,4-咪唑啉二酮酯系列化合物6a～6x,它们的结构通过IR,1H NMR和元素分析进行了确证。化合物6m经X射线衍射测定: C18H16N2O5,Mr＝340.33,单斜晶系,空间群 P2(1)/c,a＝0.86071(17) nm,b＝1.1167(2) nm,c＝0.93826(2) nm,β＝115.10(3)°,V＝0.8166(3) nm3,Dc＝1.384 g/cm3,Z＝2,F(000)＝356,m(Mo Kα)＝0.103 mm－1,final R＝0.0359,wR＝0.0998。初步生物活性实验结果表明,在200 mg/mL浓度下,部分化合物对小麦和拟南芥的生长有一定的抑制作用,而部分化合物对玉米的生长有促进作用。