| 双龙方组分诱导大鼠BMSCs分化的差异基因筛选及聚类分析 |
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| 引用本文： | 范雪梅,李雪,梁琼麟,胡坪,王义明,罗国安.双龙方组分诱导大鼠BMSCs分化的差异基因筛选及聚类分析[J].高等学校化学学报,2009,30(9):1729-1732. |
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| 作者姓名： | 范雪梅 李雪 梁琼麟 胡坪 王义明 罗国安 |
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| 作者单位： | 1. 华东理工大学药学院, 上海 200237;
2. 清华大学医学院,
3. 化学系, 北京 100084;
4. 华东理工大学化学与分子工程学院, 上海 200237 |
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| 基金项目： | 科学技术部“十一五”科技支撑计划(批准号:2006BA108B04-01);;国家“九七三”计划(批准号:2005CB523503)资助 |
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| 摘 要： | 利用基因芯片筛选双龙方有效组分(总人参皂苷及总丹酚酸)诱导大鼠骨髓间充质干细胞(BMSCs)类心肌细胞分化过程中的差异表达基因, 并对其进行聚类分析, 在基因水平研究了双龙方组分对大鼠BMSCs分化的影响. 对大鼠BMSCs进行分组培养, 分别收集10, 20, 30及40 d的细胞样本, 提取tRNA, 经基因芯片检测, 筛选出BMSCs变化过程中的差异表达基因并进行生物信息学分析, 同时通过差异表达基因对样本进行Hierarchical聚类分析. 在BMSCs的分化过程中, 筛选出179条差异表达基因, 经分析发现它们与能量代谢和信号传导等多类基因密切相关. 对样本进行聚类分析发现其聚为两大类: 10和20 d的样本聚为一类, 30和40 d的样本聚为一类. 说明BMSCs在20~30 d之间可能发生了显著的改变.
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| 关 键 词： | 双龙方 基因芯片 差异表达基因 聚类分析 |
| 收稿时间： | 2008-09-12 |
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