| CYP2C9酶与Warfarin结合模型的立体选择性理论研究 |
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| 引用本文： | 吴云剑,崔颖璐,郑清川,张红星.CYP2C9酶与Warfarin结合模型的立体选择性理论研究[J].高等学校化学学报,2014(12):2605-2611. |
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| 作者姓名： | 吴云剑 崔颖璐 郑清川 张红星 |
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| 作者单位： | 吉林大学理论化学研究所，理论化学计算国家重点实验室，长春130023 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(批准号:21273095)资助.覮 Supported by the National Natural Science Foundation of China |
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| 摘 要： | 对CYP2C9酶与S-Warfarin复合物的晶体结构进行分子对接、分子动力学模拟、通道分析及结合自由能计算,发现原晶体结构中的结合模式为"亚稳态",提出了CYP2C9与S-Warfarin结合的可催化模式;比较了CYP2C9与S-和R-Warfarin结合的异同,确定了在结合过程中起重要作用的锚定氨基酸残基,尤其是位于活性位点区域的苯丙氨酸簇.在结合过程中这些残基通过芳香环的移动对稳定底物的结合模式起到至关重要的作用,阐明了该酶呈现相关底物选择性的原因.对于CYP2C9与底物对接模式及立体选择性的研究有助于在分子层面上理解特异性底物与酶的结合特点,为潜在的药物设计提供了合理可信的理论依据.
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| 关 键 词： | 分子对接 分子动力学模拟 细胞色素P450 结合自由能分析 CYP2C9酶和S-Warfarin复合物 |
Theoretical Studies on the Substrate Binding Mode and Regioselectivity of Human CYP2 C9 with S-and R-Warfarin |
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| WU Yunjian,CUI Yinglu,ZHENG Qingchuan,ZHANG Hongxing.Theoretical Studies on the Substrate Binding Mode and Regioselectivity of Human CYP2 C9 with S-and R-Warfarin[J].Chemical Research In Chinese Universities,2014(12):2605-2611. |
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| Authors: | WU Yunjian CUI Yinglu ZHENG Qingchuan ZHANG Hongxing |
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| Institution: | WU Yunjian;CUI Yinglu;ZHENG Qingchuan;ZHANG Hongxing;State Key Laboratory of Theoretical and Computational Chemistry,Institute of Theoretical Chemistry,Jilin University; |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Molecular docking Molecular dynamics simulation Cytochrome P450 MM-GB/SA CYP2 C9 and Warfarin complex |
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