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光谱法及分子模拟法研究杨梅素与ct-DNA的相互作用
引用本文:李悦,何华,肖得力,朱鸣阳.光谱法及分子模拟法研究杨梅素与ct-DNA的相互作用[J].分析测试学报,2015,34(11):1233-1239.
作者姓名:李悦  何华  肖得力  朱鸣阳
作者单位:1.天津医学高等专科学校药学与医学检验技术系;2.中国药科大学分析化学教研室
摘    要:采用紫外光谱、荧光光谱结合亚甲基蓝荧光探针(MB)、圆二色谱(CD)以及分子模拟等技术研究了生理条件下杨梅素与小牛胸腺DNA(ct-DNA)的相互作用,探索了其可能的结合位点与作用机制。热力学参数显示ΔH0、ΔS0,说明杨梅素与ct-DNA通过氢键和范德华力发生相互作用。光谱研究显示,ct-DNA能够猝灭杨梅素的内源荧光,猝灭方式为静态猝灭,两者的结合常数为1.86×103mol-1,结合位点数为1。在竞争性实验中杨梅素未能将MB从MB-DNA复合体系中游离出来,说明其与ct-DNA的作用方式为沟槽结合。圆二色光谱研究表明,杨梅素的加入未能破坏ct-DNA的双螺旋结构,两者的作用方式为沟槽结合。进一步通过分子模拟研究得到杨梅素与DNA结合的最低能量构象,杨梅素A环7-O和B环3’-O分别与DNA的碱基DA18和DA6在边缘小沟处通过氢键结合,周围富含碱基A和T,与光谱学研究结果一致,结合距离分别为2.061和1.918。

关 键 词:杨梅素  小牛胸腺DNA(ct-DNA)  沟槽结合  光谱法  分子模拟

Spectroscopic Studies and Molecular Docking of the Interaction between Myricetin and Calf Thymus DNA
LI Yue,HE Hu,XIAO De-li,ZHU Ming-yang.Spectroscopic Studies and Molecular Docking of the Interaction between Myricetin and Calf Thymus DNA[J].Journal of Instrumental Analysis,2015,34(11):1233-1239.
Authors:LI Yue  HE Hu  XIAO De-li  ZHU Ming-yang
Abstract:
Keywords:
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