| 毛细管电泳结合电喷雾质谱分析人类癌基因c-myb四链体核酸与活性天然产物的相互作用 |
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| 引用本文： | 王双双,杨云鹤,凡珊珊,李卉卉,DavidD. Y. CHEN.毛细管电泳结合电喷雾质谱分析人类癌基因c-myb四链体核酸与活性天然产物的相互作用[J].色谱,2020,38(9):1069-1077. |
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| 作者姓名： | 王双双 杨云鹤 凡珊珊 李卉卉 DavidD. Y. CHEN |
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| 作者单位： | 1 南京师范大学常州创新发展研究院, 江苏 常州 2130222 生物医药功能材料国家地方联合工程研究中心, 江苏省生物医药功能材料协同创新中心, 南京师范大学化学与材料科学学院, 江苏 南京 2100233 Department of Chemistry, University of British Columbia, Vancouver, BC V6T 1Z1, Canada |
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| 基金项目： | 加拿大自然科学和工程研究理事会基金;国家自然科学基金(21977050);国家自然科学基金(21475061);江苏高校优势学科建设工程项目 |
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| 摘 要： | 药物与靶点间的作用关系直接影响到药理和药效。药物-靶点结合能力、结合计量关系等信息是药物研发过程中必需的表征数据。人类癌基因c-myb在结直肠癌等多种癌症组织中存在过度表达，目前已成为结直肠癌、白血病等癌症疾病潜在的治疗靶点。位于癌基因c-myb启动子区的一段富含鸟嘌呤（G）的DNA序列，通过阳离子的诱导可自发折叠形成分子内G-四链体，而小分子的特异性识别可以稳定该G-四链体，进而调节基因的转录和表达过程。该文采用压力辅助毛细管电泳前沿分析（PACE-FA）结合电喷雾质谱（ESI-MS）研究人类癌基因c-myb启动子G-四链体（G4）与天然产物分子间的相互作用。PACE-FA法在毛细管电泳前沿分析（CE-FA）过程中施加一个与分析物迁移同向的压力，在保证结果准确度的前提下，能够大大加快分析速度。同时结合ESI-MS，可快速解析结合分子与靶点的亲合力和化学计量关系。首先，利用ESI-MS快速筛选出3种有亲合力的天然产物，亲合力大小依次为：土荆皮乙酸>丁溴东莨菪碱>荷叶碱。考虑到溶液相中存在特异性与非特异性结合，接着用PACE-FA法准确分析溶液相中结合的特异性和结合常数。结果发现：丁溴东莨菪碱能够特异性结合靶点G4 DNA，结合比为1：1，结合常数为1.18×105 L/mol；荷叶碱属于非特异性结合，而土荆皮乙酸并未与靶点G4 DNA形成复合物。该组合方法不仅分析速度快，而且能够提高亲和分析的准确度和特异性，有望应用于靶向药物先导结构的发现和作用机制评价。
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| 关 键 词： | 毛细管电泳前沿分析 电喷雾质谱 相互作用 G-四链体 天然产物 |
| 收稿时间： | 2020-03-02 |
Determination of the binding of natural products to the human c-myb oncogene promoter G-quadruplex DNA by capillary electrophoresis and electrospray ionization mass spectrometry |
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| WANG Shuangshuang,YANG Yunhe,FAN Shanshan,LI Huihui,David D. Y. CHEN.Determination of the binding of natural products to the human c-myb oncogene promoter G-quadruplex DNA by capillary electrophoresis and electrospray ionization mass spectrometry[J].Chinese Journal of Chromatography,2020,38(9):1069-1077. |
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| Authors: | WANG Shuangshuang YANG Yunhe FAN Shanshan LI Huihui David D Y CHEN |
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| Institution: | 1 Changzhou Institute of Innovation and Development, Nanjing Normal University, Changzhou 213022, China2 National and Local Joint Engineering Research Center of Biomedical Functional Materials, Jiangsu Collaborative Innovation Center of Biomedical Functional Materials, School of Chemistry and Materials Science, Nanjing Normal University, Nanjing 210023, China3 Department of Chemistry, University of British Columbia, Vancouver, BC V6T 1Z1, Canada |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | capillary electrophoresis frontal analysis (CE-FA) electrospray ionization mass spectrometry (ESI-MS) interaction G-quadruplex natural product |
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