基于氨基酸描述符SVHEHS的ACE抑制肽QSAR研究 |
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引用本文: | 刘静,管骁,彭剑秋.基于氨基酸描述符SVHEHS的ACE抑制肽QSAR研究[J].化学学报,2012,70(1):83-91. |
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作者姓名: | 刘静 管骁 彭剑秋 |
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作者单位: | 1. 江南大学食品科学与技术国家重点实验室,无锡214122/上海海事大学信息工程学院,上海201306 2. 上海理工大学医疗器械与食品学院,上海,200093 |
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基金项目: | 国家自然科学基金,上海市晨光计划项目,江南大学食品科学与技术国家重点实验室开放课题资助课题 |
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摘 要: | 收集20种天然氨基酸的457种理化性质,按照疏水、电性特征、氢键贡献和立体特征分类后,对它们分别进行主成分分析(Principal component analysis,PCA),得到一个新的氨基酸残基结构描述符SVHEHS.用该描述符分别对血管紧张素转化酶(Angiotensin Ⅰ converting enzyme,ACE)抑制二肽、三肽、四肽进行序列表征,并用来与生物活性建立偏最小二乘(Partial least square regression,PLS)模型.ACE抑制二肽、三肽、四肽模型的相关系数、交叉验证相关系数、均方根误差、外部验证相关系数分别为0.607,0.507,0.587,0.783;0.852,0.813,0.232,0.839;1,1,0,0.935.由此说明,采用SVHEHS描述符建立的PLS模型拟合、预测能力均较好,可用于血管紧张素转化酶抑制肽的定量构效关系研究.
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关 键 词: | 氨基酸描述符 血管紧张素转化酶抑制肽 偏最小二乘 定量构效关系 |
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