| 基于盒维数原理计算蛋白质的分形维数 |
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| 引用本文： | 彭鑫,张雨薇,齐崴,苏荣欣,吴少敏,何志敏.基于盒维数原理计算蛋白质的分形维数[J].化学学报,2010,68(11). |
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| 作者姓名： | 彭鑫 张雨薇 齐崴 苏荣欣 吴少敏 何志敏 |
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| 作者单位： | 1. 天津大学化工学院化学工程研究所,天津,300072
2. 天津大学化工学院化学工程研究所,天津,300072;天津大学化学工程联合国家重点实验室,天津,300072 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金，教育部新世纪优秀人才(2008)项目，科学技术研究重点项目 |
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| 摘 要： | 蛋白质表面的粗糙性和内部结构的不规则性具有明显的分形特征.依据直观的盒维数原理对PDB库中收录的典型酶蛋白、球蛋白和膜蛋白共72种蛋白质的分形维数进行了简洁地模拟计算.数据表明:蛋白质的分形维数(Df)介于1～3之间;分形方法可定量描述蛋白质分子结构的复杂性,即Df值越大,蛋白结构越复杂;Df与残基数的不同步性证明蛋白质分子并不是简单的肽段堆积,而是存在特定的空间结构;同功能酶蛋白具有相近的Df值表明分维是区别于各种宏观参量而对蛋白质微观结构与功能进行表征的有用工具.
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| 关 键 词： | 分形 蛋白质 盒维数 模拟 计算 结构 |
Fractal Analysis of Proteins Based on Box Dimension |
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| Peng Xina,Zhang Yuwei,Qi Wei,Su Rongxin,Wu Shaomin,He Zhimin.Fractal Analysis of Proteins Based on Box Dimension[J].Acta Chimica Sinica,2010,68(11). |
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| Authors: | Peng Xina Zhang Yuwei Qi Wei Su Rongxin Wu Shaomin He Zhimin |
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