| 螺环吲哚类MDM2抑制剂的分子对接、定量构效关系和分子动力学模拟 |
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| 引用本文： | 李博,周锐,何谷,郭丽,黄维.螺环吲哚类MDM2抑制剂的分子对接、定量构效关系和分子动力学模拟[J].化学学报,2013,71(10):1396-1403. |
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| 作者姓名： | 李博 周锐 何谷 郭丽 黄维 |
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| 作者单位： | a 四川大学华西药学院 成都 610041;
b 四川大学华西医院 生物治疗国家重点实验室 成都 610041;
c 成都中医药大学药学院 成都 611137 |
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| 基金项目： | 项目受国家自然科学基金(Nos. 81001357, 81273471)和中药资源系统研究与开发利用省部共建国家重点实验室培育基地开放课题资助. |
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| 摘 要： | 采用分子对接、三维定量构效关系(3D-QSAR)和分子动力学方法研究了21个螺环吲哚类化合物与MDM2蛋白的相互作用, 并建立了相关预测模型. 比较分子场分析法(CoMFA)和比较分子相似性指数分析法(CoMSIA)模型的交互验证相关系数q2分别为0.573 和0.651, 非交互验证相关系数r2分别为0.948和0.980. 分子对接得到的结合模式与分子动力学模拟得到的结果一致, 结合模式表明该类螺环吲哚化合物主要通过疏水相互作用和氢键与MDM2结合. 基于上述相互作用模型设计并合成了6个新结构螺环吲哚化合物, 并在MDM2高表达的前列腺癌LNCaP细胞株上测定其活性, 结果表明化合物5, 6的半数抑制浓度均低于1μg·mL-1, 可作为新的抗肿瘤药物先导化合物进一步深入研究. 本研究对以MDM2为靶点的新结构螺环吲哚类抑制剂的开发提供了理论和实验依据.
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| 关 键 词： | 螺环吲哚衍生物 分子对接 分子动力学 比较分子场分析 比较分子相似性指数分析 |
Molecular Docking,QSAR and Molecular Dynamics Simulation on Spiro-oxindoles as MDM2 Inhibitors |
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| Li Bo,Zhou Rui,He Gu,Guo Li,Huang Wei.Molecular Docking,QSAR and Molecular Dynamics Simulation on Spiro-oxindoles as MDM2 Inhibitors[J].Acta Chimica Sinica,2013,71(10):1396-1403. |
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| Authors: | Li Bo Zhou Rui He Gu Guo Li Huang Wei |
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| Institution: | a West China School of Pharmacy, Sichuan University, Chengdu 610041;
b State Key Laboratory of Biotherapy, West China Hospital, Sichuan University, Chengdu, 610041;
c School of Pharmacy, Chengdu University of Traditional Chinese Medicine, Chengdu 611137 |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Spiro spiro-oxindole derivatives Molecular molecular docking Molecular molecular dynamics Comparative comparative molecular field analysis Comparative comparative molecular similarity indices analysis |
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