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HPLC技术对细菌基因组DNA碱基组成的精确测定
引用本文:李越中,胡玮,张禹清,张勇,韩冠君,黎志凤,王冰.HPLC技术对细菌基因组DNA碱基组成的精确测定[J].化学学报,2001,59(9):1464-1470.
作者姓名:李越中  胡玮  张禹清  张勇  韩冠君  黎志凤  王冰
作者单位:山东大学生命科学系微生物技术国家重点实验室
基金项目:国家自然科学基金(39570013,39870003)和教育部博士点基金资助项目
摘    要:高效液相色谱技术(HPLC)在精确分析细菌基因组DNA碱基组成时存在着重复性差和杂质干扰的问题。本研究结合反相HPLC技术对化学水解(高氯酸法和甲酸法)和生物酶水解(磷酸二酯酶Ⅰ和牛肠粘膜碱性磷酸酶)DNA的水解条件和产物进行分析,建立了一套系统的分析方法,改善了分析的重复性问题,排除了主要的误差来源,达到了对细菌DNA碱基组成精确分析测定的目的。

关 键 词:高速液体色谱  水解  高氯酸  甲酸  磷酸二酯酶  磷酸酶  
修稿时间:2001年3月23日

Precise determination of base composition in bacterial genome DNA using HPLC techniques
Li Yuezhong,Hu Wei,Zhang Yuqing,Zhang Yong,Han Guanjun,Li Zhifeng,Wang Bing.Precise determination of base composition in bacterial genome DNA using HPLC techniques[J].Acta Chimica Sinica,2001,59(9):1464-1470.
Authors:Li Yuezhong  Hu Wei  Zhang Yuqing  Zhang Yong  Han Guanjun  Li Zhifeng  Wang Bing
Abstract:Errors of reproducibility with high performance liquid chromatography (HPLC) are remarkably serious in determination of base composition of bacterial genome DNA, which is usually defined as guanine-plus-cytosine content (G+C) mol%]. For partially purified DNA, salts are a major source of interference in enzymatic degradation and RNAs are a major source of interference in chemical degradation. This research analyzes the conditions and products by chemical (perchloric acid and formic acid) and enzymatic degradations (phasphodiesterase Ⅰ and bovine intestinal mucosa alkaline phophatase) of bacterial genome DNA using RP-HPLC, and introduces a systematic method to precisely measure the base composition of bacterial DNA.
Keywords:HIGH SPEED LIQUID CHROMATOGRAPHY  HYDROLYSIS  PERCHLORIC ACID  FORMIC ACID  PHOSPHODIESTERASE  PHOSPHOKINASE
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