R-基团相似性的比较 |
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引用本文: | 朱倩,姚建华,李丰,陈海,袁身刚.R-基团相似性的比较[J].化学学报,2004,62(17):1585-1589. |
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作者姓名: | 朱倩 姚建华 李丰 陈海 袁身刚 |
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作者单位: | 中国科学院上海有机化学研究所计算机化学实验室,上海,200032 |
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基金项目: | 中国科学技术部,上海市科学技术委员会,中国科学院的资助 |
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摘 要: | 介绍了对化学取代基(R-基团)进行相似性比较的工作.每个R-基团主要依赖一些对反应影响较为明显,同时又便于计算的结构描述符来进行描述,例如电负性、氢键受体、氢键给体等参数.由于与反应核心相距过远的环境对反应的影响较小,R-基团相似性比较对象,就由每个R-基团截取从它与母体连接的位点出发向外扩展6层的子结构组成.在确立了对R-基团描述和距离限制的基础上,提出了用一个45维向量表示一个R-基团,并由化学结构的比较,转化为向量比较来实现R-基团相似性比较的方法.采用这一方法,成功地对大量的R-基团进行了相似性的区分,并实现了对未知化合物进行相似性预测的目标.
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关 键 词: | R-基团 相似性 结构描述符 归一化 重心 向量 化学数据库检索系统 |
Comparison of the R-Group Similarity |
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