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基于不同裂解液的蛋白质组样品制备方法的比较研究
引用本文:孙宁宁,王子健,高祥,程欣,孙万春,杨静波,刘宁.基于不同裂解液的蛋白质组样品制备方法的比较研究[J].分析化学,2015,43(6).
作者姓名:孙宁宁  王子健  高祥  程欣  孙万春  杨静波  刘宁
作者单位:1. 吉林大学第二医院研究中心,吉林省重大疾病分子与化学遗传学重点实验室,长春130041
2. 吉林大学人兽共患病研究所,人兽共患病研究教育部重点实验室,长春130062
基金项目:国家自然科学基金,吉林省科技发展计划,吉林大学白求恩计划B (No.2012210)项目的支持 This work was supported by the National Natural Science Foundation of China,the Jilin Provincial Science and Technology Department,the Jilin University Bethune Project B
摘    要:蛋白质组学研究所面临的首要问题就是蛋白质组的样品制备,而不同的样品制备方案针对细胞、组织等样品的裂解能力,以及对不同种类蛋白的溶解能力会有很大的差异.本研究以培养的293T细胞为对象,利用质谱分析鉴定蛋白的方法,比较了采用3种常用的蛋白质组样品制备方法(Triton X-100法、尿素法和TRIzol法)所提取蛋白种类的差异,并利用生物信息学工具对所得数据进行了分析.结果表明,Triton X-100法和尿素法所提取蛋白的鉴定数目接近,而TRIzol法所提取蛋白的鉴定数目比二者减少约8%.从所鉴定的蛋白种类来看,3种方法相差较大,仅约有32%的蛋白为3种方法所共有,生物学功能也不尽相同.本研究为评价各种蛋白质组样品制备方法提供了一种快速、有效、全面的研究方法.

关 键 词:蛋白质组  样品制备  尿素  曲拉通X-100  TRIzol  液相色谱-质谱联用

Comparative Study of Three Methods of Sample Preparation for Proteomics Research
SUN Ning-Ning,WANG Zi-Jian,GAO Xiang,CHENG Xin,SUN Wan-Chun,YANG Jing-Bo,LIU Ning.Comparative Study of Three Methods of Sample Preparation for Proteomics Research[J].Chinese Journal of Analytical Chemistry,2015,43(6).
Authors:SUN Ning-Ning  WANG Zi-Jian  GAO Xiang  CHENG Xin  SUN Wan-Chun  YANG Jing-Bo  LIU Ning
Abstract:
Keywords:Proteome  Sample preparation  Urea  Triton X-100  TRIzol method  Liquid chromatography-tandem mass spectrometry
本文献已被 万方数据 等数据库收录!
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