用于单细胞RNA分析的循环肿瘤细胞团捕获和单细胞分离方法的质量评估 |
| |
引用本文: | 逄淑云,徐澍,徐朝跞,初亚男,马雪萍,武海萍,邹秉杰,周国华.用于单细胞RNA分析的循环肿瘤细胞团捕获和单细胞分离方法的质量评估[J].分析化学,2023(4):513-520. |
| |
作者姓名: | 逄淑云 徐澍 徐朝跞 初亚男 马雪萍 武海萍 邹秉杰 周国华 |
| |
作者单位: | 1. 南京大学医学院附属金陵医院(东部战区总医院)临床药学科;2. 中国药科大学基础医学与临床药学学院;3. 南方医科大学药学院;4. 中国药科大学药学院;5. 南京大学化学化工学院,生命分析化学国家重点实验室 |
| |
基金项目: | 国家自然科学基金项目资助~~; |
| |
摘 要: | 循环肿瘤细胞团(Circulating tumor cell cluster, CTC cluster)的单细胞分析对CTC cluster的生物学效应分析极其重要。为了使CTC cluster单细胞分析可以获得最有效的结果,分析前的捕获和单细胞分离的过程必须能够保持CTC cluster的完整性和细胞内部RNA的完整。本研究通过单细胞RNA测序中的逆转录方法逆转录并定量3个看家基因进行RNA质控,同时测量CTC cluster的横向直径用于评估CTC cluster的完整性,从而测定CTC cluster捕获和单细胞分离过程对CTC cluster单细胞分析结果的影响。分别采用胰酶-EDTA和非酶细胞解离溶液(Non-enzymatic cell dissociation solution, NECDS)分离CTC cluster中的单细胞,并考察了单细胞分离过程对胞内RNA的影响。考察了负向富集、正向富集和膜过滤捕获方案中不同操作流程对CTC cluster完整性和单细胞内RNA完整性的影响。结果表明,NECDS可快速分离CTC cluster中的单细胞且不会对细胞内RNA产生影响...
|
关 键 词: | 循环肿瘤细胞团 单细胞分析 单细胞分离 细胞团捕获 |
|
|