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分子对接与分子动力学模拟法探究PI3Kδ/度维利塞(Duvelisib)的选择性结合
引用本文:郁莉,蒋颖敏,许磊,朱景宇.分子对接与分子动力学模拟法探究PI3Kδ/度维利塞(Duvelisib)的选择性结合[J].化学研究与应用,2022,34(2):341-348.
作者姓名:郁莉  蒋颖敏  许磊  朱景宇
作者单位:常州工程职业技术学院检验检测认证学院,江苏常州213164;江南大学药学院药物设计与分子药理学实验室,江苏无锡214122;江苏理工学院生物信息与医药工程研究所,江苏常州213001
摘    要:大量研究表明磷脂酰肌醇3-激酶δ(PI3Kδ)与多种恶性肿瘤及免疫疾病的发生、发展密切相关,因此成为一个备受关注的药物靶点.伊德利塞(Idelalisib),PI3Kδ抑制剂,是首个被FDA批准上市的PI3K抑制剂,以此开启了PI3 Kδ选择性抑制剂开发的热潮,但是严重的毒副作用阻碍了该类化合物的使用.随后,度维利塞(Duvelisib,IPI-145)于2018年被批准上市,度维利塞是PI3 Kδ/γ选择性抑制剂,然而目前关于度维利塞的选择性PI3K抑制分子机制报道较少,且目前尚无度维利塞/PI3K复合物晶体结构报道.因此本文采用整合的计算机模拟策略来揭示度维利塞的选择性抑制机制:通过分子对接获得度维利塞与PI3K各亚型的合理结合构象;分子动力学模拟结合自由能计算揭示选择性产生的关键位点及热点氨基酸.目前,因与其他亚型之间高度的同源性与结构保守性,使得PI3 Kδ选择性抑制剂开发受到极大挑战,本文以上市药物度维利塞为研究主体,有望为新型PI3 Kδ选择性抑制剂的开发及合理药物设计提供一定的指导意义.

关 键 词:磷脂酰肌醇-3-激酶δ(PI3Kδ)  选择性抑制剂  度维利塞(Duvelisib  IPI-145)  分子对接  分子动力学模拟(MD)  自由能计算

Theoretical studies on the selectively binding mechanism of PI3Kδ/Duvelisib based on molecular docking and molecular dynamic simulations
YU Li,JIANG Ying-min,XU Lei,ZHU Jing-yu.Theoretical studies on the selectively binding mechanism of PI3Kδ/Duvelisib based on molecular docking and molecular dynamic simulations[J].Chemical Research and Application,2022,34(2):341-348.
Authors:YU Li  JIANG Ying-min  XU Lei  ZHU Jing-yu
Abstract:
Keywords:
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