| 基于配体与受体结构的酪氨酸酶抑制剂定量构效关系分析 |
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| 引用本文： | 汤海峰,崔凤超,刘伦洋,李云琦.基于配体与受体结构的酪氨酸酶抑制剂定量构效关系分析[J].应用化学,2018,35(7):788-794. |
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| 作者姓名： | 汤海峰 崔凤超 刘伦洋 李云琦 |
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| 作者单位： | 中国科学院长春应用化学研究所,合成橡胶重点实验室 长春 130022;吉林大学生命科学学院 长春 130012;中国科学院大学 北京 100049 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金 (21374117,21504092)、中国科学院百人计划和国家博士后科学基金(2014M561310)资助 |
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| 摘 要： | 酪氨酸酶是细胞内催化合成黑素的关键酶。 理解酪氨酸酶抑制剂结构与活性之间的关系对于设计新药和化妆品具有重要意义。 然而,酪氨酸酶抑制剂的定量构效关系仍不清楚。 本文利用配体和结构描述符构建了隐式和显式模型,阐明了酪氨酸酶抑制剂定量构效关系。 隐式模型的相关系数R高达0.961,显式模型的相关系数为0.775。 两个模型很好地预测了3个茶多酚的酪氨酸酶抑制活性,表儿茶素没食子酸酯(ECG)>表没食子儿茶素没食子酸酯(EGCG)>没食子酸(G)。 相关性分析发现,抑制剂与酪氨酸酶结合引起的构象熵损失与抑制剂的活性密切相关。 具有较少构象熵损失的ECG在4种茶多酚中具有较高酪氨酸酶抑制活性。 结合自由能计算也证实ECG与酪氨酸酶的结合能力最强。 此外,通过分解结合自由能发现,酪氨酸酶活性中心的氨基酸残基(His57、His201、Asn202、His205、Glu192和Val215)与抑制剂形成了较强的范德华和静电相互作用,进而稳定了复合物结构。
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| 关 键 词： | 酪氨酸酶 定量构效关系 分子力学-Poisson Boltzmann表面积方法 随机森林 蒙特卡罗 |
| 收稿时间： | 2017-09-12 |
Insight into the Inhibitory Activities of Diverse Ligands for Tyrosinase Using Ligand- and Structure-based Approaches |
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| Haifeng TANG,Fengchao CUI,Lunyang LIU,Yunqi LI.Insight into the Inhibitory Activities of Diverse Ligands for Tyrosinase Using Ligand- and Structure-based Approaches[J].Chinese Journal of Applied Chemistry,2018,35(7):788-794. |
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| Authors: | Haifeng TANG Fengchao CUI Lunyang LIU Yunqi LI |
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| Institution: | Key Laboratory of Synthetic Rubber,Changchun Institute of Applied Chemistry,Chinese Academy of Sciences,Changchun 130022,China;School of Life Science,Jilin University,Changchun 130012,China;University of Chinese Academy of Sciences,Beijing 100049,China. |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | tyrosinase quantitative structure-activity relationship molecular mechanics/Poisson Boltzmann surface area Random Forest algorithm Monte Carlo algorithm |
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