R基团搜索技术用于HIV-1逆转录酶抑制剂的分子设计 |
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引用本文: | 仝建波,白敏,赵翔,常佳.R基团搜索技术用于HIV-1逆转录酶抑制剂的分子设计[J].分析科学学报,2016(1):48-52. |
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作者姓名: | 仝建波 白敏 赵翔 常佳 |
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作者单位: | 陕西科技大学化学与化工学院,陕西科技大学教育部轻化工助剂化学与技术重点实验室,陕西西安710021 |
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基金项目: | 陕西省自然科学基础研究计划,陕西科技大学研究生创新基金 |
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摘 要: | 本文采用基于R基团搜索技术的Topomer CoMFA方法对41个人类免疫缺陷病毒(HIV-1)逆转录酶抑制剂进行了三维定量构效关系(3D-QSAR)分析。所得优化模型的拟合、交互验证及外部验证的复相关系数分别为0.995、0.859和0.945。采用Topomer Search技术对ZINC数据库进行R基团的虚拟筛选,得到R贡献高的基团,以活性最高的13号分子为模板进行过滤得到1个Ra基团和20个Rb基团。并以此设计得到20个新化合物分子,其中有19个化合物的预测活性值高于13号分子。研究结果表明,所建立的Topomer CoMFA模型具有良好的稳定性和预测能力,基于R基团的Topomer Search技术可以有效筛选并设计出新的HIV-1逆转录酶抑制剂,为抗艾滋病新药设计提供了理论依据。
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关 键 词: | 逆转录酶抑制剂 Topomer CoMFA 定量构效关系 Topomer Search 新药设计 |
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