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HIV蛋白酶抑制剂的定量构效关系研究及其指导下的修饰
引用本文:高慧,王春芳,高维娜,李云,魏冬青.HIV蛋白酶抑制剂的定量构效关系研究及其指导下的修饰[J].原子与分子物理学报,2007,24(4):675-681.
作者姓名:高慧  王春芳  高维娜  李云  魏冬青
作者单位:1. 上海交通大学生命科学技术学院,上海,200240;天津师范大学生物信息与药物开发研究所,天津,300074
2. 上海交通大学生命科学技术学院,上海,200240
基金项目:天津市科委计算专项;天津市教委资助项目
摘    要:HIV蛋白酶是一类用于治疗艾滋病具有潜在价值的关键酶,很多此类酶的抑制剂已经上市.一系列由AHPBA分子的基本骨架进行改造并合成的25个α-羟基β-氨基酸类似物对于HIV蛋白酶具有很高的活性和选择性.我们筛选合适的描述子建立一个二维定量构效关系的模型,模型的均方根误差RMSE=0.09823、相关性系数R=0.97461、F值=30.763、交叉验证的相关系数RCV=0.7071、交叉验证的预测误差平方PRESS=0.588,该模型为HIV蛋白酶抑制剂修饰和设计提供了比较可靠的预测.并且根据“变形钥匙”理论,分别用“杂化肽键”ΨCH2NH]、ΨCF2NH]、ΨCOCF2]、替换掉这组类似物中易水解的肽键-CO=NH-,使得这个共轭π键就变成一个较强的单键,变得不易被HIV蛋白酶所水解,从而得到抗AIDS的有效的抑制剂.然后通过原子电荷分布对比、分子对接等方法检验修饰的可能性和合理性.预先设想都在计算结果中得到验证,并且用QSAR模型预测了修饰后分子的活性.

关 键 词:HIV蛋白酶  抑制剂  "变形钥匙"理论
文章编号:1000-0364(2007)04-0675-07
收稿时间:2006/3/19
修稿时间:2006-03-19

Quantitatives structure-activity relationship and modification of HIV protease inhibitors
GAO Hui, GAO Wei-na, LI Yun ,WEI Dong-qing.Quantitatives structure-activity relationship and modification of HIV protease inhibitors[J].Journal of Atomic and Molecular Physics,2007,24(4):675-681.
Authors:GAO Hui  GAO Wei-na  LI Yun  WEI Dong-qing
Institution:1, Collage of Life Sciences and Bioteclmology, Shanghai Jiaotong University, Shanghai 200240, China; 2. Institute of Bioinfonnatics and Drug Discovery,Tianjin Normal University,Tianjin 300074, China
Abstract:
Keywords:QSAR
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