| 葛根素与乙酰胆碱酯酶作用的分子动力学模拟 |
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| 引用本文： | 赵奇,邓培渊,王会鱼,罗青,田云芳,王国霞,杨玉珍,李春阁,陈刚.葛根素与乙酰胆碱酯酶作用的分子动力学模拟[J].原子与分子物理学报,2022,39(6):061004-33. |
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| 作者姓名： | 赵奇 邓培渊 王会鱼 罗青 田云芳 王国霞 杨玉珍 李春阁 陈刚 |
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| 作者单位： | 郑州师范学院,郑州师范学院,郑州师范学院,郑州师范学院,郑州师范学院,郑州师范学院,郑州师范学院,郑州师范学院,郑州师范学院 |
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| 摘 要： | 旨在阐明葛根素与乙酰胆碱酯酶(AChE)的分子作用机制，并为基于葛根素的类似物的AChE抑制剂的研发提供参考.运用AutoDock 4.2进行葛根素与AChE的分子对接，采用YASARA进行分子动力学模拟，利用MMPBSA.py模块计算复合体系的结合自由能，分析氨基酸的能量贡献.结果显示，葛根素与AChE对接体系含有4个氢键，2个π-π键. 5 ns后，体系均方根偏差(RMSD)趋于平衡，体系结合自由能为-18.19 kcal/mol.促体系结合的主要作用力是范德华力、静电作用力，非溶剂化能是主要的结合阻力.能量贡献最大的残基依次为Asn533、Lys530、Ala534、Pro529.这些研究为新型抑制剂的研发提供理论参考.
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| 关 键 词： | 阿尔茨海默症 乙酰胆碱酯酶 葛根素 分子动力学 结合自由能 |
| 收稿时间： | 2021/9/2 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2021/10/26 0:00:00 |
Molecular dynamics simulation of the interactions between Puerarin and Acetylcholinesterase |
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| Zhao Qi,Deng Pei-Yuan,Wang Hui-Yu,Luo Qing,Tian Yun-Fang,Wang Guo-Xi,Yang Yu-Zhen,Li Chun-Ge and Chen Gang.Molecular dynamics simulation of the interactions between Puerarin and Acetylcholinesterase[J].Journal of Atomic and Molecular Physics,2022,39(6):061004-33. |
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| Authors: | Zhao Qi Deng Pei-Yuan Wang Hui-Yu Luo Qing Tian Yun-Fang Wang Guo-Xi Yang Yu-Zhen Li Chun-Ge and Chen Gang |
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