| 抑制剂G4G与HIV-1蛋白酶作用模式的结合自由能计算研究 |
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| 引用本文： | 伊长虹,梁志强,王伟,张少龙,张庆刚,陈建中.抑制剂G4G与HIV-1蛋白酶作用模式的结合自由能计算研究[J].原子与分子物理学报,2013,30(5):855-860. |
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| 作者姓名： | 伊长虹 梁志强 王伟 张少龙 张庆刚 陈建中 |
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| 作者单位： | 山东交通学院,山东交通学院,山东交通学院,,山东师范大学,山东交通学院 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金（11104164, 11274206和31200545）, 山东省自然科学基金(ZR2011HM048) |
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| 摘 要： | 本文采用分子动力学模拟和结合自由能计算研究了抑制剂G4G与HIV-1蛋白酶的作用机制。研究结果表明范德华作用主导了抑制剂G4G与HIV-1蛋白酶的结合。基于残基的自由能计算表明残基Gly49、Ile50、Val82、Ile84、Gly27′、Ala28′、Ile50′和Ile84′与G4G产生了较强的相互作用，同时研究也表明CH-π，CH-O相互作用和氢键是其主要的作用形式。该研究能为以HIV-1蛋白酶为靶标的抗艾滋病药物设计提供理论上的指导。
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| 关 键 词： | 分子动力学 结合自由能 HIV-1蛋白酶 |
Insight into interaction mode of inhibitor G4G with HIV-1 protease based binding free energy calculation |
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| yichanghong,and.Insight into interaction mode of inhibitor G4G with HIV-1 protease based binding free energy calculation[J].Journal of Atomic and Molecular Physics,2013,30(5):855-860. |
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| Authors: | yichanghong and |
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| Institution: | Shandong Jiaotong University,,,,, |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Molecular dynamics Binding free energy HIV-1 protease |
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