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I50V变异对HIV-1蛋白酶抑制剂Amprenavir抗药机制的分子动力学研究
引用本文:吴世亮,梁志强,王伟,伊长虹,李洪云,赵娟.I50V变异对HIV-1蛋白酶抑制剂Amprenavir抗药机制的分子动力学研究[J].原子与分子物理学报,2017,34(1):130-135.
作者姓名:吴世亮  梁志强  王伟  伊长虹  李洪云  赵娟
作者单位:山东交通学院
摘    要:HIV-1蛋白酶PR(HIV-1 protease)的变异对抑制剂产生抗药性,严重消弱抗艾滋病的治疗效果.I50V变异是HIV-1蛋白酶残基变异中最重要的一个.采用分子动力学模拟和溶解相互作用能方法SIE(solvated interaction energy)研究I50V变异对抑制剂APV(amprenavir)抗药机制.分子动力学分析表明I50V变异诱导HIV-1蛋白酶整体柔性的增加,影响了抑制剂与蛋白酶的相互作用.结合自由能计算表明范德华作用的下降驱动了I50V变异对APV的抗药性.基于残基的能量分解证明V50/V50'与APV的相互作用相对于野生型的I50/I50'明显减弱,诱导了抗药性.本研究能为高效的缓解抗药性抑制剂的研发提供一定的理论指导.

关 键 词:HIV-1蛋白酶    溶解相互作用能方法  分子动力学模拟  抗药性
收稿时间:2015/11/5 0:00:00
修稿时间:2015/12/10 0:00:00

Probing drug resistance mechanism of I50V in HIV-1 protease on inhibitor Amprenavir by using molecular dynamics simulation
Wu Shi-Liang,Liang Zhi-Qiang,Wang Wei,Yi Chang-Hong,Li Hong-Yun and Zhao Juan.Probing drug resistance mechanism of I50V in HIV-1 protease on inhibitor Amprenavir by using molecular dynamics simulation[J].Journal of Atomic and Molecular Physics,2017,34(1):130-135.
Authors:Wu Shi-Liang  Liang Zhi-Qiang  Wang Wei  Yi Chang-Hong  Li Hong-Yun and Zhao Juan
Abstract:
Keywords:HIV-1 protease  solvated interaction energy  molecular dynamics simulation  drug resistance
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