| HIV-1蛋白酶与抑制剂BEG相互作用的分子对接计算研究 |
| |
| 引用本文： | 伊长虹,梁志强,王伟,张少龙,张庆刚,陈建中.HIV-1蛋白酶与抑制剂BEG相互作用的分子对接计算研究[J].原子与分子物理学报,2014,31(6):718-723. |
| |
| 作者姓名： | 伊长虹 梁志强 王伟 张少龙 张庆刚 陈建中 |
| |
| 作者单位： | 山东交通学院理学院办公室,,,,, |
| |
| 摘 要： | 本文使用分子对接方法和MM/PBSA方法计算抑制剂BEG与HIV-1蛋白酶的结合自由能，结果表明范德华相互作用主宰了BEG与HIV-1蛋白酶的结合，同时计算还证明分子对接采用的分子力场相比于Amber力场更适合于BEG-HIV蛋白酶系统。这篇论文还采用基于残基的自由能分解方法计算了抑制剂-残基相互作用，结果表明残基Leu23、Gly49、Ile50、Val82、Ile84、Asp25′、Gly27′、Ala28′、Gly49′、Ile50′和Ile84′与BEG产生了较强的相互作用，同时也证明CH-π和CH-O相互作用驱动了抑制剂BEG与HIV-1蛋白酶的结合。我们期望这个研究能为艾滋病治疗药物的合理化设计提供理论上的指导和实验上的参考。
|
| 关 键 词： | 分子动力学 结合自由能 HIV-1蛋白酶 分子对接方法 |
Insight into interaction mode of HIV-1 protease with inhibitor BEG based molecular docking method |
| |
| Institution: | Shandong Jiaotong University,,,,, |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | Molecular dynamics Binding free energy HIV-1 protease Molecular docking method |
|
| 点击此处可从《原子与分子物理学报》浏览原始摘要信息 |
| 点击此处可从《原子与分子物理学报》下载免费的PDF全文 |
|
