| HIV-1 蛋白酶与抑制剂3G3相互作用机制的分子动力学研究 |
| |
| 引用本文： | 伊长虹,梁志强,王伟,尹妍妍,李洪云,陈建中.HIV-1 蛋白酶与抑制剂3G3相互作用机制的分子动力学研究[J].原子与分子物理学报,2013,30(6):994-1001. |
| |
| 作者姓名： | 伊长虹 梁志强 王伟 尹妍妍 李洪云 陈建中 |
| |
| 作者单位： | 山东交通学院,山东交通学院,山东交通学院,山东交通学院,山东交通学院,山东交通学院 |
| |
| 基金项目： | 山东省自然科学基金（ZR2011HM048）；山东交通学院博士基金和自然科学基金 |
| |
| 摘 要： | HIV-1蛋白酶已经成为艾滋病治疗药物设计的重要靶标。本文采用分子动力学模拟和MM-PB/SA方法计算了抑制剂3G3与HIV-1蛋白酶的结合自由能，结果表明范德华作用驱动了3G3与蛋白酶的结合。同时也采用了基于残基的自由能分解方法计算了抑制剂-残基相互作用，结果证明残基Ala28，Val32/Val32′，Ile47，Gly49，Ile50/Ile50′，Ile84/Ile84′和Pro81′ 能与蛋白酶产生较为强烈的相互作用，同时也表明CH-π，π-π和 CH-O相互作用控制了3G3与蛋白酶的结合。我们期望这个研究能为抗艾滋病的药物设计提供理论上的指导。
|
| 关 键 词： | 子动力学模拟 MM-PB/SA方法 抑制剂-残基相互作用 HIV-1蛋白酶 |
| 收稿时间： | 11/6/2012 7:15:24 PM |
A Computational Insight into Interaction of Inhibitor 3G3 with HIV-1 Protease Based on Molecular Dynamics Simulation |
| |
| yichanghong,and chengjianzhong.A Computational Insight into Interaction of Inhibitor 3G3 with HIV-1 Protease Based on Molecular Dynamics Simulation[J].Journal of Atomic and Molecular Physics,2013,30(6):994-1001. |
| |
| Authors: | yichanghong and chengjianzhong |
| |
| Institution: | Shandong Jiaotong University,liangzhiqiang,Shandong Jiaotong University,Shandong Jiaotong University,Shandong Jiaotong University, |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | molecular dynamics simulation MM-PB/SA method inhibitor-residue interaction HIV-1 protease |
|
| 点击此处可从《原子与分子物理学报》浏览原始摘要信息 |
| 点击此处可从《原子与分子物理学报》下载免费的PDF全文 |
