蛋白质分子电子结构的第一性原理从头计算 |
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引用本文: | 郑浩平.蛋白质分子电子结构的第一性原理从头计算[J].物理学进展,2011,20(3):291-300. |
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作者姓名: | 郑浩平 |
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作者单位: | 同济大学玻耳固体物理研究所 上海 200092 |
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摘 要: | 蛋白质分子电子结构的计算对生命科学和计算机药物设计有重要的科学意义和应用价值 ,但对计算方法和计算机也是巨大的挑战。团簇埋入自洽计算法是近年来发展起来的“第一性原理”、从头计算法。它采用局域化无相互作用单电子模型 ,结合“分块 合拢”技术 ,使计算量大大减少。最近 ,应用该方法 ,对一个真实蛋白质分子 (南瓜种子中的胰蛋白酶抑止因子CMTI I)电子结构的首次“第一性原理”、全电子、全势场、从头计算获得成功。表明生物大分子电子结构的计算在现有计算机条件下已成为现实 ,使从本质上揭开生命奥秘成为可能。本文介绍了上述计算的基本理论、方法和结果。
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关 键 词: | 蛋白质分子 电子结构 团簇埋入自洽计算法 |
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