与金精三羧酸抑制剂的相互作用 |
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引用本文: | 宋伟,陈慰祖,张小轶,王存新.与金精三羧酸抑制剂的相互作用[J].化学物理学报,2003,16(4):257-260. |
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作者姓名: | 宋伟 陈慰祖 张小轶 王存新 |
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作者单位: | 北京工业大学生命科学与生物工程学院,北京100022 |
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摘 要: | 用分子对接方法(Docking)研究了HIV-1整合酶与其抑制剂金精三羧酸的结合过程.为弄清金属离子在结合中所起的作用,选择含有一个Mg+2或不含Mg+2的两种不同的整合酶受体分别与金精三羧酸对接.结果表明,Mg+2对稳定配体与受体的结合起了重要作用.金精三羧酸配体与含有一个金属Mg+2的整合酶受体对接,最优结合自由能为-45.19kJ/mol.当Mg+2失去后,整合酶的活性中心构象将发生变化,使金精三羧酸抑制剂与整合酶的结合自由能(-24.35kJ/mol)明显增加.预测了未知的HIV-1整合酶与其抑制剂金精三羧酸的复合物结构,并可对基于结构的抗HIV-1整合酶的药物设计提供重要信息.
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关 键 词: | HIV-1整合酶 金精三羧酸 结合自由能 分子对接 |
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