| 蛋白质空间结构预测的一种优化模型及算法 |
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| 引用本文： | 靳利霞,唐焕文.蛋白质空间结构预测的一种优化模型及算法[J].应用数学与计算数学学报,2000,14(2):33-41. |
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| 作者姓名： | 靳利霞 唐焕文 |
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| 作者单位： | 大连理工大学管理科学与工程研究所,大连,116023 |
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| 摘 要： | 用理论方法预测蛋白质结构有两个难点，第一是要有一个合理的势函数，第二是要有一个有效的寻优方法找到势函数的全局极小点，本文采用联合残基力场建立了蛋白质空间结构预测模型，然后用我们给出的一种改进模拟退火算法搜索势函数的全局极小点，对脑啡肽的空间结构进行了预测和分析。
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| 关 键 词： | 蛋白质 空间结构 预测 势函数 联合残基力场 改进模拟退火算法 脑啡肽 分子生物学 |
| 修稿时间： | 2000年4月29日 |
An Optimization Model and An Algorithm for Prediction of Protein 3-D Structure |
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| LIXIA JIN,HUANWEN TANG.An Optimization Model and An Algorithm for Prediction of Protein 3-D Structure[J].Communication on Applied Mathematics and Computation,2000,14(2):33-41. |
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| Authors: | LIXIA JIN HUANWEN TANG |
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| Abstract: | Difficulties to predict protein 3-D structure with the theoretical method arise from two factors: how to create a reasonable potential function, and how to find an effective optimization method to search for the global minimum of potential function. With Unite-residue force filed, a protein 3-D structure prediction model is described, and an improved simulated annealing algorithm is presented to search for the global minimum-energy conformation. The 3-D structure of Met-enkephalin is predicted and analyzed. |
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| Keywords: | protein structure prediction optimization model United-residue force field simulated annealing algorithm |
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