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应用结构异质性阈值模型定位阈值性状基因位点:Ⅱ仿真研究
引用本文:饶绍奇,张庆普,李霞,郭政.应用结构异质性阈值模型定位阈值性状基因位点:Ⅱ仿真研究[J].应用数学,2001,14(2):125-132.
作者姓名:饶绍奇  张庆普  李霞  郭政
作者单位:1. 凯斯西部储备大学,流行病学与生物统计系,
2. 哈尔滨工业大学,
3. 哈尔滨医科大学,
基金项目:National Center for Human Genome Research (HG01577U. S) and National Science and Technology ofCommittee of China(39970397).
摘    要:蒙特卡罗仿真研究表明对处理在基因定位阈值性状中出现的超离中趋势现象(结构异质性),我们提出的结构异质性模型是一个高效的统计方法.它表现在高效率的统计检验、准确的参数估计和基因定位等方面.病态或奇异费歇信息矩阵是在基因连锁定位分析中的一个突出的算法问题,仿真数据显示它们的发生率可以达到28%.我们提出的应用奇异根分解方法可以有效地解决这一算法问题.对比常规阈值模型,结构异质性阈值模型有较高的算法稳定性.

关 键 词:蒙特卡罗  结构异质性  奇异性  算法  阈值性状
文章编号:1001-9847(2001)02-0125-08
修稿时间:2000年11月3日

Mapping Quantitative Trait Loci of Ordinal Traits Using a Structural HeteroskedasticThreshold Model:
Abstract:Monte Carlo simulation studies indicate that the newly developed structuralheteroskedastic threshold model, with an aim at handling overdispersion problem in QTL mapping ofordinal traits, is an efficient statistical method in terms of power and genetic parameter estimationunder various designs. The incidence of ill-condition or singularity of the Fisher information matrix ina genome scan of linkage is high (up to 28%), suggesting that a more robust numerical algorithm(e. g. , singular value decomposition used in this study) is required to handle numerical problems inthe implement of a generalized linear model in genetic mapping.
Keywords:
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