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| 基于细胞系-药物K近邻的抗癌药物敏感性预测 | |
| 作者单位： | ;1.燕山大学理学院;2.河北数港科技有限公司 |
| 摘 要： | 抗癌药物敏感性数据的缺失会对后续癌症数据分析产生重要影响.高通量测序技术为构建计算模型,有效预测抗癌药物敏感性提供了可能.依据已有的合理性假设:相似的细胞系对于目标药物具有相似的反应;相似的药物对于目标细胞系具有相似的反应,本文综合考虑了细胞系的基因表达和基因突变特征,给出细胞系相似性新的定义形式,结合药物相似性度量方法,提出了"细胞系-药物K近邻"计算模型,并将其成功应用于癌症细胞系百科全书(CCLE),得到的抗癌药物敏感性预测结果明显优于已有的经典模型. |
| 关 键 词： | 抗癌药物敏感性 细胞系相似性 药物相似性 K近邻 |
Prediction of Anti-cancer Drug Sensitivity based on Cell Line-drug K Nearest Neighbors |
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