| 外显子周期性探究及自适应识别快速算法研究 |
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| 引用本文： | 佟庆英,熊小峰,刘松华.外显子周期性探究及自适应识别快速算法研究[J].数学的实践与认识,2015(4):204-212. |
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| 作者姓名： | 佟庆英 熊小峰 刘松华 |
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| 作者单位： | 江西理工大学理学院 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(11461032,11401267) |
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| 摘 要： | 外显子的3-周期性已被广泛的应用到基因识别中,而通过大量的实验表明并不是所有的已知外显子都表现出3-周期性,探究不同变换下外显子3-周期性的表现,得到自相关傅里叶变换可以增强外显子的3-周期性质;同时研究了不同数值映射之间在计算平均功率谱,N/3处功率谱和信噪比的关联,通过理论推导得到关联结果,进行仿真实验,并且结合Voss映射下的快速算法提出Z-curve映射下的快速算法,模拟不同DNA序列分别按照Z-curve映射下原始计算方法和快速算法计算相应的公式,实验结果证明快速算法的有效性和快速性,最后给出自适应窗口平移法识别外显子,利用评价指标,证明算法的实用性和可行性.
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| 关 键 词： | 频谱3-周期性 功率谱 外显子 快速算法 数值映射 |
Study on Fast Algorithm of Different Numerical Mapping for A DNA Squence |
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| TONG Qing-ying;XIONG Xiao-feng;LIU Song-hua.Study on Fast Algorithm of Different Numerical Mapping for A DNA Squence[J].Mathematics in Practice and Theory,2015(4):204-212. |
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| Authors: | TONG Qing-ying;XIONG Xiao-feng;LIU Song-hua |
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| Institution: | TONG Qing-ying;XIONG Xiao-feng;LIU Song-hua;College of Science,Jiang Xi University of Science and Technology; |
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