基于三维分子描述符的埃坡霉素类衍生物抗癌活性预测 |
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引用本文: | 谈宁馨,李娟琴,李泽荣,李象远.基于三维分子描述符的埃坡霉素类衍生物抗癌活性预测[J].物理化学学报,2006,22(4):397-402. |
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作者姓名: | 谈宁馨 李娟琴 李泽荣 李象远 |
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作者单位: | College of Chemical Engineering; College of Chemistry, Sichuan University, Chengdu 610065, P. R. China |
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摘 要: | 为预测埃坡霉素类衍生物的抗癌活性, 定义了一套表征分子形状的描述符, 即K阶形状参数, 并计算了67个表征分子的电子、拓扑和几何结构的分子描述符. 描述符经遗传算法筛选, 用于建立基于支持向量学习机(SVM)的抗癌活性分类模型; 用留一法和5重交叉验证法对SVM模型参数进行了优化. 结果表明模型具有较高的预测性且两种方法得到相近结果, 交叉验证的预测正确率达80.6%; 经筛选后的描述符有30个, 其中含有5个K阶形状参数, 这些描述符对埃坡霉素类衍生物的抗癌活性的模型建立具有比较重要的作用.
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关 键 词: | 支持向量学习机 埃坡霉素 分子描述符 K阶形状参数 |
收稿时间: | 2005-08-03 |
修稿时间: | 2005-11-10 |
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