基于k字位置序列的蛋白质序列分析方法及其应用 |
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作者单位: | ;1.西北农林科技大学理学院;2.西北农林科技大学信息工程学院 |
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摘 要: | 基于蛋白质序列的κ-字位置序列,利用标准化的κ-字区间平均距离和改进的标准化的κ-字区间平均距离的方法作为蛋白质序列的数字特征,并给出了比较蛋白质序列相似性的方法.最后,运用这两种方法分析了9个物种的ND5蛋白质序列和8个物种的ND6蛋白质序列的相似性,并利用交叉验证得出基于改进的标准化的κ-字区间平均距离的方法的准确度比基于标准化的κ-字区间平均距离的方法的准确度高.
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关 键 词: | 序列非比对分析 遗传距离矩阵 k-字 蛋白质序列 |
Based on k-word Position Sequence Analysis Methods of Protein Sequence and Application |
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