| 鲍曼不动杆菌LpxC的同源模建及分子对接 |
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| 引用本文： | 左柯,胡建平,杜文义,刘嵬,梁立,苟小军.鲍曼不动杆菌LpxC的同源模建及分子对接[J].分子科学学报,2017,33(1). |
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| 作者姓名： | 左柯 胡建平 杜文义 刘嵬 梁立 苟小军 |
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| 作者单位： | 1. 成都大学四川抗菌素工业研究所,药食同源植物资源开发四川省高校重点实验室,四川成都610106;2. 成都大学四川抗菌素工业研究所,药食同源植物资源开发四川省高校重点实验室,四川成都610106;乐山师范学院化学学院,四川乐山614004 |
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| 摘 要： | 鲍曼不动杆菌已成为最普遍的医院致病菌,且耐药情况严峻.LpxC作为新抗菌药物靶点被大量研究,但鲍曼不动杆菌LpxC晶体尚未解析得到,基于其结构的药物设计等工作无法开展.以铜绿假单胞菌LpxC晶体结构为模板,通过同源模建方法获得鲍曼不动杆菌LpxC结构模型.较好的Ramachandran plot分布和Profile-3D结果验证了模型的合理性.用分子动力学模拟优化鲍曼不动杆菌LpxC模型,修补部分不合理构象.后续分子对接结果显示S构型的苄氧乙酰基羟肟酸类抑制剂比R构型分子能更有效地结合在F191,H237和K238组成的较浅口袋中,这可能是S构型抑制剂活性更高的主要因素,模拟结果与实验数据吻合较好.
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| 关 键 词： | 鲍曼不动杆菌 LpxC 同源模建 分子对接 分子动力学模拟 |
Homology modeling and molecular docking of Acinetobacter baumannii LpxC |
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| ZUO Ke,HU Jian-ping,DU Wen-yi,LIU Wei,LIANG Li,GOU Xiao-jun.Homology modeling and molecular docking of Acinetobacter baumannii LpxC[J].Journal of Molecular Science,2017,33(1). |
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| Authors: | ZUO Ke HU Jian-ping DU Wen-yi LIU Wei LIANG Li GOU Xiao-jun |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Acinetobacter baumannii LpxC homology modeling molecular docking molecular dynamics simulation |
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