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基于逐步非线性回归的血管紧张素转化酶抑制肽QSAR建模
引用本文:周恒,巴庆芳,袁哲明,代志军.基于逐步非线性回归的血管紧张素转化酶抑制肽QSAR建模[J].化学通报,2022,85(6):736-745.
作者姓名:周恒  巴庆芳  袁哲明  代志军
作者单位:湖南农业大学,湖南农业大学,湖南农业大学,湖南农业大学
基金项目:国家自然科学基金(No. 31701164), 湖南省自然科学基金(No. 2018JJ3238), 湖南省教育厅科学研究项目(No. 18C0171)
摘    要:线性特征选择方法可提升定量构效关系(QSAR)模型的预测能力,但易忽略特征(理化属性)与分子活性间的非线性关系。本文提出基于支持向量回归(SVR)的逐步非线性回归(SSNR)特征选择算法并用于降血压药物血管紧张素转化酶(ACE)抑制肽的QSAR研究。首先以具有不同背景的5组分子描述符分别表征肽序列,以SSNR实施特征选择,再通过智能一致性模型(ICM)对各组描述符对应子模型的预测活性进行加权整合,获得最终活性预测值。在ACE抑制二肽与三肽两个数据上的应用结果表明,SSNR获得的特征子集结合ICM策略可有效提升模型预测能力(二肽的平均Q■为0.675±0.002,三肽为0.663±0.013),优于遗传算法-偏最小二乘(0.538±0.049、0.599±0.047)与逐步线性回归(0.583±0.041、0.675±0.010)。最后基于抑制活性已知肽序列预测所有活性未知肽的活性,分析了高活性肽及其氨基酸偏好性,为人工合成潜在高活性ACE抑制肽提供可能的序列组合。

关 键 词:定量构效关系  特征选择  支持向量机  逐步非线性回归  血管紧张素转化酶抑制肽
收稿时间:2021/9/30 0:00:00
修稿时间:2021/11/4 0:00:00

QSAR Modeling on Angiotensin-Converting Enzyme Inhibitory Peptides Based on Stepwise Non-linear Regression
zhou heng,ba qing fang,yuan zhe ming and dai zhi jun.QSAR Modeling on Angiotensin-Converting Enzyme Inhibitory Peptides Based on Stepwise Non-linear Regression[J].Chemistry,2022,85(6):736-745.
Authors:zhou heng  ba qing fang  yuan zhe ming and dai zhi jun
Institution:Hunan Agricultural University,Hunan Agricultural University,Hunan Agricultural University,Hunan Agricultural University
Abstract:
Keywords:quantitative structure-activity relationship  feature selection  support vector machine  stepwise non-linear regression  angiotensin-converting enzyme inhibitory peptide
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