虚拟原子探针随机采样法用于氨基酸结构描述及其构效关系研究 |
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引用本文: | 周原,梅虎,杨力,周鹏,杨善彬,李志良.虚拟原子探针随机采样法用于氨基酸结构描述及其构效关系研究[J].高等学校化学学报,2007,28(7):1263-1266. |
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作者姓名: | 周原 梅虎 杨力 周鹏 杨善彬 李志良 |
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作者单位: | 1. 湖南工程学院化学化工系,湘潭,411101;重庆大学生物工程学院,重庆,400044;湖南大学化学生物传感与计量学国家重点实验室,长沙,410012 2. 重庆大学化学化工学院生物工程学院,重庆,400044;重庆大学生物工程学院,重庆,400044 3. 重庆大学生物工程学院,重庆,400044 4. 重庆大学化学化工学院,重庆,400044 5. 重庆大学生物工程学院,重庆,400044;湖南大学化学生物传感与计量学国家重点实验室,长沙,410012 6. 重庆大学化学化工学院生物工程学院,重庆,400044;重庆大学生物工程学院,重庆,400044;湖南大学化学生物传感与计量学国家重点实验室,长沙,410012 |
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基金项目: | 国家高技术研究发展计划(863计划)
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生物力学与组织修复工程创新引智基地(国家111计划)项目
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重庆市应用基础研究基金
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国家重点实验室基金 |
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摘 要: | 考虑药物与蛋白质受体的3类非键作用模式, 利用8类虚拟原子探针和Monte Carlo随机采样技术, 得到了一套新的氨基酸侧链表面静电、立体及疏水势能场(ASSPF)参数. 在此基础上对苦味二肽和血管舒缓激五肽进行了结构表征和QSAR研究, 所建模型复相关系数R2和留一法交互检验复相关系数QLOOCV2分别为0.8457, 0.851和0.7688, 0.7952, 同时分析了肽链不同位置上氨基酸侧链对活性的影响, 取得较好的结果.
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关 键 词: | 虚拟原子探针 分子表面随机采样法 氨基酸侧链表面势能场描述子 苦味二肽 血管舒缓激五肽 定量构效关系 |
文章编号: | 0251-0790(2007)07-1263-04 |
收稿时间: | 2006-07-11 |
修稿时间: | 2006-07-11 |
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