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虚拟原子探针随机采样法用于氨基酸结构描述及其构效关系研究
引用本文:周原,梅虎,杨力,周鹏,杨善彬,李志良.虚拟原子探针随机采样法用于氨基酸结构描述及其构效关系研究[J].高等学校化学学报,2007,28(7):1263-1266.
作者姓名:周原  梅虎  杨力  周鹏  杨善彬  李志良
作者单位:1. 湖南工程学院化学化工系,湘潭,411101;重庆大学生物工程学院,重庆,400044;湖南大学化学生物传感与计量学国家重点实验室,长沙,410012
2. 重庆大学化学化工学院生物工程学院,重庆,400044;重庆大学生物工程学院,重庆,400044
3. 重庆大学生物工程学院,重庆,400044
4. 重庆大学化学化工学院,重庆,400044
5. 重庆大学生物工程学院,重庆,400044;湖南大学化学生物传感与计量学国家重点实验室,长沙,410012
6. 重庆大学化学化工学院生物工程学院,重庆,400044;重庆大学生物工程学院,重庆,400044;湖南大学化学生物传感与计量学国家重点实验室,长沙,410012
基金项目:国家高技术研究发展计划(863计划) , 生物力学与组织修复工程创新引智基地(国家111计划)项目 , 重庆市应用基础研究基金 , 国家重点实验室基金
摘    要:考虑药物与蛋白质受体的3类非键作用模式, 利用8类虚拟原子探针和Monte Carlo随机采样技术, 得到了一套新的氨基酸侧链表面静电、立体及疏水势能场(ASSPF)参数. 在此基础上对苦味二肽和血管舒缓激五肽进行了结构表征和QSAR研究, 所建模型复相关系数R2和留一法交互检验复相关系数QLOOCV2分别为0.8457, 0.851和0.7688, 0.7952, 同时分析了肽链不同位置上氨基酸侧链对活性的影响, 取得较好的结果.

关 键 词:虚拟原子探针  分子表面随机采样法  氨基酸侧链表面势能场描述子  苦味二肽  血管舒缓激五肽  定量构效关系
文章编号:0251-0790(2007)07-1263-04
收稿时间:2006-07-11
修稿时间:2006-07-11
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