变性高效液相色谱法在α-血红蛋白稳定蛋白基因检测中的应用 |
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引用本文: | 王志鹏.变性高效液相色谱法在α-血红蛋白稳定蛋白基因检测中的应用[J].色谱,2011,29(4):335-341. |
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作者姓名: | 王志鹏 |
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作者单位: | 暨南大学医学院微生物与免疫学教研室, 广东 广州 510632 |
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摘 要: | 建立了采用变性高效液相色谱(DHPLC)对α-血红蛋白稳定蛋白(AHSP)基因进行基因分型和突变筛查的新方法。将AHSP基因序列分成6个片段,因第一、二、四、六个片段均含有1~2个常见单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)位点,需单个标本分别进行检测;第三、五个片段不含有常见SNP位点,采用DHPLC结合DNA(脱氧核糖核酸)池的方法进行检测。以基因测序为金标准对所建立的AHSP基因检测方法进行方法学评价,结果显示: 40个样品的DHPLC检测结果与测序结果之间完全吻合,说明所建立的检测方法能对AHSP基因6种常见SNP进行准确基因分型。应用DHPLC对365个样品的AHSP基因进行检测,发现2个罕见SNP(11810 G>A和12802 C>T);同时还发现2个错义突变(AHSP D29V和AHSP V56G), AHSP D29V突变为新突变,AHSP V56G为罕见突变。结果表明采用DHPLC法可有效地对AHSP基因进行基因分型和突变筛查。
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关 键 词: | 变性高效液相色谱 α-血红蛋白稳定蛋白基因 基因分型 突变筛查 |
收稿时间: | 2011-01-05 |
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