碱基与氮甲基乙酰胺相互作用的从头算和ABEEMσπ研究 |
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作者姓名: | 霍红洁 赵东霞 杨忠志 |
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作者单位: | 辽宁师范大学化学化工学院,大连,116029 |
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基金项目: | 国家自然科学基金,辽宁省创新团队项目基金 |
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摘 要: | ![]() 选取氮甲基乙酰胺(N-Methylacetamide,NMA)和DNA碱基为研究对象,应用ABEEMσπ/MM方法研究了NMA与碱基之间形成的二聚体的几何构型、电荷分布及结合能等性质,并进行了相应的从头算(abinitio)MP2水平研究,在B3LYP/6-311 ++G(d,p)水平下对结构进行了优化.将2种方法的研究结果进行比较发现,所获得的构型、电荷及结合能之间具有很好的一致性,NMA与DNA碱基相互作用的强度大小依次为:鸟嘌呤>胸腺嘧啶>胞嘧啶>腺嘌呤,且证明了ABEEMσπ/MM模型的参数具有很好的可转移性.
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关 键 词: | 氮甲基乙酰胺(NMA) 碱基 从头算(ab initio)MP2 ABEEMσπ/MM 几何结构 结合能 |
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