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免疫相关EST-SSRs标记筛选及其在大菱鲆异源雌核发育子代遗传分析中的应用
引用本文:刘滨,雷齐霖,刘新富,孟振,丁福红,李振静.免疫相关EST-SSRs标记筛选及其在大菱鲆异源雌核发育子代遗传分析中的应用[J].武汉大学学报(理学版),2010,56(3).
作者姓名:刘滨  雷齐霖  刘新富  孟振  丁福红  李振静
作者单位:1. 中国水产科学研究院黄海水产研究所/青岛市海水鱼类种子工程与生物技术重点实验室,山东青岛,266071
2. 中国海洋大学海洋生命学院,山东青岛,266003
基金项目:农业部农业公益性行业科研专项经费项目,现代农业产业技术体系建设专项资金共同资助项目
摘    要:本研究对大菱鲆EST数据库中12 434条序列进行微卫星搜索,共搜索出831条EST-SSR序列,其中l6条为明确标注免疫相关功能的基因序列.根据此l6条EST-SSR序列设计引物,经过PCR扩增检测和反应条件的优化,最终筛选出9对扩增效果理想的EST-SSR标记对大菱鲆减数分裂雌核发育二倍体子代进行遗传变异检测,结果表明:在Scoph-2-1、Scoph-7-1、Scoph-10-1微卫星位点上大菱鲆亲本和雌核发育二倍体子代均为纯合基因型,其余6个微卫星位点(Psetta-1-1、Psetta-1-2、Psetta-3-1、Psetta-3-2、Scoph-4-1、Scoph-6-1)在大菱鲆雌核发育二倍体仔鱼群体中的观测杂合度≥0.700,期望杂合度0.460,平均期望杂合度为0.503.大菱鲆减数分裂雌核发育二倍体还显示出较高的重组率,平均重组率为89%;综合上述结果推断,9个免疫相关EST-SSRs标记可有效地用于分析大菱鲆减数分裂雌核发育二倍体子代的遗传变异;6个位点的重组率计算结果能够为今后对大菱鲆的着丝粒进行精确定位提供依据.

关 键 词:大菱鲆  EST-SSRs  雌核发育  遗传分析

Application of Immune Related EST-SSR Markers in Hereditary Analysis on Gynogentic Filial Generation of Turbot Scophthalmus maximus
LIU Bin,LEI Jilin,LIU Xinfu,MENG Zhen,DING Fuhong,LI Zhenjing.Application of Immune Related EST-SSR Markers in Hereditary Analysis on Gynogentic Filial Generation of Turbot Scophthalmus maximus[J].JOurnal of Wuhan University:Natural Science Edition,2010,56(3).
Authors:LIU Bin  LEI Jilin  LIU Xinfu  MENG Zhen  DING Fuhong  LI Zhenjing
Abstract:
Keywords:
本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录!
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