| 计算受体和配体结合自由能的新方法 |
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| 引用本文： | 于玲,杨忠志.计算受体和配体结合自由能的新方法[J].分子科学学报,2010,26(5). |
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| 作者姓名： | 于玲 杨忠志 |
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| 作者单位： | 辽宁师范大学化学化工学院,辽宁大连,116029 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目(20633050,20873055,20703022) |
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| 摘 要： | 利用ABEEMσπ浮动电荷力场与连续介质模型相结合的方法,计算了受体和配体的结合自由能.将结合自由能分解为真空中的力场作用项、溶剂化能量以及熵效应.由于ABEEMσπ/MM方法充分考虑了外界环境发生变化引起的体系中各个位点之间的电荷极化,因而极大地提高了结合自由能的计算精度.利用该方法计算的2个复合物的结合自由能与实验值的偏差均小于0.5kJ/mol.
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| 关 键 词： | 浮动电荷力场方法 连续介质模型 结合自由能 受体和配体 |
A new method for calculating binding free energies of receptor and ligand |
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| YU Ling,YANG Zhong-zhi.A new method for calculating binding free energies of receptor and ligand[J].Journal of Molecular Science,2010,26(5). |
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| Authors: | YU Ling YANG Zhong-zhi |
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| Institution: | YU Ling,YANG Zhong-zhi(School of Chemistry and Chemical Engineering,Liaoning Normal University,Dalian 116029,China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | fluctuating charge model continuum solvent model binding free energy receptor and ligand |
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