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| 三种烟草品种基因组DNA傅里叶红外光谱研究 | |
| 引用本文： | 邱璐,杨海艳,杨春胜,刘鹏,范树国,刘仁明,周林宗.三种烟草品种基因组DNA傅里叶红外光谱研究[J].光谱学与光谱分析,2014,34(4):967-971. |
| 作者姓名： | 邱璐 杨海艳 杨春胜 刘鹏 范树国 刘仁明 周林宗 |
| 作者单位： | 邱璐:楚雄师范学院化学与生命科学系, 云南 楚雄 675000 杨海艳:楚雄师范学院化学与生命科学系, 云南 楚雄 675000 杨春胜:楚雄师范学院化学与生命科学系, 云南 楚雄 675000 刘鹏:楚雄师范学院数学系, 云南 楚雄 675000 范树国:楚雄师范学院化学与生命科学系, 云南 楚雄 675000 刘仁明:楚雄师范学院电子与物理科学系, 云南 楚雄 675000 周林宗:楚雄师范学院地理系, 云南 楚雄 675000 |
| 基金项目： | 云南省重点建设学科项目(05YJJSXK03), 云南省高校科技创新团队项目(IRTSTYN), 云南省高校应用生物学重点实验室项目, 国家自然科学基金项目(11064001)资助 |
| 摘 要： | 利用傅里叶红外光谱(FTIR)研究三种烟草品种DNA的差异,旨在对烟草品种进行亲缘关系分析和品种鉴定。研究结果显示,三种烟草品种DNA红外光谱较为相似,均有四个明显的特征峰,1 103 cm~(-1)是DNA磷酸二酯键的对称伸缩振动,1 236 cm~(-1)是DNA磷酸二酯键的非对称伸缩振动,1 400 cm~(-1)是DNA糖苷键的伸缩振动,I 622 cm~(-1)是DNA中是胞嘧啶C4—C5=C6的环伸缩振动。通过平滑、标准化处理、二阶求导、提取主成分和系统聚类分析建立了DNA FTIR光谱数据聚类分析模型。使用该模型对三个烟草品种进行鉴定,鉴定正确率为100%。使用该模型对三个烟草品种进行亲缘关系分析,云烟87与K326聚为一类,距离系数为0.003,DNA相似度为99.7%,红大单独聚为一类。聚类正确率达100%。该项研究为烟草品种鉴定及遗传育种提供了参考。 |
| 关 键 词： | 傅里叶红外光谱(FTIR) 烟草 基因组DNA 主成分分析 系统聚类 亲缘关系 |
| 收稿时间： | 2013/9/16 |
Study on DNA Fourier Infrared Spectroscopy of Three Kinds of Nicotiana Tabacum L. |
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| Abstract: | |
| Keywords: | Fourier infrared spectrum Nicotiana tabacum L Genomic DNA Principal component analysis Hierarchical cluster analysis Genitic elationship |
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